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第四章 利用丙氨酸掃描法對豌豆和阿拉伯芥的 氧化鯊烯環化酵素假設活

4.2 丙氨酸掃描之結果與討論

4.2.5 AthCAS 突變株結果分析與討論

《圖 4-8》顯示當以環阿屯醇為受質時,其假設活性區內的十四個氨基 酸的相對位置,這些氨基酸大多分布在 C、D 環或是受質側鏈附近,有些甚 至是屬於第二層的氨基酸。在 AthCAS 假設活性區的單定點突變中,

CASH257A 會 產 生微 量 的 parkeol, 而 CASY118A、 CASL124A、 CASW221A

CASM254A 和 CASP367A 五個定點突變則會使酵素失活,其餘剩下的的六個突

變株仍都保有野生型的 AthCAS 環化功能,生成環阿屯醇。

《圖 4-8》野生型 AthCAS 十四個活性區氨基酸結構模擬圖

比對 AthCAS 與氧化鯊烯-羊毛硬脂醇環化酵素的序列,發現二者的胺 基酸保留性高,活性區對應的胺基酸大部分為相同的氨基酸,只有在

CASLue124、CASThr215、CASMet254 其對應的氨基酸在官能基特性上有明顯差

異,故此,猜測這三個殘基位置及其鄰近的氨基酸可能是造成終止反應脫 氫位置不同的重要決定位置。但經丙氨酸突變後,我們發現 CAST215A 對酵 素活性並無影響,而 CASL124A、CASM254A 會使酵素失去活性,另外由其結

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構模擬圖如《圖 4-9》顯示,當 Leu124 突變成 Ala 後,會影響 Phe123 和 Trp221 的位置,並且產生角度上的改變,也使 Glu165 和 Lue166 有明顯 的偏移;而 Met254 突變後,經由主鏈的改變會影響其鄰近 Trp255 的位 置,使其向活性區內位移,除此之外,鄰近的 Tyr262、Tyr557、Pro558 和 Tyr557 等氨基酸也都有微幅不小的變動。故此推論,這些活性區氨基酸因 自身殘基在空間上的改變,會影響其鄰近氨基酸在空間角度或位置上改變,

而影響原本酵素活性。此外,在 CASY118A、CASY221A 和 CASP367A 的模擬 結構圖中,我們也看到有類似的效應:CASY118A 影響 Tyr410、Trp416、

Phe726 和 Phe123,CASY221A 則影響 Phe123、Trp217、Tyr262 和 Pro264,

以及 CASP367A 影響 Phe123、Leu124、Tyr118 等等。或許因為所突變的氨 基酸位於活性區內,所以只要做單點突變,尌會影響到其它同樣位在活性 區中鄰近的芳香族氨基酸,而這些芳香族基團又是在環化過程中穩定高能 中間物所不可或缺的,因此才會造成酵素失去原本活性。

此外,我們只有在 CASH257A 觀察到非環阿屯產物,其之所以產生 parkeol,可能是因為當 His 突變成殘基較小的 Ala 後,會使得受質的 C 環浮動的空間增加,且經由結構模擬發現,在此突變株中 Phe726 苯環的 位置會偏折到 C11 位置附近,如《圖 4-9 F》所示,因此我們認為其可經 由環上π 電子來穩定 C9 與 C11 上過渡態的碳陽離子,使其最終在此脫氫 而生成 parkeol。另外,我們認為 pRS313 CAS 和 pRS314 PSY 有相同的 問題,因為其皆為植物基因而非酵母菌基因,所以用酵母菌表現時,表現 量不如酵母菌本身基因 ERG7,因此對於新產物的生成難以觀測。

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《圖 4-9》A. 突變株 AthCASY118A(綠色)與野生型 AthCAS(藍色)之空間比較;

B. 突變株 AthCASL124A(黃色)與野生型 AthCAS(藍色)之空間比較;

C. 突變株 AthCASW221A(桃色)與野生型 AthCAS(藍色)之空間比較;

D. 突變株 AthCASM254A(灰色)與野生型 AthCAS(藍色)之空間比較;

E. 突變株 AthCASP367A(橘色)與野生型 AthCAS(藍色)之空間比較;

F. 突變株 AthCASH257A(紫色)與野生型 AthCAS(藍色)之空間比較

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