行政院國家科學委員會專題研究計畫 期中進度報告
森林土壤有機物分解、微生物生態、養分流動和土壤微生物
基因體之研究(2/3)
計畫類別: 整合型計畫 計畫編號: NSC92-2621-B-002-003- 執行期間: 92 年 08 月 01 日至 93 年 07 月 31 日 執行單位: 國立臺灣大學生化科技學系 計畫主持人: 楊盛行 報告類型: 精簡報告 處理方式: 本計畫可公開查詢中 華 民 國 93 年 5 月 26 日
全球變全球變遷-塔塔加高山生態系長期生態研究-
森林土壤有機物分解、微生物生態、養分流動和
土壤微生物基因體之研究(2/3)
NSC92-2621-B002-007
楊盛行
國立台灣大學生化科技學系及微生物與生化學研究所
國立屏東科技大學生物科技研究所
摘 要
本研究為探討不同海拔森林土壤微生物生態及微生物於森林土壤有機物分 解和養分流動所擔任的角色,選定高海拔塔塔加森林區和低海拔福山森林區,測 定溫度及日照等環境條件,水分含量、pH值、總有機碳、總氮、C/N比和灰分等 土壤性質,總菌、放線菌、真菌、纖維素分解菌、溶磷菌和固氮菌含量、微生物 生質碳、微生物生質氮含量、萃取純化土壤DNA,比較其含量和微生物含量間之 關係,同時以DGGE比較不同季節、林相和海拔對微生物生態之影響。結果發現 塔塔加雲杉區水分含量50.38-63.30 %、pH值4.41-4.49、總有機碳含量 12.11-27.17 %,總氮含量0.59-1.32 %、碳氮比19.65-21.33 和灰分為36.15-75.87 %;鐵杉區土 壤水分含量33.74-70.99 %、pH值3.83-4.09、總有機碳含量 12.86-35.93 %、總氮 含量0.21-1.34 %、碳氮比12.98-46.93和灰分為11.52-90.26 %。草原區土壤水分含 量36.21-46.17 %、pH值4.18-4.48、總有機碳含量7.05-15.31 %、總氮含量0.24-0.53 %、C/N比29.19-38.98和灰分為76.65-90.79 %。微生物生態方面,雲杉區每克乾重 土 壤 含 總 菌 數 2.69×106 -2.39×l07 CFU 、 放 線 菌 2.00×103-1.70×104 CFU 、 真 菌 1.30×105-5.81×105 CFU 、 纖 維 素 分 解 菌 3.04×104- 1.86×105 CFU 、 溶 磷 菌 9.64×104-4.46×105 CFU 、 固 氮 菌 1.65×104-8.12×104 CFU 、 微 生 物 生 質 碳 783.52-1182.73 µg-C、微生物生質氮 93.42-166.36 µg-N和核酸含量11.12-44.65 μ g 。 鐵 杉 林 每 克 乾 重 土 壤 含 總 菌 數 3.35×105-1.74×l06 CFU 、 放 線 菌 5.35×102-3.36×104 CFU、真菌1.68×103-1.19 ×104 CFU、纖維素分解菌1.25×104- 2.57×105 CFU、溶磷菌8.83×104-3.33×105 CFU、固氮菌1.34×104-6.78×104 CFU、微 生物生質碳557.27-933.54 μg-C、微生物生質氮 71.23-145.85 μg-N和核酸含量 11.29-45.98 μg。草原區每克乾重土壤含總菌數 1.61×105-2.21×l06 CFU、放線菌 1.59×103-5.79×103 CFU 、 真 菌 2.31×104-1.14×105 CFU 、 纖 維 素 分 解 菌 8.17×103-4.49×104 CFU、溶磷菌1.37×105-3.34×105 CFU、固氮菌1.08×104-7.13×104 CFU、微生物生質碳425.93-886.35 µg-C、微生物生質氮 63.82-133.28 µg-N和核酸 含量8.32-38.49 µg。福山溪谷區土壤水分含量18.79-21.09 %、pH值5.23-5.43、總有機碳含量 2.09-3.33 %、總氮含量0.21-0.27 %和碳氮比10.88-19.01。中坡區土壤水分含量 33.05-52.30 %、pH值4.24-4.43、總有機碳含量5.08-11.43 %、總氮含量0.28-0.47 % 和碳氮比11.25-22.58。稜線區土壤水分含量44.71-49.58 %、pH值4.06-4.34、總有 機碳含量10.13-11.13 %、總氮含量0.30-0.45 % 和碳氮比23.99-26.29。微生物生態 方 面 , 每 克 乾 重 溪 谷 土 壤 含 總 菌 數 1.59×107 -1.68×l07 CFU 、 放 線 菌 2.10×103-1.40×104 CFU、真菌1.42×105-2.17×105 CFU、纖維素分解菌 1.82×106- 3.47×106 CFU、溶磷菌3.20×104-1.04×105 CFU、固氮菌 1.73×105-1.95×105 CFU、 微生物生質碳196.84-375.28 μg-C、微生物生質氮 113.42-189.04 μg-N和核酸含
量2.87-26.81 µg。中坡區每克乾重土壤含總菌數 3.23×106
-7.32×l07 CFU、放線菌
2.27×103-9.75×103 CFU、真菌5.64×104-4.53×105 CFU、纖維素分解菌2.88×105-
1.07×106 CFU、溶磷菌4.07×104-1.86×105 CFU、固氮菌2.03×105-6.22×105 CFU、微 生物生質碳117.93-427.58 μg-C、微生物生質氮 45.38-228.96 μg-N和核酸含量
3.21-31.46 µg。稜線區每克乾重土壤含總菌數 3.15×106-6.82×l07 CFU、放線菌
6.68×102-3.63×103 CFU、真菌4.00×104-2.13×105 CFU、纖維素分解菌1.68×106-
2.43×106 CFU、溶磷菌7.00×104-1.97×105 CFU、固氮菌5.45×105-1.29×106 CFU、微 生物生質碳243.14-526.37 µg-C、微生物生質氮 60.84-264.80 µg-N和核酸含量 3.45-38.49 µg。塔塔加草原和福山稜線土壤剖面之 pH值皆上層最低,總有機碳和 總氮含量皆最上層O層最高,C/N 則Oa層最低,O層最高。至於微生物含量,其 數目皆隨深度之增加而減少。塔塔加草原土壤剖面總菌數減少88.23-91.65 %、放 線菌72.67-92.38 %、真菌69.36-96.56 %、纖維素分解菌 56.21-89.41 %、溶磷菌 75.63-83.84 % 和固氮菌59.17-89.93 %。土壤DNA萃取與純化方面選用改良式 Krsek’s方法用來萃取森林土壤DNA;其中Lysis時間延長,添加 AlK(SO4)2 50 mM、PVPP 1g/ml 前處理,且利用2 % PVP切膠進行後處理處理。從福山森林土 壤DGGE 圖譜研究發現三區微生物族群分佈類似,但數量以有機層較大,下層較 低,溪谷在多樣性或數量皆表現較低。 關鍵詞: 森林土壤、微生物生態、土壤剖面、微生物生質、DNA含量、土壤DGGE 圖譜
Abstract
To investigate the effect of attitude on microbial ecology of forest soils and the role of microbes on the organic matter decomposition and nutritional flow, Tatachia and Fu-Shan forests were chosen. Environment conditions of atmospheric and soil temperatures, light intensity, soil properties of moisture content, pH, total organic carbon, total nitrogen and C/N ratio and populations of total count, actinomycetes, fungi, cellulolytic microbes, phosphate-solubilizing microbes and nitrogen-fixing microbes were measured during the past year. In addition, microbial biomass carbon, microbial biomass nitrogen and DNA content were also studied. In the case of
Tatachia forest, Spruce soil had moisture content 50.38-63.30 %, pH 4.41-4.49, total organic carbon 12.11-27.17 %, total nitrogen 0.59-1.32 %, C/N ratio 19.65-21.33 and ash content 36.15-75.87 %; Hemlock soil had moisture content 33.74-70.99 %, pH 3.83-4.09, total organic carbon 12.86-35.93 %, total nitrogen 0.21-1.34 %, C/N ratio 12.98-46.93 and ash content 11.52-90.26 %; grassland soil had moisture content 36.21-46.17 %, pH 4.18-4.48, total organic carbon 7.05-15.31 %, total nitrogen 0.24-0.53 %, C/N ratio 29.19-38.98 and ash content 76.65-90.79 %. In microbial ecology, each gram of dry Spruce soil contained total microbes 2.69×106-2.39×l07 CFU, actinomycetes 2.00×103-1.70×104 CFU, fungi 1.30×105-5.81×105 CFU, cellulolytic microbes 3.04×104-1.86×105 CFU, phosphate-solubilizing microbes 9.64×104-4.46×105 CFU, nitrogen-fixing microbes 1.65×104-8.12×104 CFU, microbial biomass carbon 783.52-1,182.73 µg-C, microbial biomass nitrogen 93.42-166.36 µg-N and DNA 11.12-44.65 µg. Each gram of dry Hemlock soil had total microbes 3.35×105-1.74×l06 CFU, actinomycetes 5.35×102-2.36×104 CFU, fungi 1.68×103- 1.19×104 CFU, cellulolytic microbes 1.25×104-2.57×105 CFU, phosphate-solubilizing microbes 8.83×104-3.33×105 CFU, nitrogen-fixing microbes 1.34×104-6.78×104 CFU, microbial biomass carbon 557.27-933.54 µg-C, microbial biomass nitrogen 71.23- 145.85 μg-N and DNA 11.29-45.98 µg. Each gram of dry grassland soil comprised total microbes 1.61×105-2.21×l06 CFU, actinomycetes 1.59×103-5.79×103 CFU, fungi 2.31×104-1.14×105 CFU, cellulolytic microbes 8.17×103-4.49×104 CFU, phosphate- solubilizing microbes 1.37×105-3.34×105 CFU, nitrogen-fixing microbes 1.08×104- 7.13×104 CFU, microbial biomass carbon 425.93-886.35 µg-C, microbial biomass nitrogen 63.82-133.28 µg-N and DNA 8.32-38.49 µg.
In the case of Fu-Shan forest, valley soil had moisture content 18.79-21.09 %, pH 5.23-5.43, total organic carbon 2.09-3.33 %, total nitrogen 0.21-0.27 % and C/N ratio 10.88-19.01; middle slope soil had moisture content 33.05-52.30 %, pH 4.24-4.43, total organic carbon 5.08-11.43 %, total nitrogen 0.28-0.47 % and C/N ratio 11.25-22.58, ridge soil had moisture content 44.71-49.58 %, pH 4.06-4.34, total organic carbon 10.13-11.13 %, total nitrogen 0.30-0.45 % and C/N ratio 23.99-26.29. In the microbial populations, each gram of valley soil contained total microbes 1.59×107-1.68×l07 CFU, actinomycetes 2.10×103-1.40×104 CFU, fungi 1.42×105- 2.17×105 CFU, cellulolytic microbes 1.82×106-3.47×106 CFU, phosphate-solubilizing microbes 3.20×104-1.04×105 CFU, nitrogen-fixing microbes 1.73×105-1.95×105 CFU, microbial biomass carbon 196.84-375.28 µg-C, microbial biomass nitrogen 113.42- 189.04 µg-N and DNA 2.87-26.81µg. Each gram of middle slope soil had total microbes 3.23×106-7.32×l07 CFU, actinomycetes 2.27×103-9.75×103 CFU, fungi 5.64×104-4.53×105 CFU, cellulolytic microbes 2.88×105-1.07×106 CFU, phosphate- solubilizing microbes 4.07×104-1.86×105 CFU, nitrogen-fixing microbes 2.03×105- 6.22×105 CFU, microbial biomass carbon 117.93-427.58 µg-C, microbial biomass
nitrogen 45.38-228.96 µg-N and DNA 3.21-31.46 µg. Each gram of ridge soil comprised total microbes 3.15×106-6.82×l07 CFU, actinomycetes 6.68×102-3.63×103 CFU, fungi 4.00×104-2.13×105 CFU, cellulolytic microbes 1.68×106-2.43×106 CFU, phosphate-solubilizing microbes 7.00×104-1.97×105 CFU, nitrogen-fixing microbes 5.45×105-1.29×106 CFU, microbial biomass carbon 243.14-526.37 µg-C, microbial biomass nitrogen 60.84-264.80 µg-N and DNA 3.45-38.49 µg.
In the soil profiles of Tatachia grassland and Fu-Shan ridge soil, the pH was low at the topsoil, while total organic carbon and total nitrogen were reversed and had high values at the topsoil. In the case of microbial populations, the number decreased with the increasing of soil depth. The populations at the bottom horizon decreased 88.23-91.65 %, 72.67-92.38 %, 69.36-96.56 %, 56.21-89.41 %, 75.63-83.84 % and 59.17-89.93 % as the top horizon in total microbes, actinomycetes, fungi, cellulolytic microbes, phosphate-solubilizing microbes, and nitrogen-fixing microbes, respectively. In the forest soil DNA extraction and purification, the modified Krsek’s methods by extending Lysis time, adding AlK(SO4)2, PVPP as pre-washed treatment and PVP gel exciding was used. In the DGGE profile of Fu-Shan forest soil, the three sampling sites had similar soil microbial populations. The organic layer had the highest microbial populations, topsoil was the next, and subsoil had the less. The valley soil had the less microbial diversity and the microbial populations was the lowest.
Keywords: Forest soil, microbial ecology, soil profile, microbial biomass, DNA
content, soil DGGE profile.
前 言
生 物 多 樣 性 是 一 個 地 區 內 生 物 基 因 、 物 種 和 生 態 系 多 樣 性 的 總 和 。 生 物 多 樣 性 係 指 地 球 上 各 種 動 物 、 植 物 、 微 生 物 和 它 們 的 遺 傳 基 因 , 及 這 些 生 物 和 環 境 所 構 成 的 各 種 生 態 系 , 其 範 圍 涵 蓋 遺 傳 多 樣 性 、 物 種 多 樣 性 和 生 態 多 樣 性 三 個 層 次 (林 , 2000)。 聯 合 國 環 境 與 發 展 大 會 於 1992 年 地 球 高 峰 會 議 中 , 由 全 世 界 一 百 餘 國 領 袖 簽 訂 了 『 生 物 多 樣 性 公 約 』 後 , 生 物 多 樣 性 保 育 已 經 受 到 各 國 的 高 度 重 視 。 生 物 多 樣 性 公 約 的 宗 旨 是 『 保 育 生 物 多 樣 性 , 永 續 使 用 其 組 成 部 份 , 並 公 平、合 理 分 享 利 用 遺 傳 資 源 所 產 生 的 惠 益 』。目 前 締 約 國 已 達 177 個 國 家 , 成 為 全 球 最 龐 大 的 保 育 公 約 。 台 灣 具 有 豐 富 多 樣 的 野 生 動 、 植 物 和 微 生 物 , 也 是 一 個 遺 傳 多 樣 性 的 寶 庫 。 但 相 關 野 生 微 生 物 遺 傳 多 樣 性 的 研 究 卻 不 多 也 常 被 忽 略 , 在 地 球 的 生 態 上 扮 演 著 非 常 重 要 角 色 , 包 括 自 然 界 元 素 循 環 、 物 質 分 解 和 各 種 資 源 合 成 。 日 常 生 活 中 所 應 用 的 微 生 物 領 域 , 有 醫 學 微 生物 、 食 品 微 生 物 和 環 境 微 生 物 等 。 生 物 多 樣 性 學 門 的 研 究 工 作 更 以 遺 傳 多 樣 性 、 物 種 多 樣 性 和 生 態 多 樣 性 為 首 要 目 標 。 微生物是自然界中多樣性最豐富的生態系,然而土壤微生物多樣性直到最近 幾年才受到重視。土壤微生物卻在土壤生態系中扮演著關鍵性的重要角色(Hilger 等,2000),近年來,土壤生態學界亦提出「微生物多樣性」(microbial diversity) 的觀念,強調微生物之物種與基因多樣化的重要性。期望能找出有益新藥物、抗 生素和工業產品,生物多樣化在生態系中具有物種豐富功能群,可用生化、免疫 和分子生物各學門的酵素或抗體。微生物多樣性是維持地球生態平衡最主要貢獻 者,在自然界中扮演分解者,亦提供人類文明所需之原料、溶劑、酵素、抗生素、 生物農藥、醫藥品、發酵產品、採礦、元素循環、污染物去除等。 土壤係植物生長之自然媒介,此種疏鬆表層針對森林植被的長期作用下便形 成森林土壤。因此森林土壤本身具有和森林植物生物學特性一致的許多性狀,溫 帶闊葉及落葉林的土壤枯枝落葉層、半分解層和腐植質層明顯且數量多,土壤近 乎中性,黏化作用占主導地位;熱帶南亞熱帶常綠闊葉林下,由於高溫多雨、有 機質分解迅速、微生物活性旺盛及淋溶作用強烈使土壤剖面具有另一種性質,有 機質層不多、鹽基飽和度低、土體酸性強及粘粒下移明顯等(張,1992)。Haynes (1986) 指出,分解作用在中性土壤比酸性土壤快,若土壤 pH 改變,則土壤中微 生物族群及活性將亦隨之改變。土壤中小分子之有機物(如酚類、胺基類、醣類 等)會被微生物作用成大分子的有機物,諸如腐植質等。Ronse(1988)等發現比利 時森林土壤普遍存在著土壤表層酸化情形,其即為有機酸之影響,土壤 pH值隨 著深度增加逐漸升高。森林土壤與森林植被互相影響、互相促進和互相依存,一 旦森林遭受破壞,森林土壤性質也隨之發生變化,直至遭受地表逕流的侵蝕土體 消失,森林土壤侵蝕流失則森林難以恢複 (2001,劉)。長久以來研究土壤微生物 的結果發現可以由培養基分離出來的微生物不到所有微生物的 20 % (Lee和 Pankhurst,1992),甚至有學者認為只有 0.001-0.3 % (Amann等,1995)。微生物 可能存在的種類推估差距極大,且可能永遠無法估算。幾乎所有的方法都低估了 土壤微生物之個體數目與種的數目(Lee,1994)。 隨著各種諸如純化與選殖基因等分生技術的進步,從土壤微生物中尋找各種 新物質成了橫跨生物與化學界中一項新領域的科學,從土壤中可以分離並純化出 原本不能在培養基中生長的微生物,將帶有功能性基因釣出並選殖入可以培養的 載體中大量生產出各種新化合物,所有的土壤微生物的基因可以整合視為一個大 的土壤微生物族群基因庫- the metagenome,土壤微生物多源基因體之功能性研究 (Handelsman 等,1998 )。利用 BCA 載體,我們可以從微生物棲地的基因庫中純 化出大的 DNA 片段 (>50 kb),然後轉殖入 E. coli 等載體中,再刺激誘導載體中 帶有的功能性基因產生各種蛋白質、酵素、賀爾蒙。 土壤有機質約有 1-3 % 來自於土壤微生物生質量,土壤微生物生質量為土壤 中具生命力之有機體。在大多數的土壤系統中,生質量除了是植物養分的供應 者,亦可作為系統內其他生物的食物碎屑。不僅是無機養分的源與匯之供應者
(Juma和Paul,1981)。為說明土壤生態系,養分及能量進出流向互動及控制機 制,適合的生質量定量方法是重要且必須的。 近年來,在分離 DNA 的步驟以及隨後的分析程序都有改良方法,使得比原來 方法更加簡單以及方便。分離土壤細菌 DNA 起源於 Torsvik(1980),利用不同離 心速度將微生物分開,再進行溶解微生物細胞,層析所分離出來的 DNA 或 RNA。 後來許多改良方法都是朝著提高回收率和純度以及朝著使用更小量樣品的方向 邁進(Tsai 和 Olson,1991; Kuske 等,1998)。少量樣品(從 250 mg 到 1 g)可置 於微量離心管中操作,且回收率仍可達 80 %以上(Zhou 等,1996; Kuske 等,1998)。 本研究中福山代表台灣低海拔主要的暖溫帶闊葉林生態系,塔塔加則代表台 灣的高山生態系諸如針葉林相及草原相。以此兩種不同的典型森林地探討於秋季 時微生物生態的多樣性變化和土壤性質。 材料與方法 1. 研究區域概述 (1).塔 塔 加 試 驗 地 概 述 福山代表台灣低海拔主要的暖溫帶闊葉林生態系,塔塔加則代表台灣的高山 生態系諸如針葉林相及草原相。以此兩種不同典型森林地探討微生物生態多樣 性。塔 塔 加 地 區 位 在 台 灣 中 部 山 區 , 玉 山 國 家 公 園 西 北 部 的 入 口 , 位 於 楠 梓 仙 溪 、 沙 里 仙 溪 及 神 木 溪 的 上 游 地 區 , 為 台 灣 大 學 實 驗 林 地 之 一 部 份 , 海 拔 高 度 介 於 1,800-2,500 公 尺 間 。 塔 塔 加 山 區 之 植 被 因 分 布 之 海 拔 高 度 、 地 形 、 氣 候 等 因 素 差 異 , 大 致 可 分 為 雲 杉 林 ( Picea
morr ison icola)、 鐵 杉 林 ( Tsu ga chi nen sis) 以 及 草 原 地 區 ( 由 於 平 均
植 群 在 1m 以 下 , 可 視 為 林 分 外 之 微 環 境 ), 塔 塔 加 為 台 灣 長 期 生 態 研 究 之 試 驗 區 之 一 。 土 壤 樣 體 分 別 取 自 上 述 三 個 不 同 植 被 區 域 之 上 層 土 壤 ( 0-20cm)、 下 層 土 壤 ( 21-40cm) 和 有 機 層 , 另 外 在 草 原 區 與 草 原 過 渡 帶 採 集 土 壤 剖 面 之 土 壤 樣 品 ( 依 土 壤 性 質 分 為 O 層 、 Oa層 、 A 層 及 Bw1和 Bw2層 共 五 層 )。其 中 O層 代 表 陸 地 表 面 主 要 由 有 機 物 堆 積 的 層 次 ; Oa層 代 表 腐 爛 或 高 度 分 解 有 機 物 ; A層 代 表 形 成 在 地 表 或 O 層 之 下 的 礦 物 質 化 育 層 ; Bw1與 Bw2層 為 形 成 在 O層 或 A層 下 之 化 育 層 , 該 層 已 有 不 同 顏 色 或 構 造 發 育 , 但 甚 少 或 無 明 顯 洗 入 物 質 累 積 。 (2).福 山 試 驗 地 概 述 福 山 試 驗 林 位 於 台 北 縣 烏 來 鄉 及 宜 蘭 縣 員 山 鄉 交 界 處 , 海 拔 高 度 為 500-1,400 m,平均高約 850 m。 約北緯 24o34’,東經 121o34’。試驗林之樹種組 成以樟科、殼斗科和茶科植物佔優勢,與台灣中低海拔闊葉林相類似。本研究樣 區位於哈盆溪上游之稜線側方西南向坡面,平均坡度約為10o ,在每一截線分溪 谷,中坡及稜線等不同生育地設置樣區,分四季採取土樣。樣區分類方式如下: A. 稜線(ridge):山坡的頂端,地勢平緩,土壤發育良好,雨水沖蝕現象輕微,土
壤層較深,大多為黃壤(yellow soils),深厚的土壤與平緩的地形有助於植物 根系發展。 B. 中 坡 (mi ddl e sl op e): 中 坡 地 區 的 平 均 坡 度 高 達 33 .7 度 , 地 勢 陡 峭 , 容 易 發 生 土 壤 沖 蝕 現 象 , 所 以 土 壤 發 育 不 完 全 , 多 為 崩 積 土 (colluvial soils), 土 層 淺 薄 , 灌 層 根 系 無 法 充 分 發 育 伸 展 。 C. 溪 谷 (v all e y) : 溪 谷 生 育 地 的 平 均 坡 度 為 27. 2 度 。 大 多 為 石 質 土 (lith osol s) , 受 到 溪 谷 水 流 沖 刷 以 及 陡 峭 山 壁 崩 削 雙 重 影 響 , 干 擾 最 為 嚴 重 , 植 株 密 度 為 三 種 生 育 地 中 最 低 。 2.土 壤 性 質 分 析 (1).pH 值 20 g 土 壤 樣 品 於 50 m L 的 燒 杯 內,加 入 2 0 m L 去 離 子 水 1 比 1 (w/ v) 比 例 混 和 , 並 在 30 分 鐘 內 攪 拌 懸 浮 液 數 次 。 靜 置 懸 浮 液 約 1 小 時 , 使 懸 浮 的 泥 土 沈 澱 , 以 pH 計 測 定 其 值 。 (2).土 壤 水 份 含 量 以 篩 網 去 除 大 於 2 mm 直 徑 的 石 礫 、 樹 枝 等 。 取 適 量 土 壤 在 105 ℃ 下 烘 乾 至 恆 重 後 , 測 定 土 壤 重 量 的 變 化 , 換 算 為 每 克 土 壤 之 水 分 含 量 。 (3).土 壤 總 有 機 碳 含 量 土壤中的有機碳含量以 Walkey-Black 法測定(Rhoades,1982)。 (4).土 壤 總 氮 含 量
土 壤 中 的 總 氮 含 量 採 改 良 之 Kjedahl 法 (Bremner 和 Mulvaney, 1982)測 定 。 (5).土 壤 灰 分 測 定 秤 取 適 量 之 樣 品 至 0.001 g(約 1.0-5.0 mg), 置 於 已 秤 重 量 之 坩 堝 中 , 先 以 105±5℃ 之 溫 度 預 熱 30 分 鐘 , 再 將 溫 度 調 至 850±5℃ 維 持 三 小 時 。 使 可 燃 分 充 分 氧 化 , 所 剩 殘 渣 佔 原 土 樣 之 重 量 百 分 率 即 為 該 試 樣 之 乾 基 灰 分 。 3.微生物菌數測定 採 用 平 板 計 數 法 (plate count)。土 壤 以 無 菌 水 作 一 系 列 稀 釋 後,取 1ml 之 懸 浮 液 置 於 培 養 皿 中 , 再 倒 入 適 當 之 培 養 基 。 在 2 5℃ 常 溫 下 培 養 , 觀 察 並 計 算 菌 數 。 (1).總 菌 數 之 測 定 土 壤 以 無 菌 水 作 一 系 列 稀 釋 後 , 取 1ml 之 懸 浮 液 置 於 培 養 皿 中 , 而 使 用 之 培 養 基 為 營 養 洋 菜 培 養 基。在 25℃ 下 培 養 一 週 後,觀 察 並 計
算 其 總 菌 (楊,1997)。主要培養的對象以其營養需求不很嚴格的微生物為主。 (2).放 線 菌 數 測 定 土壤以無菌水作一系列稀釋後,取 1ml 懸浮液置於培養皿中,使用甘油酵母 抽出培養基,在 25℃下培養一週,觀察並計算其放線菌之數目(楊,1997)。 (3).真 菌 菌 數 測 定 土 壤 以 無 菌 水 作 一 系 列 稀 釋 後 , 取 1ml 之 懸 浮 液 置 於 培 養 皿 中 , 使 用 Rose bengal 培 養 基 , 於 25℃ 下 培 養 3-5 天 後 , 觀 察 並 計 算 其 真 菌 之 數 目 (楊 , 1997)。 (4).纖 維 素 分 解 活 性 微 生 物 測 定 以 含 CMC 為 唯 一 碳 源 之 培 養 基 , 於 25℃ 下 培 養 3-7 天 , 觀 察 其 在 培 養 基 上 生 長 , 且 以 Congo red 噴 灑 , 如 產 生 透 明 環 , 即 為 具 纖 維 素 分 解 活 性 之 菌 株 (楊 , 1997)。 (5).溶 磷 菌 數 測 定 以 磷 礦 粉 為 磷 源 , 在 25℃ 下 培 養 3-5 天 , 測 其 透 明 圈 , 探 討 不 同 林 相 或 季 節 性 溶 磷 菌 之 變 化 情 形 (楊 , 1997)。 (6).固 氮 菌 數 測 定 因 而 以 未 含 氮 源 之 NFB 培 養 基 ( Krieg 和 Dobereiner, 1984) 在 25℃ 下 培 養 3-7 天 , 測 定 固 氮 族 群 , 探 討 不 同 林 相 季 節 中 , 固 氮 菌 族 群 之 變 化 (楊 , 1997)。 4.微 生 物 生 質 量 的 測 定 (1).微 生 物 生 質 碳 量 的 測 定
微 生 物 的 生 質 碳 (microbial biomass carbon) 採 薰 蒸 萃 取 法 (fumi gatio n-ex tracti on m etho d)定 量 (Van ce 等,1 987 a、19 87b、19 87 c) 。 (2).微 生 物 生 質 氮 量 的 測 定
微 生 物 生 質 氮 量 (microbial biomass nitrogen)的 測 定 採 用 薰 蒸 萃 取 法 (fumigation extraction method)(Raghubanshi, 1991)。
5.微生物核酸量測定
微 生 物 核 酸 量 採 用 ex situ 方 法 先 將 樣 品 中 的 菌 體 分 解,再 進 行 核
酸 的分離與純化(Trevors 等,1995 ; Krsek 和 Wellington,1999)。粗 萃 取 的 DNA
藉 由 分 光 光 度 計 的 A2 6 0/A2 8 0 和 A2 6 0/A2 3 0 的 比 率 來 決 定 不 純 物 蛋 白 質
和 腐 植 酸 的 量,亦 可 知 DNA 的 純 度。藉 由 A2 6 0 的 數 值 得 知,當 A2 6 0=1. 0
時 , DNA 的 濃 度 為 50 μ g/mL(Holben, 1994)。
根 據 本 實 驗 室 過 去 採 用 的 五 種 直 接 溶 解 細 胞 的 方 法 來 萃 取 塔 塔 加 地 區 的 土 壤 微 生 物 DNA, 五 種 比 較 方 法 如 下 :
(1).方 法 A
依 Zhou等 (1996)方 法 , 取 出 5 g 採 集 的 土 樣 , 加 入 13.5 mL DNA 萃 取 緩 衝 液 (100mM pH 8.0 Tris-HCl, 100mM pH 8.0 sodium EDTA, 100mM p H 8.0 s odi um p hos ph at e, 1.5 M NaCl , 1 % C TA B ), 以 及 100
μ L 的 proteinase K( 10mg/m L),一 起 置 入 錐 形 瓶 中,在 37℃ 以 225 rpm
的 速 度 搖 晃 30分 鐘,加 入 1.5 mL 20 % sodium dodecyl sulphate( SDS), 在 65℃ 水 浴 培 養 2小 時 , 每 隔 15-20分 鐘 上 下 搖 晃 一 次 。 室 溫 下 6000×g 離 心 10分 鐘 後 收 集 懸 浮 液 , 沈 澱 物 加 入 4.5 mL 緩 衝 液 和 0.5 m L 20 % SDS 後 , 懸 晃 10 秒 鐘 再 置 入 65 ℃ 水 浴 培 養 10 分 鐘 , 離 心 收 集 懸 浮 液 。 經 過 三 次 的 重 複 萃 取 後 的 懸 浮 液 加 入 等 體 積 的 chloroform/isoam yl al coh ol(24:1 , v/ v)。 水 溶 液 部 份 經 回 收 後 , 與 0.6 倍 體 積 i sop rop an ol反 應 一 小 時 , 以 16000×g離 心 20分 鐘 得 粗 萃 核 酸 。 使 用 70 %冰 酒 精 清 洗 後 再 將 之 懸 浮 於 在 500μ L 無 菌 去 離 子 水 中 , 利 用 gel plus centrifugal concentrator純 化 DNA。
(2).方 法 B
依 Liu 等 (1997) 方 法 取 5 g土 樣 , 懸 浮 於 9 mL溶 解 液 內 (100 mM
Tris -HCl, 1 00 m M EDTA, 0.75 M sucrose), 加 入 Lysoz yme( 1mg/mL)
後 37℃ 培 養 30分 鐘,加 入 proteinase K(200μ g/ L)和 SDS(1 %,wt/vol), 37℃ 下 培 養 2小 時 , 每 30 分 鐘 搖 晃 一 次 。 三 次 的 freez e-t haw循 環 後 , 室 溫 下 以 4100 × g 離 心 10 分 鐘 後 取 上 清 液 。 加 入 CTAB 到 最 終 濃 度 1 ﹪ ( wt/vol ) 和 0.7M NaCl , 在 65 ℃ 下 培 養 20 分 鐘 。 利 用 等 體 積 的 phenol -chlo ro fo rm -is oam yl al co hol (25 :2 4:1 ) 萃 取 , 利 用 等 體 積 的 chl oro fo rm/i so am yl al co hol (24: 1 , v/v ) 再 萃 取 。 加 入 等 體 積 的 冰 isop rop an ol 後,以 1 0分 鐘 10 000 × g 離 心 取 得 沈 澱 物,沈 澱 物 使 用 70 % 冰 酒 精 清 洗 , 將 DNA 懸 浮 於 500 μ L 無 菌 水 中 ( 必 要 時 可 利 用 low-melting-point agarose gel 再 度 純 化 )。
(3).方 法 C
依 Trevors和 van Elsas( 1995) 方 法 , 取 1 g的 土 壤 樣 本 於 15 mL
離 心 管 中 , 加 入 2.5 mL緩 衝 液 ( 120 mM pH 8.0 Na2HP O4, 1 % SDS,
100 μ g/ml protein ase K), 均 勻 混 合 後,37℃ 恆 溫 培 養 1小 時,期 間 不
定 時 搖 晃 反 應 物 。加 入 450μ L 5M NaCl,激 烈 振 盪。加 入 375μ L 10 % CTAB( Hexadec ylt rimeth yl ammo nium bromid e)( 溶 於 0 .7 M NaCl 溶 液 中 ), 65℃ 恆 溫 培 養 20分 鐘 。 加 入 等 體 積 的 chloroform溫 和 振 盪 。 之 後 進 行 4 ℃ 9000 × g 離 心 15 分 鐘 。 將 水 層 部 份 取 出 並 加 入 等 體 積 的 isop rop an ol,混 合 均 勻 後 置 於 -20 ℃ 的 恆 溫 設 備 培 養 1小 時。在 4 ℃ 10 000 × g離 心 25分 鐘 , 乾 燥 沈 澱 物 , 加 入 200μ L 無 菌 水 溶 解 沈 澱 物 , 進 行
瓊 脂 凝 膠 法 純 化 。 (4).方 法 D
依 Krsek和 Wellington (1999)方 法,取 2 g土 壤 樣 本,加 入 TE buffer ( 10 mM pH 8.0 Tris-HCl, 1 mM pH 8.0 EDTA) 均 勻 混 合 , 進 行 超 音 波 震 盪( sonication), 加 入 5 mg/ml Lysozyme 37℃ 培 養 1小 時 。 再 加 入 SDS 到 最 後 濃 度 為 1 %, 65-70 ℃ 培 養 30分 鐘 , 在 室 溫 下 4 100× g離 心 10分 鐘 得 上 清 液 , 加 入 1/5 V 8M Po tassi um acetat e( KAc) 後 在 冰 上 培 養 15 分 鐘 , 4 ℃ 13800 × g 離 心 20 分 鐘 。 沈 澱 物 以 TE buffer 回 溶 , 加 入 1/2V 50 % pol yeth yl enegl ycol 600 0( P E G)( wt/ wt ) 和 1/1 0 V 5M NaCl 進 行 隔 夜 (overnight)沈 澱 作 用。其 後 進 行 等 體 積 phenol/chloroform純 化 作 用。加 入 0.3M sodium acetate和 9/10V冰 isopropanol混 合 後 在 -70℃ 下 進 行 沈 澱 作 用 10分 鐘,再 利 用 16400×g離 心 10分 鐘 得 沈 澱 物。加 入 5 mM spermi ne-HC l ( 溶 於 TE bu ffer) 後 冰 上 沈 澱 1 5 分 鐘 。 最 後 沈 澱 物 溶 在 500 μ L無 菌 水 中 。 期 間 進 行 沈 澱 作 用 所 得 的 沈 澱 物 皆 利 用 TE bu ffer 回 溶 。
(5).方 法 E
依 Krsek和 Wellington(1999)方 法 , 和 方 法 D的 步 驟 相 同 , 不 同 的 是 使 用 Crombach buffer( 33mM pH 8 Tri-HCl, 1mM pH 8 EDTA) 代 替 TE buffer。 以 上 五 種 方 法 最 後 以 波 士 特 Gene-SpinT M 1-4-3 DNA Ex tracti on Kit 進 一 步 純 化 DNA。 7.DNA 純 化 方 法 為了去除森林土壤難以分離的腐植酸、色素、黏土等雜質,在建立良好 DNA 萃取流程,嘗試各種添加處理過程以處理各種不同性質的土壤。 (1).不同緩衝液
緩 衝 液 A(100 mM pH 8.0 Tris-HCl , 100 mM pH 8.0 sodium EDTA,10 0 mM pH 8.0 s odi um p hosp h at e,1.5 M NaCl,1 ﹪ C TAB); 緩 衝 液 B( 100mM Tris-HCl,100mM EDTA,0.75M sucrose); 緩 衝 液 C ( 10mM pH 8.0 Tris-HCl,1mM pH 8.0 EDTA); 緩 衝 液 D( 33mM pH 8 Tri-Hcl, 1mM pH 8 EDTA)。
(2).不 同 前 處 理 方 法
Braid 等 (20 03 )發 現 利 用 AlNH4(S O4)2等 chemical flocculation 在
l ys is 流 程 中 作 前 處 理 可 有 效 的 去 除 影 響 PCR 反 應 的 雜 質 。 本 研 究 中
使 用 不 同 濃 度 50 、 100、 200 mM AlK(SO4)2 和 50、 100、 150 mM
Al2(SO4)3(NH4)2SO4作 比 較 。由 於 能 吸 附 苯 環 化 合 物 , polyvinylpol y-
p yrrol ido ne(PVPP ) 和 pol yv in yl p yrrolid on e( P VP ) 亦 常 在 各 種 純 化 流 程 中 使 用 (Berthelet 等 , 1996; Holben 等 , 1988; Steffan 等 , 1988;
Trevo rs 等,199 2; Youn g 等,1 993 )。本 實 驗 使 用 PVP P 0. 1 g/ml 和 0 .2 g /ml 作 為 前 處 理 的 比 較 。
(3).不 同 後 處 理 方 法
利 用 2 % PVP加 入 電 泳 膠 中 , 在 電 泳 過 程 , PVP 會 吸 附 DNA溶 液 中 的 雜 質 , 使 DNA 與 雜 質 分 離 , 經 由 切 膠 將 DNA 純 化 (Loomis , 1974 )。Sp ermin e-HC l進 行 後 處 理 能 吸 附 蛋 白 質,對 DNA作 進 一 步 純 化 ( Krsek和 Wellington, 1999) 。
8.建 立 DGGE 測 定 系 統
變 性 梯 度 膠 體 電 泳 分 析 (DGGE:denaturing gradient gel el ect ro pho resis ),是 以 DNA的 變 性 原 理 來 偵 測 DNA變 異 的 一 種 生 物 技 術 , 其 偵 測 範 圍 遠 較 RFLP及 RAPD大 , 理 論 上 可 達 到 一 片 DNA百 分 之 百 鹽 基 變 化 的 解 析 力 , 因 此 是 具 有 發 展 潛 力 的 一 種 生 物 技 術 。
DGGE的 解 析 範 圍 受 DNA 的 序 列 結 構 所 限 制 , 當 一 段 DNA 僅 有 一 個 Dm,DGGE 就 無 法 分 析,這 段 DNA由 低 變 性 濃 度 向 高 變 性 濃 度 移 動,到 達 Tm時 DNA就 整 段 分 開,不 會 減 速,而 無 法 在 電 泳 膠 體 中 顯 現。 另 一 種 情 況 是 , 一 般 DNA有 兩 個 Dm , 則 DGGE 只 能 分 析 第 一 個 Dm , 而 不 能 分 析 第 二 個 Dm, 因 為 第 二 個 Dm是 呈 雙 股 狀 態 。 也 就 是 把 這 段 DNA接 到 一 個 GC 很 高 的 小 片 段 (名 之 為 GC cl am p), 再 以 DGGE分 析 , 這 種 處 理 使 原 來 具 有 一 個 Dm 的 片 段 變 成 兩 個 Dm 。 也 使 原 來 兩 個 Dm 的 片 段 經 調 整 變 性 梯 度 範 圍 後 變 成 兩 個 新 的 Dm,因 為 GC clamp的 Tm 很 高,所 以 單 獨 成 為 一 個 Dm,而 原 來 的 第 一 個 Dm,其 Tm較 GC clamp 低 ; 如 此 當 溫 度 達 到 較 低 的 Tm 時 除 GC clamp之 外 的 DNA全 部 解 鏈 而 減 速 , 換 言 之 DGGE的 偵 測 範 圍 可 以 擴 大 到 100 ﹪ 。 Prim er 的 選 擇 主 要 來 自 於 16S 或 18S rRNA 基 因 的 片 段 放 大 , 用 DGGE 分 析 這 些 片 段 常 用 以 解 釋 環 境 樣 品 中 微 生 物 多 樣 性 和 偵 測 微 生 物 物 族 群 隨 時 間 或 環 境 、地 域 性 的 改 變 。不 同 的 primer 有 不 同 的 靈 敏 度 , 因 此 primer 的 選 擇 十 分 重 要 , 且 針 對 不 同 的 微 生 物 族 群 諸 如 細 菌 、 真 菌 、 放 線 菌 等 或 是 功 能 基 因 也 常 被 使 用 來 分 析 鑑 定 微 生 物 和 探 討 親 緣 關 係,如:銨 氧 化 細 菌 的 銨 單 氧 氧 化 基 因 (Rotthauwe 等,1997), 脫 硝 菌 的 亞 硝 酸 還 原 基 因 (Hallin 和 Lindgren, 1999), 甲 烷 氧 化 菌 的 甲 醇 脫 氫 基 因 。 通 常 是 針 對 某 一 類 生 理 功 能 特 性 相 同 之 微 生 物 分 析 , 即 具 有 某 一 相 同 的 重 要 功 能 基 因 者 。 親 源 關 係 上 , 也 只 侷 限 於 分 析 具 有 此 基 因 之 微 生 物 間 的 親 源 關 係 ; 由 於 功 能 基 因 的 專 一 性 較 16S r RNA 基 因 高,針 對 功 能 基 因 設 計 的 引 子 和 探 針 較 不 易 受 到 非 對 象 細 菌 的 干 擾 , 且 能 直 接 反 應 出 某 一 類 細 菌 群 的 親 源 演 化 關 係 , 然 而 資 料 庫 之 序 列 並 不 如 16S rDNA 豐 富 , 在 引 子 和 探 針 設 計 上 會 受 到 一 些 限 制 , 由 於 近 幾 年 功 能 基 因 研 究 增 加 , 限 制 情 形 正 逐 漸 改 善 中 。 本 實 驗
所 選 取 之 primer 如 表 一 所 示 。 利 用 PCR 反 應 器 ( 2400, Perkin-Elmer cut es, US A) 先加熱至 95℃ 5 分鐘,再進行三十個循環:95℃ 1 分鐘;52℃ 1 分鐘,72℃ 2 分鐘,最後 72℃ 6 分鐘。
表一、本實驗 primer 選擇
Table 1. Primer selection in this study
Primer 16S rDNA target Sequence (5’-3’)
P1 (341FGC)(Muyzer et al., 1993) Eubacterial CCT ACG GGA GGC AGC AG
P2(534R)(Muyzer et al., 1993) Universal ATT ACC GCG GCT GCT GG
P3(907R)(Teske et al., 1997) Universal CCG TCA ATT CCT TTG AGT TT
P4(F984GC)(Heuer et al., 1997) Eubacterial AAC GCG AAG AAC CTT AC
Primer 534R Universal ATT ACC GCG GCT GCT GG
Primer 341F Universal GCC TAC GGC AGG CAG CAG
A1(F243)(Heuer et al.,1997 Actinomycetes GGA TGA GCC CGC GGC CTA
A2(R513GC)(Heuer et al.,1997) Actinomycetes CGG CCG CGG CTG CTG GCA CGT
FGC Universal GAA CGC GAA GAA CCT TAC
NRGC Universal ACG GGC GGT GTG TAC
GC clamp (Heuer et al., 1997) :
CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGCGGGGCGGGGGCACGGGGGG
9. DGGE的 操 作
製 備 DGGE 膠 體 之 主 要 步 驟 描 述 如 下 , 首 先 在 14 % 的 pol yacr yam id e gel (25 ml )中 摻 進 直 線 梯 度 由 0-80 % 的 連 續 變 性 溶 液 『 100 %=7M urea, 40 % formamide (v/v)。 將 上 述 溶 液 灌 進 以 teflon
spacer(0.75 mm)隔 離 的 兩 片 玻 璃 之 間,膠 體 最 上 層( 樣 品 下 面 ),有 1 cm
的 區 域 是 0 % 變 性 溶 液 。 膠 體 放 入 一 個 裝 有 60℃ (因 為 在 100 %的 變 性 藥 劑 下 , 對 DNA 解 鏈 的 相 對 效 率 而 言 為 35-40℃, 所 以 必 須 將 外 界 溫 度 設 在 60℃,如 此 才 能 使 DNA 在 電 泳 的 分 析 過 程 中 以 相 對 於 60-90 ℃ 的 梯 度 變 性 效 應 )的 running buffer (40 mM pH 7.4 Tris-acetate, 20 Mm sodium acetae,1 mM EDTA)的 水 缸 中,水 缸 上 面 裝 有 6 0℃ 循 環 液 體 儀 器 ( peristotic pump)和 加 熱 器,電 泳 以 150 V 操 作 數 小 時 後,取 出 膠 體 , 用 銀 染 法 染 色 , 照 相 。 在 不 同 的 實 驗 要 求 下 作 適 度 修 飾 。 所 有 的 實 驗 皆 三 重 複 , 且 至 少 進 行 三 次 。
10.統計分析
以 SAS 8.0分 析 軟 體 進 行 分 析 並 使 用 一 般 線 性 模 式 程 序 ( general linear mod els proced ure) 進 行 鄧 肯 氏 多 變 域 分 析 法 (Dun can ’s M ultipl e Ran ge Test ) 分 析 不 同 採 樣 位 置 與 時 間 間 隔 之 差 異 性 及 相 關 性 分 析 探
究 各 環 境 因 子 與 微 生 物 間 的 相 關 性 。 採 鄧 肯 氏 多 變 域 分 析 法 做 組 群 間 之 差 異 性 比 較 , 各 平 均 值 之 上 標 小 寫 英 文 字 母 若 有 差 異 , 即 表 示 其 平 均 值 有 顯 著 之 差 異 。 多 重 比 較 法 的 臨 界 值 設 定 , 均 是 採 用 試 驗 所 得 的 資 料 , 經 過 某 個 公 式 運 算 後 得 到 一 個 臨 界 值 。 若 兩 個 處 理 間 的 差 異 很 大 , 則 潛 在 錯 誤 風 險 亦 大 , 應 套 用 較 大 的 臨 界 值 ; 反 之 若 差 異 很 小 , 則 應 套 用 較 小 的 臨 界 值 。 故 鄧 肯 氏 多 變 域 分 析 法 的 臨 界 值 並 非 固 定 唯 一 , 而 是 隨 差 異 的 大 小 變 化 。
結 果 與 討 論
1.環 境 條 件 及 土 壤 性 質 秋 季 塔 塔 加 及 福 山 森 林 環 境 條 件 列 於 表 二 及 表 三 。 (1).pH 值 塔塔加與福山土壤層間的 pH 值均以土壤下層較高,有機層與上層較低;呈 現由上層往下層遞增的趨勢(表二及表三)。其中塔塔加鐵杉區的 pH 值較其他二採 樣區略低,塔塔加鐵杉區的 pH 值較雲杉區低的現象,應與前者堆積落葉較後者 不易分解,有大量腐植酸堆積所致。宋(1999)於塔塔加研究台灣二葉松根圈土 壤亦發現其 pH 值平均為 4.30。低於本體土壤的 pH 值 4.82,且有極顯著差異, 可見植體的有機酸分泌與落葉腐植酸堆積會影響土壤 pH 值變化。故由在剖面層 的 pH 值方面,塔塔加與福山土壤均以最上層有最低 pH 值。 (2).水份含量 塔塔加與福山土壤層間的水分含量均以有機層最高,上層次之和下層最低, 呈現由上往下遞減趨勢。其中,塔塔加草原區含水量較其他區低,且各層間含水 量較為接近。塔塔加草原區含水量較其他二區者低的原因,主要是由於此區無大 型立木的茂密枝葉遮蔽,故土壤中的水分相對較易蒸散,有機表層含水量與土壤 上層接近。塔塔加與福山土壤剖面層間含水量均以最上層最高,隨深度增加而遞 減。 (3).總有機碳含量 塔塔加與福山土壤層間的總有機碳含量均以有機層最高,上層次之和下層最 低,呈現由上往下遞減趨勢。塔塔加草原區總有機碳含量較其他二區低,此結果 與世界上許多地區森林-草原交界處有相同的結果(王,1999),此與草原土壤落葉 量及黏粒較少有關。雲杉區與鐵杉區總有機碳含量高於福山所有樣區。塔塔加雲 杉區與鐵杉區土壤有較高的總有機碳含量與雲杉及鐵杉的落葉層堆積有關,因而 草原區總有機碳含量較低。塔塔加與福山土壤剖面總有機碳含量均以最上層最 高,福山土壤剖面層間的差異較小。表二、塔塔加高山森林環境條件及土壤性質
Table 2. Environmental conditions and soil properties of Tatachia forest
Properties Organic layer Topsoil (0~20 cm) Subsoil (21~40 cm)
Altitude (m) 2500 2500 2500
Annual precipitation (mm) 3000 (avg.) 3000 (avg.) 3000 (avg.)
Vegetation : Spruce
Hemlock
Grassland
Spruce, dwarf bamboo, morrisonicola Hemlock, dwarf bamboo,
Grass, pine, dwarf bamboo
Soil Color: Spruce
Hemlock Grassland Blackish brown Blackish brown Blackish brown Blackish gray Blackish gray Blackish yellow Yellowish gray Yellowish gray Yellowish gray Atmospheric temperature (oC) Spruce Hemlock Grassland Soil temperature (oC) Spruce Hemlock Grassland
10.7a *(Fall)---6.3c (Winter)---9.3b (Spring) 14.2a (Fall)---12.7b (Winter)---7.5b (Spring) 24.5a (Fall)---17.0b (Winter)---21.6ab (Spring) 11.6a (Fall)---4.7b (Winter)---4.7b (Spring) 15.2a (Fall)---5.2b (Winter)---4.3b (Spring) 18.2a (Fall)---5.8b (Winter)---8.1b (Spring)
Light intensity
Spruce Hemlock Grassland
2970a (Fall)---610b (Winter)---2836a (Spring) 667a (Fall)---917a (Winter)---1129a (Spring) 7200b (Fall)---52300a (Winter)---17268b (Spring)
pH Spruce Fall Winter Spring Hemlock Fall Winter Spring Grassland Fall Winter Sprin 4.99±0.01a,A 4.52±0.04a,A 4.32±0.02b,A 3.66±0.01a,AB 3.39±0.04b,AB 3.49±0.08b,AB 4.16±0.01a,A 4.39±0.04a,A 4.41±0.08a,A 4.74±0.01a,A 4.20±0.04b,A 3.96±0.06c,AB 3.88±0.01a,B 3.81±0.03b,AB 3.80±0.06b,AB 4.24±0.01a,A 3.94±0.06c,AB 4.38±0.03b,A 4.98±0.01a,A 4.35±0.04b,A 4.33±0.08b,A 4.10±0.01a,B 4.11±0.03a,AB 3.88±0.03a,B 4.48±0.01a,AB 4.12±0.04b.AB 4.64±0.06a,A Moisture content (%) Dry weight base
Spruce Fall Winter Spring Hemlock Fall Winter Spring Grassland Fall Winter Spring 274.98±2.94a,A 126.08±1.94b,A 120.50±1.74b,AB 211.99±50.39a,AB 152.23±8.23ab,A 172.18±3.44ab,A 97.63±0.90a,B 52.93±1.11b,AB 94.93±0.31a,B 169.22±5.98a,A 109.41±0.45ab,A 96.25±2.19ab.B 179.43±49.50a,A 97.70±1.35b,A 143.34±3.26ab,A 95.56±0.95a,B 61.47±0.56ab,B 90.94±1.01a,B 82.25±3.59ab,A 101.05±1.17a,A 79.70±0.81ab,A 94.77±51.64a,A 54.88±0.89ab,B 55.81±2.08ab,B 41.52±1.74a,B 42.25±0.81a,B 50.57±2.03a,B
Properties (continued) Organic layer Topsoil (0~20 cm) Subsoil (21~40 cm)
Moisture content (%) Wet weight base
Spruce Fall Winter Spring Hemlock Fall Winter Spring Grassland Fall Winter Spring 67.69±4.08a,A 54.73±0.32b,A 53.88±0.39b,AB 71.28±4.19a,AB 60.24±1.22ab,A 62.39±0.64ab,A 38.76±1.33a,B 33.62±0.54b,AB 48.06±0.07a,B 58.09±0.78a,A 48.57±0.16ab,A 48.11±0.64ab,B 50.46±4.88a,A 48.30±0.34b,A 57.30±0.54ab,A 34.74±0.90a,B 37.48±0.21ab,B 47.35±0.29a,B 50.74±0.25ab,A 45.94±0.17a,A 44.31±0.25ab,A 38.15±4.36a,A 35.32±0.37ab,B 35.46±0.78ab,B 29.08±1.19a,B 29.68±0.56a,B 33.41±0.86a,B
Total organic carbon (%)
Spruce Fall Winter Spring Hemlock Fall Winter Spring Grassland Fall Winter Spring 28.24±0.19a,A 27.59±2.03a,A 27.80±3.74a,A 32.54±0.23a,A 29.10±0.54a,A 30.40±0.57a,A 12.81±1.41a,B 6.24±0.76b,B 14.74±2.61a,B 20.87±0.87a,A 16.40±0.63a,A 14.79±1.17a,A 13.16±0.72a,A 15.06±0.36ab,A 15.50±1.09ab,A 9.34±0.63a,B 5.53±0.49ab,B 8.16±0.51a,B 16.63±1.56b,A 14.30±0.32a,A 11.25±0.29a,A 4.01±0.74a,A 4.01±0.16b,B 4.82±0.47b,B 6.83±1.31b,B 2.11±0.34b,C 4.15±0.14a,B Total nitrogen (%) Spruce Fall Winter Spring Hemlock Fall Winter Spring Grassland Fall Winter Spring 1.38±0.03a,A 1.53±0.14a,A 1.53±0.21a,A 1.11±0.02b,A 1.62±0.11a,A 1.68±0.10a,A 0.25±0.04a,B 0.63±0.09a,B 0.69±0.08a,B 1.08±0.01ab,A 1.54±0.13a,A 0.82±0.08b,B 0.67±0.01ab,B 1.01±0.04a,B 1.16±0.03a,A 0.28±0.05a,C 0.52±0.04a,C 0.51±0.03a,C 0.60±0.24b,A 1.15±0.11b,A 0.60±0.03b,A 0.24±0.01a,AB 0.38±0.01a,B 0.35±0.06a,B 0.18±0.05a,AB 0.27±0.04a,B 0.18±0.01ab,C C/N ratio Spruce Fall Winter Spring Hemlock Fall Winter Spring Grassland Fall Winter Spring 20.44±6.33a,AB 20.59±5.89a,A 16.50±4.51b,A 29.41±1.05a,A 18.07±1.76b,A 18.25±2.63b,A 51.73±3.52a,AB 10.10±1.75b,B 22.84±5.26a,B 19.37±8.70a,AB 10.76±2.97b,AB 15.42±3.29a,A 19.63±7.20a,A 14.69±1.21b,A 13.66±2.11b,A 33.80±1.26a,AB 10.37±1.24ab,AB 16.31±2.09a,A 27.80±6.50ab,A 12.03±2.07ab,A 20.86±3.60a,A 16.77±7.40a,A 10.33±1.37b,A 14.22±3.81b.AB 37.57±2.62b,B 8.02±1.47b,AB 25.23±5.33a.A
*The same letter are not significantly different at the 5% level according to Duncan’s multiple range test by using MANOVA analysis (n=9).
表三、福山森林環境條件及土壤性質
Table 3. Environmental conditions and soil properties of Fu-Shan forest
Properties Organic layer Topsoil (0~20 cm) Subsoil (21~40 cm)
Altitude (m) 500 500 500
Annual precipitation (mm) 3660 (avg.) 3660 (avg.) 3660 (avg.)
Soil texture
Valley Middle-slope Ridge
Lithosols, stony loam Colluviums, stony loam Yellow soils, stony loam
Vegetation
Valley Middle-slope Ridge
Mixed evergreen trees, bushes, and ferns. Soil Color Valley Middle-slope Ridge
Blackish brown Blackish to brownish
red Brownish to yellowish red Atmospheric temperature (oC) Valley Middle-slope Ridge Soil temperature (oC) Valley Middle-slope Ridge
17.0b(Fall)---12.4c(Winter)---23.0a(Spring) 16.7bFall)---13.3c(Winter)---22.3a(Spring) 16.5b(Fall)---12.0c(Winter)---21.0a(Spring) 17.4a(Fall)---11.3c (Winter)---16.2ab (Spring) 17.8a (Fall)---13.1c (Winter)---15.2ab (Spring) 17.4a(Fall)---12.1c (Winter)---14.0ab (Spring)
Light intensity
Valley Middle-slope Ridge
402b (Fall)---338b (Winter)---3977a (Spring) 476b (Fall)---2342a (Winter)---2002a (Spring) 743b (Fall)---3183a (Winter)---3520a (Spring)
pH Valley Fall Winter Spring Middle-slope Fall Winter Spring Ridge Fall Winter Spring 4.40±0.09ab,A 4.61±0.03a,A 4.60±0.03a,A 4.37±0.07a,A 4.23±0.06a,B 3.80±0.01b,C 4.21±0.08a,AB 4.06±0.04ab,C 4.22±0.00a,B 4.20±0.09b,A 4.57±0.07a,A 4.67±0.03a,A 4.04±0.03a,AB 4.11±0.41a,B 3.76±0.01b,C 4.31±0.04a,A 4.27±0.11a,C 4.13±0.04b,B 4.36±0.13a,AB 4.48±0.03a,AB 4.72±0.03b,A 4.24±0.03a,B 4.32±0.04a,B 3.84±0.01b,B 4.62±0.15a,A 4.54±0.14a,A 4.24±0.01b,C Moisture content (%)
Dry weight base Valley Fall Winter Spring Middle-slope Fall Winter Spring Ridge Fall Winter Spring 125.03±14.82b,C 184.49±3.16a,A 149.60±3.83b,B 222.73±19.01a,B 135.98±1.04b,C 193.41±1.11ab,A 269.34±11.53a,A 152.61±2.90c,B 194.45±1.80b,A 80.32±15.40c,C 157.19±6.08a,A 113.32±2.59b,B 151.09±15.26a,A 107.11±2.01b,B 140.25±1.18ab,A 96.63±5.66b,B 114.682.17a,A 112.65±0.88a,A 59.76±11.48b,B 84.96±3.38a,A 82.43±1.65a,A 99.30±13.68a,A 80.47±1.97b,B 88.22±0.88a,B 69.64±3.35c,C 85.76±5.25b,B 100.55±0.67a,A (to be continue)
Properties(continued) Organic layer Topsoil (0~20 cm) Subsoil (20~40 cm)
Moisture content (%)
Wet weight base Valley Fall Winter Spring Middle-slope Fall Winter Spring Ridge Fall Winter Spring 54.88±2.68b,C 64.71±0.40a,A 59.81±0.62b,B 68.21±1.81a,B 57.46±0.20b,B 65.49±0.11a,A 72.35±1.18a,A 60.15±0.46b,AB 65.80±0.19ab,A 43.95±5.09c,B 61.10±0.93a,A 52.92±0.56b,B 59.93±2.44a,A 51.69±0.47b,B 58.35±0.21a,A 48.84±1.59b,B 52.85±0.48a,B 52.97±0.19a,B 36.90±4.27b,B 45.33±1.11a,A 44.42±0.55a,B 48.08±3.02a,A 44.29±0.54b,A 46.87±0.25a,AB 41.02±1.14c,B 46.08±1.51b,A 48.13±0.23a,A
Total organic carbon (%) Valley Fall Winter Spring Middle-slope Fall Winter Spring Ridge Fall Winter Spring 21.45±1.20c,A 15.81±1.93a,B 17.69±1.63a,B 32.14±1.64b,A 12.39±1.15b,B 15.78±1.79b,B 41.18±3.78a,A 11.28±0.34b,B 14.29±0.75b,B 11.77±1.15a,A 10.32±0.38a,A 8.01±0.12b,A 11.73±1.18a,A 7.61±0.56c,B 9.63±0.49b,A 10.71±0.28b,B 6.78±0.38a,B 6.49±0.34a,B 6.41±1.29a,B 5.59±0.84b,A 5.03±0.97b,A 8.47±0.86a,A 3.15±0.28b,B 3.74±0.30b,B 6.27±0.87a,B 3.92±0.61b,B 2.41±0.48b,C Total nitrogen (%) Valley Fall Winter Spring Middle-slope Fall Winter Spring Ridge Fall Winter Spring 0.63±0.17b,C 0.88±0.12a,A 0.90±0.09a,A 0.87±0.08a,A 0.78±0.01b,B 0.91±0.06a,A 0.71±0.04ab,B 0.87±0.09a,B 0.88±0.07a,A 0.43±0.03c,B 0.69±0.09a,B 0.50±0.01b,B 0.60±0.03a,A 0.52±0.09b,A 0.61±0.05a,A 0.39±0.13b,B 0.56±0.02a,B 0.39±0.06b,C 0.27±0.10a,A 0.34±0.17a,A 0.26±0.05b,B 0.28±0.02a,A 0.27±0.06b,B 0.23±0.02c,C 0.18±0.05b,B 0.39±0.03a,A 0.32±0.02a,A C/N ratio Valley Fall Winter Spring Middle-slope Fall Winter Spring Ridge Fall Winter Spring 33.72±19.67a,B 18.45±4.40b,A 21.55±12.82b,A 22.60±2.31b,C 17.99±9.40b,A 28.47±8.22a,A 48.02±12.72a,A 12.98±1.91b,B 16.41±7.57b,B 26.24±9.15a,A 15.27±2.16b,B 12.10±5.14b,B 28.54±11.89a,A 23.94±13.16a,A 25.72±14.75a,A 15.50±2.37a,B 11.21±1.52b,B 9.98±2.87b,B 13.15±6.32b,B 17.68±12.59a,B 16.27±7.64a,A 12.47±3.05b,B 23.13±15.07a,A 14.60±3.40b,B 17.38±3.59a,A 9.74±2.30b,B 6.09±2.49b,C
*The same letter are not significantly different at the 5% level according to Duncan’s multiple range test by using MANOVA analysis (n=9).
(4).總氮含量 塔塔加與福山土壤總氮含量均以土壤有機層最高,上層次之和下層最低,明 顯由上往下遞減,其與枯枝落葉殘體堆積有關。塔塔加草原區總氮含量較其他二 區低;雲杉區與鐵杉區總氮含量亦高於福山所有樣區。塔塔加與福山土壤剖面總 氮含量以最上層最高。 (5).灰分含量 塔塔加與福山土壤灰分含量均以下層最高,上層次之和有機層最低,呈現由 上往下遞增趨勢。塔塔加草原區灰分含量較其他二區者高;有機層與土壤上層灰 分含量均較低,土壤下層與他區相當。塔塔加雲杉區與鐵杉區因落葉殘體堆積與 高山溫度較低導致有機質體不易被分解,灰分明顯較低。塔塔加與福山土壤剖面 灰分含量均以最上層最低,由上往下遞增。 (6).碳氮比 塔塔加與福山土壤碳氮比以有機層較高。適當的碳氮比影響微生物生長,碳 源提供了微生物生長所需能源,氮源則為微生物代謝所需。較適合微生物生長的 碳氮比介於 20:1 與 30:1 之間。一般而言,闊葉樹葉碳氮比約在 45 左右,針葉樹 葉的碳氮比則較闊葉樹葉略低為 40 左右。碳氮比率高的有機物,其分解速度比 碳氮比率低的慢,碳氮比率越高,其分解速度就越慢,碳氮比太高時,會因氮素 缺乏,致使微生物無法大量繁殖。 (7).氣溫與土溫 塔塔加氣溫受日照影響極大,草原區氣溫較其他二區高;福山氣溫則在中坡 測得較高。土溫方面,塔塔加以草原區較高,福山則為稜線較高。 2.塔 塔 加 與 福 山 森 林 土 壤 微 生 物 生 態 塔塔加高山森林和草原區,因海拔較高,其氣溫和土溫皆較低,全年土溫平均 10 ℃左右。塔塔加三樣品區的土溫變化趨勢相當一致;長年土溫皆為 10℃左右,其 存在的細菌可能以嗜冷菌或耐冷菌為主,然而土壤中真正的嗜冷菌不多,故冬天 所存在的菌應以耐冷微生物為主(楊,1998)。福 山 闊 葉 林 區 氣 候 溫 暖 潮 濕 , 年平均氣溫 18.2℃,年降雨天數達 221 日,土層容易蓄積雨水,僅表層氧氣濃 度較高,土壤內部還原層,以不消耗氧氣的嫌氣細菌為主,當氧氣消耗殆盡時, 起而代之的為嫌氣性細菌。兼氣性細菌能將硝酸轉為游離態氮,如脫氮菌(林, 1987)。 (1).總 菌 數 含 量 塔 塔 加 森 林 土 壤 總 菌 數 含 量 雲 杉 林 、 鐵 杉 林 和 草 原 區 土 壤 , 其 微 生 物 含 量 三 個 樣 區 每 克 乾 重 土 壤 含 微 生 物 105 -107C FU,雲 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 2.39±0.32×107 CFU, 上 層 土 壤 每 克 含 6. 62±0 .16 ×1 06 CFU, 下 層 土 壤 含 2 .69± 0.2 5×106 C FU。 鐵 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 1.74 ±0. 08 ×106 C FU,上 層 土 壤 每 克 含 7 .16± 0.0 6×105C FU, 下 層 土 壤 則 為 3.35±1.12×105 CFU。 草 原 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 2. 21 ±0.4 3×106
CFU,上 層 土 壤 每 克 含 1 .61± 0.4 7×106C FU,下 層 土 壤 為 1. 61 ± 0.3 6×105 CFU。 雲 杉 林 土 壤 有 機 物 含 量 較 高 , 故 微 生 物 含 量 較 高 , 且 雲 杉 林 區 和 鐵 杉 林 區 土 壤 含 水 量 和 有 機 質 含 量 變 化 較 大 , 故 微 生 物 族 群 數 變 化 較 大 。 三 樣 區 上 層 土 壤 有 機 物 含 量 較 豐 富 , 微 生 物 族 群 數 亦 較 下 層 土 壤 高 。 有 機 層 處 因 為 養 分 豐 富 , 菌 數 常 高 於 上 下 層 , 但 因 常 受 陽 光 直 接 曝 曬 , 故 菌 數 表 現 較 不 穩 定 , 尤 以 草 原 更 為 明 顯 (表 四 )。 表四、塔塔加森林土壤微生物含量
Table 4. Microbial population of Tatachia (CFU/ g dry soil).
---
Sampling Total Actinomycetes Fungi Cellolytic P-solubilizing N-fixing
Location count microbes microbes microbes
--- Spruce Organic (2.39±0.32) ×107 (1.70±0.16) ×104 (5.81±0.33) ×105 (1.86±0.33) ×105 (4.46±0.36)×105 (1.65±0.22)×104 Topsoil (6.62±0.16)×106 (2.00±0.12)×103 (1.30±0.15)×105 (3.04±0.12)×104 (9.64±0.58)×104 (8.12±0.64)×104 Subsoil (2.69±0.25)×106 (2.78±0.23)×103 (2.72±0.07)×105 (3.56±0.05)×104 (1.93±0.31)×105 (3.07±0.32)×104 Hemlock Organic (1.74±0.08)×106 (3.36±0.32)×104 (1.19±0.21)×104 (2.57±0.13)×105 (3.33±0.31)×105 (1.34±0.29)×104 Topsoil (7.16±0.06)×105 (2.04±0.12)×103 (7.51±0.24)×104 (1.53±0.15)×105 (1.54±0.29)×105 (6.78±0.27)×104 Subsoil (3.35±1.12)×105 (5.35±0.22)×102 (1.68±0.11)×103 (1.25±0.08)×104 (8.83±0.42)×104 (5.46±0.13)×104 Grassland Organic (2.21±0.43)×106 (3.19±0.17)×103 (1.14±0.15)×105 (4.49±0.03)×104 (3.43±0.27)×105 (7.13±0.10)×104 Topsoil (1.61±0.47)×106 (1.59±0.32)×103 (2.31±0.27)×104 (2.32±0.14)×104 (1.37±0.27)×105 (2.66±0.46)×104 Subsoil (1.61±0.36)×105 (5.79±0.17)×103 (2.63±0.21)×104 (8.17±0.07)×103 (1.65±0.32)×105 (1.08±0.18)×104 --- Mean ± S.D. (n=9). 福 山 稜 線 、 中 坡 和 溪 谷 區 土 壤 , 三 個 樣 區 每 克 乾 重 土 壤 含 微 生 物 介 於 105 -107C FU 之 間 。 稜 線 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 6.82±0.21×107
CFU,上 層 土 壤 含 6.03±0.25×107C FU,下 層 土 壤 則 為 3.15±0.42×106C FU。
中 坡 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 7.32±0.08×107 C FU , 上 層 土 壤 每 克 含 5.85±0.26×107C FU, 下 層 土 壤 則 為 3.23±1.12×107C FU。 溪 谷 區 有 機 層 土 壤 每 克 含 1.68±0.12×107 CFU。 上 層 土 壤 每 克 含 1.59±0.23×1 07CFU, 下 層 土 壤 為 1.65±0.27×107 CFU 。 稜 線 區 和 中 坡 區 林 相 與 植 被 分 佈 較 豐 , 土 壤 有 機 物 含 量 較 高 , 因 而 微 生 物 含 量 較 溪 谷 土 壤 高 。 三 區 上 層 土 壤 亦 因 有 機 物 含 量 較 豐 富 , 微 生 物 族 群 數 也 較 下 層 土 壤 高 (表 五 )。 (2).放 線 菌 含 量 放 線 菌 因 具 有 多 種 酵 素 , 可 以 利 用 多 種 物 質 為 碳 源 及 能 源 , 在 土 壤 養 分 之 循 環 上 佔 極 重 要 地 位 , 以 平 板 法 定 量 放 線 菌 時 , 其 菌 數 並 不 因 培 養 基 成 分 影 響 , 顯 示 此 類 微 生 物 可 以 利 用 各 種 有 機 養 分 。 森 林 土 壤 由 於 落 葉 豐 , 纖 維 質 有 機 物 含 量 高 , 因 而 放 線 菌 族 群 不 容 忽 視 。 雲
杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 放 線 菌 1.70±0.16×104 C FU , 上 層 土 壤 含 2.00±0.12×103 C FU 和 下 層 土 壤 含 2.78±0.23×103 C FU。鐵 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 放 線 菌 3.36±0.32×104 C FU, 上 層 土 壤 含 2.04±0.12×103C FU, 下 層 土 壤 含 5.35±0.22×102 C FU。 草 原 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 放 線 菌 3.19±0.17×103C FU , 上 層 土 壤 含 1.59±0.32×103C FU , 下 層 土 壤 含 5.79±0.17×103C FU。 由 於 草 原 區 有 機 碳 和 總 氮 量 較 低, 所 以 放 線 菌 數 在 三 區 中 較 少 。 三 種 土 壤 其 放 線 菌 含 量 差 異 性 不 明 顯 。 雲 杉 林 和 鐵 杉 林 放 線 菌 數 比 草 原 區 多 。 由 於 森 林 土 壤 質 地 較 鬆 軟 , 因 而 有 機 層 、 上 層 及 下 層 土 壤 放 線 菌 含 量 較 不 明 顯 , 但 是 仍 以 上 層 較 下 層 多 (表 四 )。 表五、福山森林土壤微生物含量
Table 5. Microbial population of Fu-Shan forest (CFU/ g dry soil)
---
Sampling Total Actinomycetes Fungi Cellolytic P-solubilizing N-fixing
Location count microbes microbes microbes
---Valley Organic (1.68±0.12)×107 (1.40±0.13)×104 (2.17±0.15)×105 (3.47±0.32)×106 (1.04±0.16)×105 (1.95±0.02)×105 Topsoil (1.59±0.23)×107 (2.10±0.27)×103 (1.79±0.23)×105 (1.29±0.22)×106 (5.21±0.38)×104 (1.73±0.44)×105 Subsoil (1.65±0.27)×107 (2.91±0.34)×103 (1.42±0.12)×105 (1.82±0.13)×106 (3.20±0.22)×104 (1.91±0.22)×105 Middle-slope Organic (7.32±0.08)×107 (9.75±0.19)×103 (4.53±0.28)×105 (1.07±0.16)×106 (1.86±0.13)×105 (6.22±0.39)×105 Topsoil (5.85±0.26)×106 (3.31±0.33)×103 (2.10±0.22)×105 (5.46±0.19)×105 (9.41±0.24)×104 (2.03±0.37)×105 Subsoil (3.23±1.12)×106 (2.27±0.17)×103 (5.64±0.21)×104 (2.88±0.18)×105 (4.07±0.62)×104 (2.70±0.24)×105 Ridge Organic (6.82±0.21)×107 (3.63±0.28)×103 (2.13±0.32)×105 (2.43±0.02)×106 (1.97±0.19)×105 (1.29±0.21)×106 Topsoil (6.03±0.25)×107 (1.37±0.12)×103 (9.90±0.13)×104 (1.68±0.13)×106 (1.41±0.28)×105 (1.14±0.22)×106 Subsoil (3.15±0.42)×106 (6.68±0.23)×102 (4.00±0.24)×104 (2.40±0.35)×106 (7.00±0.22)×104 (5.45±0.21)×105 --- Mean ± S.D. (n=9). 福 山 稜 線 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 放 線 菌 3.63±0.28×103 CFU,上 層 土 壤 含 1.37±0.12×103 CFU 和 下 層 土 壤 含 6.68±0.23×102C FU 。 中 坡 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 放 線 菌 9.75±0.19×103 CFU , 上 層 土 壤 含 3.31±0.33×103 CFU和 下 層 土 壤 含 2.27±0.17×103C FU。溪 谷 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 放 線 菌 1.40±0.13×104 CFU, 上 層 土 壤 每 克 含 2.10±0.27×103C FU 和 下 層 土 壤 含 2.91±0.34×103 C FU。秋 季 溪 谷 區 的 菌 相 明 顯 較 其 他 兩 區 高, 可 能 是 因 為 該 區 pH 值 較 其 他 區 高 有 關 , 放 線 菌 數 和 氫 離 子 濃 度 成 正 比 ( 林 , 198 7 ) (表 五 )。 福 山 與 塔 塔 加 森 林 土 壤 p H值 大 部 分 為 酸 性 , 每 克 乾 重 土 壤 放 線 菌 菌 數 大 都 介 於 103 -104CFU, 少 於 細 菌 和 真 菌 族 群 。 (3).真 菌 數 含 量
塔 塔 加 高 山 森 林 土 壤 有 機 物 含 量 高 , 年 平 均 溫 度 只 有 10℃ , 有 機 物 易 堆 積 , 土 壤 pH呈 酸 性 , 有 利 真 菌 族 群 建 立 。 雲 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 真 菌 5.81±0.33×105 C FU , 上 層 土 壤 含 1.30±0.15×105CFU , 和 下 層 土 壤 含 2.72±0.07 × 105 CFU 。 鐵 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 真 菌 1.19±0.21×104C FU , 上 層 土 壤 每 克 含 7.51±0.24×104C FU , 和 下 層 土 壤 含 1.68±0.11×1 03CFU 。 草 原 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 真 菌 1.14±0.15×105 CFU,上 層 土 壤 含 2.31±0.27×104C FU,和 下 層 土 壤 為 2.63±0.21×104 C FU 。 下 層 的 有 機 物 含 量 少 以 及 通 氣 情 形 低 , 所 以 真 菌 的 族 群 數 較 上 層 少 。 草 原 區 的 有 機 碳 和 總 氮 量 較 低 , 故 真 菌 菌 數 在 三 區 中 較 少 。 在 有 機 層 方 面 , 草 原 區 和 鐵 杉 林 區 亦 呈 現 較 高 的 菌 數 。 由 於 真 菌 行 異 營 生 活 方 式,決 定 其 生 長 情 形 為 可 被 氧 化 之 含 碳 化 合 物 (oxidizable carbonaceous subst an ces )含 量 的 多 寡 。 雲 杉 林 有 機 層 和 上 層 菌 數 差 異 並 不 明 顯 , 可 能 雲 杉 林 的 有 機 層 腐 植 質 含 量 較 高 , 土 壤 性 質 較 疏 鬆 , 通 氣 性 較 良 好,有 機 層 和 上 層 土 壤 分 界 較 不 明 顯,所 以 菌 數 上 差 異 不 顯 著 (表 四 )。 福 山 稜 線 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 真 菌 2.13±0.32×105 C FU,上 層 土 壤 含 9.90±0.13×104 C FU 和 下 層 土 壤 含 4.00±0.24×104C FU 。 中 坡 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 真 菌 4.53±0.28×105 CFU , 上 層 土 壤 含 2.10±0.22×105C FU 和 下 層 土 壤 則 為 5.64±0.21×104 C FU。溪 谷 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 真 菌 2.17±0.15×105C FU , 上 層 土 壤 含 1.79±0.23×105C FU 和 下 層 土 壤 為 1.42± 0.12×105C FU。 由 於 福 山 土 質 較 黏 重 , 分 層 明 顯 , 通 透 性 、 水 分 含 量 上 下 層 差 異 大 , 在 菌 數 方 面 可 明 顯 的 看 出 有 機 層 大 於 上 層 , 上 層 大 於 下 層 (表 五 )。 (4).纖 維 素 分 解 菌 含 量 塔 塔 加 雲 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 纖 維 素 分 解 菌 1.86±0.33×105 CFU, 上 層 土 壤 含 3.04±0.12×104C FU 和 下 層 土 壤 含 3.56±0.05×104C FU, 鐵 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 纖 維 素 分 解 菌 2.57±0.13×105 CFU , 上 層 含 1.53±0.15×105 C FU 和 下 層 土 壤 含 1.25±0.08×104C FU。草 原 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 纖 維 素 分 解 菌 4.49±0.03×104 CFU。 上 層 土 壤 含 2.32±0.14× 104 CFU 和 下 層 土 壤 為 8.17±0.07×103C FU。纖 維 素 分 解 活 性 微 生 物 菌 落 數 與 土 表 植 物 殘 體 之 數 量 相 關 , 塔 塔 加 森 林 土 表 終 年 均 含 有 多 量 纖 維 質 枯 落 物 , 所 以 具 有 分 解 纖 維 素 能 力 的 微 生 物 數 量 高 , 三 種 不 同 林 相 其 土 壤 中 所 含 具 纖 維 素 分 解 活 性 微 生 物 含 量 以 雲 杉 林 含 量 最 高 , 鐵 杉 林 次 之 , 草 原 區 最 低 , 因 為 草 原 區 的 落 葉 和 有 機 物 累 積 較 少 (表 四 )。 福 山 稜 線 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 纖 維 素 分 解 菌 2.43±0.02×106 CFU, 上 層 土 壤 含 1.68±0.13×106C FU 和 下 層 土 壤 含 2.40±0.35×106C FU, 中 坡 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 纖 維 素 分 解 菌 1.07±0.16×106 CFU , 上 層 土 壤 含 5.46±0.19×105 CFU 和 下 層 土 壤 則 為 2.88±0.18×105C FU。溪 谷 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 纖 維 素 分 解 菌 3.47±0.32×106 C FU 。 上 層 土 壤 含
1.29±0.22×106C FU 和 下 層 土 壤 含 1.82±0.13×106C FU(表 五 )。 塔 塔 加 草 原 和 福 山 三 樣 區 間 的 菌 數,草 原 區 因 為 缺 乏 成 林,太 陽 直 射,溫 度 較 高 , 纖 維 分 解 菌 數 變 化 和 福 山 中 低 海 拔 林 區 的 變 化 類 似 , 可 知 溫 度 會 影 響 纖 維 素 分 解 菌 菌 數 變 化 。 (5).溶 磷 菌 菌 數 含 量 塔 塔 加 雲 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 溶 磷 菌 4.46±0.36×105 CFU,上 層 土 壤 含 9.64±0.58×104 CFU 和 下 層 土 壤 含 1.93±0.31× 105C FU 。 鐵 杉 林 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 溶 磷 菌 3.33±0.31×105 CFU, 上 層 土 壤 含 1.54±0.29× 105CFU 和 下 層 土 壤 含 8.83±0.42×1 04CFU 。 草 原 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 溶 磷 菌 3.43±0.27×105 CFU , 上 層 土 壤 含 1.37±0.27×105C FU 和 下 層 土 壤 為 1.65±0.32×105 C FU。就 菌 數 含 量 而 言,三 種 林 相 彼 此 差 異 不 大 (表 四 )。 福 山 稜 線 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 溶 磷 菌 1.97±0.19×105 CFU,上 層 土 壤 含 1.41±0.28×105 CFU 和 下 層 土 壤 含 7.00±0.22×104C FU , 中 坡 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 溶 磷 菌 1.86±0.13×105 CFU , 上 層 土 壤 含 9.41±0.24×104 CFU和 下 層 土 壤 含 4.07±0.62×104C FU。溪 谷 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 溶 磷 菌 1.04±0.16×105 C FU , 上 層 土 壤 含 5.21±0.38×104C FU 和 下 層 土 壤 為 3.20±0.22×104CFU(表 五 )。 (6).固 氮 菌 菌 數 含 量 森林土壤氮素來源主要來自大氣沈降物、落葉分解及固定大氣中氮素。平板 法所培養出來的固氮菌主要為非共生性固氮菌。一般認為非共生性固氮作用在自 然界氮素循環上具有極重要的地位,對於流失的氮素回歸土壤,以及氮素在生物 物質化學上平衡有其不可或缺重要性。雲杉林每克乾重有機層土壤含固氮菌 1.65±0.22×104CFU,上層土壤含 8.12±0.64×104CFU 和下層土壤含 3.07±0.32×104 CFU;鐵杉林每克乾重有機層土壤含固氮菌 1.34±0.29×104CFU,上層土壤含 6.78±0.27×104CFU 和下層土壤含 5.46±0.13×104CFU;草原區每克乾重有機層土壤 含固氮菌 7.13±0.10×104 CFU,上層土壤每克含 2.66±0.46×104CFU 和下層土壤含 1.08±0.18×104CFU(表 四 )。 福 山 稜 線 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 固 氮 菌 1.29±0.21×106 CFU,上 層 土 壤 含 1.14±0.22×106 CFU 和 下 層 土 壤 含 5.45±0.21×105C FU , 中 坡 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 固 氮 菌 6.22±0.39×105 CFU , 上 層 土 壤 含 2.03±0.37×105 CFU, 下 層 土 壤 則 為 2.70±0.24×105C FU。 溪 谷 區 每 克 乾 重 有 機 層 土 壤 含 固 氮 菌 1.95±0.02×105 CFU 。 上 層 土 壤 含 1.73±0.44×105C FU 和 下 層 土 壤 為 1.91±0.22×105C FU(表 五 )。 在 大 部 分 樣 區 中 福 山 固 氮 菌 數 大 於 塔 塔 加 , 可 能 福 山 的 溫 度 、 落 葉 量 或 其 他 養 分 來 源 等 較 塔 塔 加 高 , 或 是 福 山 的 植 被 較 豐 、 根 系 較 發 達 , 使 固 氮 菌 數 量 亦 相 對 的 增 加 。 3.土 壤 剖 面 微 生 物 數 目 之 變 化
測 定 草 原 土 壤 剖 面 其 微 生 物 變 化 , 最 上 層 (O 層 )有 機 質 含 量 高 , 其 細 菌 數 、 放 線 菌 數 、 真 菌 數 、 具 纖 維 質 分 解 活 性 菌 、 溶 磷 菌 和 固 氮 菌 含 量 皆 最 高 , 隨 著 剖 面 深 度 增 加 , 其 菌 數 含 量 皆 下 降 (表 六 )。 福 山 稜 線 土 壤 剖 面,由 上 層 剖 面 O a 層 至 最 下 層 Bc 層,菌 數 變 化 隨 著 剖 面 深 度 大 幅 下 降 。 稜 線 區 和 草 原 剖 面 一 區 因 為 坡 度 較 大 , 水 分 、 養 分 流 失 較 快 , 雖 著 深 度 增 加 , 菌 數 快 速 銳 減 。 福 山 剖 面 的 菌 數 較 塔 塔 加 剖 面 高 , 其 變 化 也 較 大 (表 七 )。 表六、塔塔加森林土壤草原土壤剖面微生物含量
Table 6. Microbial population of soil profile in grassland of Tatachia (CFU/ g dry soil) ---
Sampling Total Actinomycetes Fungi Cellolytic P-solubilizing N-fixing
Location count microbes microbes microbes
---O horizon (1.66±0.15)×106 (8.69±0.08)×102 (2.35±0.26)×103 (4.24±0.03)×105 (8.74±0.21)×104 (1.86±0.32)×104 Oa horizon (6.29±0.23)×105 (6.41±0.09)×102 (2.55±0.18)×103 (2.30±0.12)×105 (3.77±0.18)×104 (3.01±0.07)×104 A horizon (2.92±0.11)×105 (6.87±0.05)×102 (7.00±0.32)×102 (2.07±0.04)×105 (3.44±0.24)×104 (2.17±0.31)×104 BW1 horizon (2.22±0.13)×105 (8.35±0.11)×102 (8.59±0.12)×102 (1.48±0.12)×105 (6.58±0.13)×104 (1.64±0.42)×104 BW2 horizon (3.54±0.05)×105 (6.96±0.12)×102 (8.50±0.23)×103 (7.62±0.09)×104 (2.46±0.03)×105 (5.01±0.26)×104 --- Mean ± S.D. (n=9) 表七、福山森林土壤背脊土壤剖面微生物含量
Table 7. Microbial population of soil profile in ridge of Fu-Shan forest (CFU/g dry soil)
---
Sampling Total Actinomycetes Fungi Cellolytic P-solubilizing N-fixing
Location count microbes microbes microbes
---OA horizon (4.75±0.19)×106 (2.66±0.08)×103 (9.45±0.23)×104 (9.33±0.13)×104 (4.75±0.25)×104 (2.18±0.14)×105 A horizon (2.99±0.17)×106 (1.35±0.19)×103 (8.92±0.28)×104 (4.88±0.19)×104 (3.24±0.27)×104 (5.23±0.18)×104 BW1 horizon (1.66±0.11)×106 (3.69±0.13)×102 (5.86±0.12)×104 (3.51±0.14)×104 (3.18±0.34)×104 (2.49±0.21)×104 BW2 horizon (7.00±0.23)×105 (5.60±0.17)×102 (3.88±0.26)×104 (1.49±0.02)×104 (2.19±0.73)×104 (3.88±0.17)×104 BC horizon (4.53±0.03)×105 (1.81±0.18)×102 (1.45±0.15)×104 (1.86±0.15)×104 (1.22±0.13)×104 (2.22±0.32)×104 - - - Mean ± S.D. (n=9) 4.微 生 物 生 物 質 量 之 變 化 利 用 氯 仿 燻 蒸 萃 取 法 (fumigation-extraction method)測 定 土 壤 微 生
物 生 物 質 量 (biomass)。 微 生 物 生 質 碳 含 量 方 面 , 有 機 質 層 之 生 質 碳 含 量 以 雲 杉 林 最 高 , 為 1182.73±142.14 μ g-C/ g d r y s oil, 鐵 杉 林 次 之 而 草 原 最 低,分 別 為 933.54±64.25 及 886.35±89.14 μ g-C/ g dr y so il;土 壤 方 面, 土 壤 上 層 亦 以 雲 杉 林 最 高 , 為 1008.75±211.98 μ g-C/ g dr y s oil, 鐵 杉 林 次 之 而 草 原 最 低 , 分 別 為 746.85±132.63 及 658.23±103.48 μ g-C/ g d r y soil,顯 示 雲 杉 林 區 土 壤 微 生 物 較 活 躍。至 於 微 生 物 生 質 氮 含 量 方 面 , 呈 現 和 生 質 碳 相 同 趨 勢 , 有 機 質 層 之 生 質 氮 含 量 以 雲 杉 林 最 高 , 為 166.36±13.82 μ g-N/ g d r y s oil , 鐵 杉 林 次 之 而 草 原 最 低 , 分 別 為 145.85±10.42 及 133.28±12.53 μ g-N/ g d r y s oil; 土 壤 方 面 , 土 壤 上 層 亦 以 雲 杉 林 最 高,為 154.27±9.36 μ g-N/ g d r y soil,鐵 杉 林 次 之 而 草 原 最 低 , 分 別 為 132.48±9.84 及 109.47±19.42 μ g-N / g dr y s oil ; 同 林 相 的 下 層 土 壤 無 論 微 生 物 生 質 碳 和 氮 含 量 皆 比 上 層 低 (表 八 )。 草 原 剖 面 之 微 生 物 生 質 碳 與 生 質 氮 含 量 方 面,以 O 層 土 壤 最 高。主 要 為 O 層 土 壤 有 機 質 含 量 高 , 通 氣 狀 況 佳 , 碳 氮 大 量 流 通 , 因 而 微 生 物 活 性 高 , 由 上 層 至 下 層 呈 遞 減 狀 態 (表 九 )。 表八、塔塔加森林土壤微生物生質量
Table 8. Soil microbial biomass of Tatachia forest
---
Properties Biomass carbon (µg C/g) Biomass nitrogen (µg N/g)
--- Spruce Organic layer 1182.73±142.14 166.36±13.82 Topsoil 1008.75±211.98 154.27±9.36 Subsoil 783.52±89.38 93.42±16.14 Hemlock Organic layer 933.54±64.25 145.85±10.42 Topsoil 746.85±132.63 132.48±9.84 Subsoil 557.27±90.37 71.23±9.25 Grassland Organic layer 886.35±89.14 133.28±12.53 Topsoil 658.23±103.48 109.47±19.42 Subsoil 425.93±65.29 63.82±10.28 --- 福 山 有 機 質 層 生 質 碳 含 量 方 面 , 溪 谷 區 最 低 , 為 375.28±20.96 μ g-C/ g d r y soil, 稜 線 區 和 中 坡 區 分 別 為 526.37±20.53 及 427.58±23.38 μ g-C/ g d r y s oil。 同 林 相 下 層 土 壤 無 論 微 生 物 生 質 碳 和 氮 含 量 , 皆 比 上 層 低。至 於 微 生 物 生 質 氮 含 量 方 面,亦 以 溪 谷 區 最 低,為 175.94±8.49 μ g-N/ g dr y s oil, 稜 線 區 和 中 坡 區 分 別 為 264.80±20.45 及 228.96±7.95 μ g-N/ g dr y s oil (表 十 )。 稜 線 剖 面 方 面 生 質 碳 及 氮 含 量 , 皆 以 最 上 層 為