國 立 交 通 大 學
分子科學研究所
碩士論文
以 FTIR 探討 2-吡咯甲醛的氫鍵自結合、異結合
及構型轉換現象
FTIR Studies on the Self-Association Accompanying
Cis-Trans Isomerization for 2-Pyrrolecarbaldehyde,
and on its Complexation with Benzene and Toluene
研 究 生:楊凱婷
指導教授:陳振興 博士
以FTIR探討2-吡咯甲醛的氫鍵自結合、異結合
及構型轉換現象
FTIR Studies on the Self-Association Accompanying
Cis-Trans Isomerization for 2-Pyrrolecarbaldehyde,
and on its Complexation with Benzene and Toluene
研 究 生:楊凱婷 Student:Kai-Ting Yang
指導教授:陳振興 博士 Advisor:Dr. Jenn-Shing Chen
國立交通大學
分子科學研究所
碩士論文
A ThesisSubmitted to Institute of Molecular Science College of Science
National Chiao Tung University in Partial Fulfillment of the Requirements
for the Degree of Master in
Molecular Science August 2008
以 FTIR 探討 2-吡咯甲醛的氫鍵自結合、異結合及構型轉換現象 學生: 楊凱婷 指導教授: 陳振興 博士 國立交通大學分子科學研究所 摘要 2-吡咯甲醛透過分子間氫鍵的自結合被視為研究蛋白質中 β-折疊片 基本架構的模型。而 β-折疊片在生化領域上與蛋白質中的二級結構α-螺旋體同樣重要。我們欲探討2-吡咯甲醛在鈍性、非極性及低極性的溶 劑中,因氫鍵而形成自結合之單雙體平衡及因單體之構型轉換而形成的 順反兩式平衡。於固定溫度及相同溶劑中,利用 FTIR 光譜在不同濃度 下的順式單體、反式單體及雙體N-H 吸收度的變化,代入我們新推導的 四個公式,以求出順式單體吸收係數(εc)、反式單體吸收係數(εt)、雙體 吸收係數(εd)、單雙體自結合平衡常數(Kd)及構型轉換平衡常數(Ki)。根 據平衡常數隨溫度變化的關係,利用 van’t Hoff 理論作圖,可求得在不 同溶劑系統下之單雙體自結合與構型轉換的標準反應焓(Δ Ho)及反應熵 (Δ So)。並探討溶劑效應對相關熱力學參數的影響。另外我們也導証公 式檢驗雙體的形式為環狀或線性雙體。最後討論2-吡咯甲醛與芳香族化 合物透過氫鍵形成異結合,利用導証的公式求得錯體吸收係數(εx)及異 結合平衡常數(Kx)。比較不同芳香族化合物對異結合的影響。
FTIR Studies on the Self-Association Accompanying Cis-Trans Isomerization for 2-Pyrrolecarbaldehyde,
and on its Complexation with Benzene and Toluene
Student: Kai-Ting Yang Advisor: Dr. Jenn-Shing Chen Institute of Molecular Science
National Chiao Tung University Abstract
Intermolecular interaction for β-sheet protein belongs to the most important and topical biological binding motifs. The self-association of 2-pyrrolecarbaldehyde through hydrogen bonding provides a useful model for it. The coexistence of isomerization of cis-form and trans-form and dimerization of 2-pyrrolecarbaldehyde in n-octane, CCl4, C2Cl4 and C2HCl3
at four different temperatures have been studied by using FTIR spectroscopy. The respective integrated concentration-dependent absorbance of the NH fundamental stretching at a constant temperature in a given solvent for cis-form monomer, trans-form monomer, and dimer were resolved, calculated and then treated based on four derived linear equations (20), (21), (22)and (31) to extract the molar absorpitivity of cis-form monomer (εc), of
trans-form monomer (εt), and of dimer (εd), and the isomerization constant
(Ki) as well as dimerization constant (Kd). Variation of ambient temperature
allows us to obtain the temperature-dependent values of Ki and Kd in a given
solvent, as a result the standard enthalpy (Δ Ho) and entropy (Δ So) of isomerization and dimerization were determined respectively via a van’t Hoff plot. Solvent effect on different values of K, Δ Ho and Δ So for isomerization and dimerization in various dielectric constants of solvents were analyzed. Whether the structure of dimer is cyclic or linear can be determined with equation (47). Finally, the hetero-association of 2-pyrrolecarbaldehyde with aromatic compounds like benzene or toluene through N-H···
π
hydrogen bonding in non-polar solvent C2Cl4 was alsostudied based on equation (58) to obtain the hetero-association constant (Kx)
and molar absorpitivity (εx) of molecular complex. The influence of these
two aromatic compounds on hetero-association with 2-pyrrolecarbaldehyde was also compared.
誌謝
首先衷心感謝我的指導教授 陳振興老師,在老師循循善誘的教導 下,使我在學業及研究上總是充滿好奇心,尤其老師在實驗上給予我很 大的空間及在論文上殷切地指導,使我能順利完成碩士學位。 另外要感謝口試委員王念夏教授及余艇教授,在時間不足下仍撥冗 審閱論文,並給予寶貴的意見,使論文更加完整及充實。 感謝高大宇學長熱心地指導,實驗室學弟伍竑賓及葉于榮使我的研 究生涯更有趣,張智煒學長在學業及各方面的意見使我不敢懈怠,涵靈 及彩娥豐富了我在交大的生活。 感謝一直陪伴在我身邊的 Michael 及阿醜,使我做任何事時都可以 理直氣壯。最後要感謝我的家人的包容及支持,特別是我做任何決定都 支持我的父親及永遠都尊重我的母親。總目錄 中文摘要... I 英文摘要...II 誌謝... III 總目錄... IV 圖目錄... VI 表目錄...XII 第一章 緒論...1 1.1 氫鍵簡介... 1 1.2 影響氫鍵平衡的三種主要因素... 3 1.3 量測氫鍵的方法... 4 1.4 氫鍵結合常見的模式... 5 第二章 理論...7 2.1 摘要... 7 2.2 推導... 8 2.2.1 第一部分 分子間氫鍵的自結合與分子內的構型轉換... 8 2.2.2 第二部分 分子間氫鍵的異結合... 25 第三章 探討 2-吡咯甲醛在不同溶液中的氫鍵自結合、異結合及構型轉換現象...30 3.1 摘要... 30 3.2 實驗... 35 3.2.1 儀器設備... 35 3.2.2 實驗藥品... 36 3.2.3 實驗步驟... 37 3.3IR 實驗部份... 39 3.3.1 2-吡咯甲醛溶於正辛烷溶液 ... 39 3.3.2 2-吡咯甲醛溶於四氯化碳溶液 ... 58 3.3.3 2-吡咯甲醛溶於四氯乙烯溶液 ... 76 3.3.4 2-吡咯甲醛溶於三氯乙烯溶液 ... 94 3.3.5 2-吡咯甲醛和苯溶於四氯乙烯溶液 ...112 3.3.6 2-吡咯甲醛和甲苯溶於四氯乙烯溶液 ... 120 3.4 討論... 128
參考文獻...138
圖目錄 圖2 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統在 15o C,濃度為 0.0293mol L-1時 的IR 光譜 NH 基適解譜線。其中
π
-acceptor 為苯,濃度固定 為0.5 mol L-1。………...………... 29 圖3.1 2-吡咯甲醛於正辛烷系統中,在 35℃時所測得之 NH 基的 IR 光譜圖。濃度由上到下:0.0459 mol L-1,0.0380 mol L-1,0.0300mol L-1,0.0220 mol L-1,0.0140 mol L-1。………. 50
圖3.2 2-吡咯甲醛於正辛烷系統在 35℃,濃度為 0.0459 mol L-1時所 作的NH 基適解譜線。……….. 50 圖3.3 2-吡咯甲醛於正辛烷系統不同溫度下的順式單體位移 υNH對 (D-1)/(2D 1)+ 作圖。其中D 為正辛烷的介電常數。………... 51 圖3.4 2-吡咯甲醛於正辛烷系統的 2 d c A / A 對[B]o作圖。其四組溫度分 別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃,(-□-) 55℃,(-■-) 65℃。………... 51 圖3.5 2-吡咯甲醛於正辛烷系統的A / At c對[B]o作圖。其四組溫度分 別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃,(-□-) 55℃,(-■-) 65℃。………... 52 圖3.6 由公式(20)所得之 2-吡咯甲醛於正辛烷系統的線性圖。其四組 溫度分別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃,(-□-) 55℃,(- ■-) 65℃。……… 52 圖3.7 由公式(21)所得之 2-吡咯甲醛於正辛烷系統的線性圖。其四組 溫度分別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃,(-□-) 55℃,(- ■-) 65℃。……….... 53 圖3.8 由公式(22)所得之 2-吡咯甲醛於正辛烷系統的線性圖。其四組 溫度分別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃,(-□-) 55℃,(- ■-) 65℃。……… 53 圖3.9 由公式(31)所得之 2-吡咯甲醛於正辛烷系統的線性圖。其四組 溫度分別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃,(-□-) 55℃,(- ■-) 65℃。……… 54
圖3.10 2-吡咯甲醛於正辛烷系統中,由 ln Kd對T-1作van't Hoff Plot。
此處的Kd為單雙體自結合平衡常數。………... 55
圖3.11 2-吡咯甲醛於正辛烷系統中,由 ln Ki對T-1作van't Hoff Plot。
此處的Ki為構型轉換平衡常數。……… 55 圖3.12 2-吡咯甲醛於正辛烷系統中,由 1/ 2 m i d d d o A [1 K+ +2(K A / b)ε ]/[B] b 對 1/ 2 d d d (K A / b)ε 作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 35℃,(-● -) 45℃,(-□-) 55℃,(-■-) 65℃。……….. 56
圖3.13 2-吡咯甲醛於正辛烷系統之順式單體的總吸收度 Ac對初始濃 度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃, (-□-) 55℃,(-■-) 65℃。理論線可由公式(49)求得。……….. 56 圖3.14 2-吡咯甲醛於正辛烷系統之反式單體的總吸收度 At對初始濃 度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃, (-□-) 55℃,(-■-) 65℃。理論線可由公式(50)求得。……….. 57 圖3.15 2-吡咯甲醛於正辛烷系統之雙體的總吸收度 Ad對初始濃度 [B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 35℃,(-●-) 45℃, (-□-) 55℃,(-■-) 65℃。理論線可由公式(51)求得。……..… 57 圖3.16 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統中,在 35℃時所測得之 NH 基的 IR 光譜圖。濃度由上到下:0.0452 mol L-1,0.0375 mol L-1,0.0296
mol L-1,0.0215 mol L-1,0.0136 mol L-1。………. 68
圖3.17 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統在 35℃,濃度為 0.0452 mol L-1時 所作的NH 基適解譜線。………... 68 圖3.18 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統不同溫度下的順式單體位移 υNH對 (D-1)/(2D 1)+ 作圖。其中D 為四氯化碳的介電常數。…....………... 69 圖3.19 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統的 2 d c A / A 對[B]o作圖。其四組溫度 分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。……….………... 69 圖3.20 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統的A / At c對[B]o作圖。其四組溫度 分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。………... 70 圖3.21 由公式(20)所得之 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……….... 70 圖3.22 由公式(21)所得之 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……….... 71 圖3.23 由公式(22)所得之 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……… 71 圖3.24 由公式(31)所得之 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……… 72 圖3.25 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統中,由 ln Kd對T-1作van't Hoff Plot。此處的 Kd為單雙體自結合平衡常數。………...……… 73 圖3.26 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統中,由 ln Ki對T-1作van't Hoff Plot。此處的 Ki為構型轉換平衡常數。…………...….……… 73
圖3.27 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統中,由 1/ 2 m i d d d o A [1 K+ +2(K A / b)ε ]/[B] b對 1/ 2 d d d (K A / b)ε 作圖。其四組溫度 分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。………... 74 圖3.28 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統之順式單體的總吸收度 Ac對初始 濃度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-)45℃。理論線可由公式(49)求得。.… 74 圖3.29 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統之反式單體的總吸收度 At對初始 濃度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。理論線可由公式(50)求得。… 75 圖3.30 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統之雙體的總吸收度 Ad對初始濃度 [B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃, (-□-) 35℃,(-■-) 45℃。理論線可由公式(51)求得。……….. 75 圖3.31 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,在 35℃時所測得之 NH 基的 IR 光譜圖。濃度由上到下:0.0459 mol L-1,0.0376 mol L-1,0.0296
mol L-1,0.0215 mol L-1,0.0137 mol L-1。………... 86
圖3.32 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統在 35℃,濃度為 0.0415 mol L-1時 所作的NH 基適解譜線。………... 86 圖3.33 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統不同溫度下的順式單體位移 υNH對 (D-1)/(2D 1)+ 作圖。其中D 為四氯乙烯的介電常數。…...………… 87 圖3.34 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統的 2 d c A / A 對[B]o作圖。其四組溫度 分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。………... 87 圖3.35 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統的A / At c對[B]o作圖。其四組溫度 分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。…………..………. 88 圖3.36 由公式(20)所得之 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。………... 88 圖3.37 由公式(21)所得之 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……… 89 圖3.38 由公式(22)所得之 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……… 89 圖3.39 由公式(31)所得之 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-
圖3.40 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,由 ln Kd對T-1作van't Hoff Plot。此處的 Kd為單雙體自結合平衡常數。……… 91 圖3.41 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,由 ln Ki對T-1作van't Hoff Plot。此處的 Ki為構型轉換平衡常數。………. 91 圖3.42 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,由 1/ 2 m i d d d o A [1 K+ +2(K A / b)ε ]/[B] b對 1/ 2 d d d (K A / b)ε 作圖。其四組溫度 分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。………... 92 圖3.43 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統之順式單體的總吸收度 Ac對初始 濃度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。理論線可由公式(49)求 得。………... 92 圖3.44 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統之反式單體的總吸收度 At對初始 濃度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。理論線可由公式(50)求 得。……….. 93 圖3.45 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統之雙體的總吸收度 Ad對初始濃度 [B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(- □-) 35℃,(-■-) 45℃。理論線可由公式(51)求得。………. 93 圖3.46 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統中,在 35℃時所測得之 NH 基的 IR 光譜圖。濃度由上到下:0.0468 mol L-1,0.0394 mol L-1,0.0318
mol L-1,0.0244 mol L-1,0.0168 mol L-1。………. 104
圖3.47 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統在 35℃,濃度為 0.0281 mol L-1時 所作的NH 基適解譜線。………. 104 圖3.48 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統不同溫度下的順式單體位移 υNH對 (D-1)/(2D 1)+ 作圖。其中D 為三氯乙烯的介電常數。…...………… 105 圖3.49 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統的 2 d c A / A 對[B]o作圖。其四組溫度 分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。……… 105 圖3.50 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統的A / At c對[B]o作圖。其四組溫度分 別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。……… 106 圖3.51 由公式(20)所得之 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。………. 106 圖3.52 由公式(21)所得之 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……… 107
圖3.53 由公式(22)所得之 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……… 107 圖3.54 由公式(31)所得之 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統的線性圖。其四 組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(- ■-) 45℃。……… 108 圖3.55 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統中,由 ln Kd對T-1作van't Hoff Plot。此處的 Kd為單雙體自結合平衡常數。……….. 109 圖3.56 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統中,由 ln Ki對T-1作van't Hoff Plot。此處的 Ki為構型轉換平衡常數。……….………….. 109 圖3.57 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統中,由 1/ 2 m i d d d o A [1 K+ +2(K A / b)ε ]/[B] b對 1/ 2 d d d (K A / b)ε 作圖。其四組溫度 分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃, (-□-) 35℃,(-■-) 45℃。………... 110 圖3.58 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統之順式單體的總吸收度 Ac對初始 濃度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。理論線可由公式(49)求得。… 110 圖3.59 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統之反式單體的總吸收度 At對初始 濃度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。理論線可由公式(50)求得。… 111 圖3.60 圖3.59 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統之雙體的總吸收度 Ad對 初始濃度[B]o作圖。其四組溫度分別為:(-○-) 15℃,(-●-) 25℃,(-□-) 35℃,(-■-) 45℃。理論線可由公式(51)求得。… 111 圖3.61 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,在 35℃時所測得之 NH 基的 IR 光譜圖。濃度由上到下:0.0398 mol L-1,0.0348 mol L-1,0.0299
mol L-1,0.0248 mol L-1,0.0199 mol L-1。其中π-acceptor 為苯,
濃度固定為0.5 mol L-1。………. 117 圖3.62 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統在 15℃,濃度為 0.0404 mol L-1時 所作的NH 基適解譜線。其中 π-acceptor 為苯,濃度固定為 0.4 mol L-1。………. 117 圖3.63 由公式(58)所得之 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統之線性圖;在四 組溫度下,π-acceptor 為苯[X]時,●表示[X]o = 0.4 mol L-1而○ 表示[X]o = 0.5 mol L-1。……… 118 圖3.64 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,π-acceptor 為苯時,由 ln Kx對
圖3.65 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,在 35℃時所測得之 NH 基的 IR
光譜圖。濃度由上到下:0.0397 mol L-1,0.0348 mol L-1,0.0299
mol L-1,0.0247 mol L-1,0.0199 mol L-1。其中π-acceptor 為甲
苯,濃度固定為0.5 mol L-1。………... 125 圖3.66 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統在 15℃,濃度為 0.0248 mol L-1時 所作的NH 基適解譜線。其中 π-acceptor 為甲苯,濃度固定為 0.5 mol L-1。………... 125 圖3.67 由公式(58)所得之 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統之線性圖;在四 組溫度下,π-acceptor 為甲苯[X]時,●表示[X]o = 0.4 mol L-1而 ○表示[X]o = 0.5 mol L-1。……… 126 圖3.68 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,π-acceptor 為甲苯時,由 ln Kx
對T-1作van't Hoff plot。此處的 Kx為異結合平衡常數。………... 127
圖3.69 2-吡咯甲醛於不同溶劑中及四組不同溫度下的順式單體位移
υNH對(D-1)/(2D 1)+ 作圖。其中D 為介電常數。…... 129
圖3.70 2-吡咯甲醛分子經由 C=O 與 pyrrole ring 間 C-C 旋轉所形成的
表目錄 表1 一些分子間氫鍵的熱力學參數值參考……….. 4 表3.1 在不同溫度下,2-吡咯甲醛在正辛烷系統中,於各種濃度時, 順式單體、反式單體及雙體的吸收位置、半高寬與總吸收度。… 45 表3.2 2-吡咯甲醛於正辛烷系統中,在不同溫度下求得之單雙體自結 合平衡常數Kd、構型轉換平衡常數Ki、順式單體吸收係數εc、 反式單體吸收係數εt、雙體吸收係數εd,以及由不同溫度下之 平衡常數所求得的單雙體自結合與構型轉換之標準反應焓 ΔHo及反應熵ΔSo。………... 49 表3.3 在不同溫度下,2-吡咯甲醛在四氯化碳系統中,於各種濃度 時,順式單體、反式單體及雙體的吸收位置、半高寬與總吸收 度。………... 63 表3.4 2-吡咯甲醛於四氯化碳系統中,在不同溫度下求得之單雙體自 結合平衡常數Kd、構型轉換平衡常數Ki、順式單體吸收係數 εc、反式單體吸收係數εt、雙體吸收係數εd,以及由不同溫度 下之平衡常數所求得的單雙體自結合與構型轉換之標準反應 焓ΔHo及反應熵ΔSo。..……… 67 表3.5 在不同溫度下,2-吡咯甲醛在四氯乙烯系統中,於各種濃度 時,順式單體、反式單體及雙體的吸收位置、半高寬與吸收面 積。……….. 81 表3.6 2-吡咯甲醛於四氯乙稀系統中,在不同溫度下求得之單雙體自 結合平衡常數Kd、構型轉換平衡常數Ki、順式單體吸收係數 εc、反式單體吸收係數εt、雙體吸收係數εd,以及由不同溫度 下之平衡常數所求得的單雙體自結合與構型轉換之標準反應 焓ΔHo及反應熵ΔSo。………... 85 表3.7 在不同溫度下,2-吡咯甲醛在三氯乙烯系統中,於各種濃度 時,順式單體、反式單體及雙體的吸收位置、半高寬與總吸收 度。………... 99 表3.8 2-吡咯甲醛於三氯乙烯系統中,在不同溫度下求得之單雙體自 結合平衡常數Kd、構型轉換平衡常數Ki、順式單體吸收係數 εc、反式單體吸收係數εt、雙體吸收係數εd,以及由不同溫度 下之平衡常數所求得的單雙體自結合與構型轉換之標準反應 焓ΔHo及反應熵ΔSo。……….. 103 表3.9 在不同溫度下,2-吡咯甲醛在四氯乙烯系統中,而 π-acceptor 為苯時,於各種濃度時順式單體、反式單體、錯體及雙體的總 吸收度。……… 114
表3.10 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,而 π-acceptor 為苯時,在不同 溫度下所求得之異結合平衡常數Kx及錯體吸收係數εx,以及 由不同溫度下之平衡常數所求得的異結合之標準反應焓ΔHo 及反應熵ΔSo。……… 116 表3.11 在不同溫度下,2-吡咯甲醛在四氯乙烯系統中,而 π-acceptor 為甲苯時,於各種濃度時順式單體、反式單體、錯體及雙體的 總吸收度。……… 122 表3.12 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統中,而 π-acceptor 為甲苯時,在不 同溫度下所求得之異結合平衡常數Kx及錯體吸收係數εx,以 及由不同溫度下之平衡常數所求得的異結合之標準反應焓 ΔHo及反應熵ΔSo。……… 124
第一章 緒論
1.1 氫鍵簡介 氫鍵在生化上扮演了重要的角色,尤其在蛋白質 1-4、去氧核糖核 酸 5、酵素 6或藥物化學中,氫鍵提供其結構穩定的最主要作用力。 蛋白質中的α-螺旋體與 β-折疊片是以 N-H···O=C 為氫鍵結合的形 式,其中β-折疊片透過分子間作用力而形成的聚集方式被發現與老年 癡呆症、傳染性蛋白質疾病與神經性退化疾病有關7。而2-吡咯甲醛 分子透過氫鍵的自結合被視為研究β-折疊片基本架構的模型8。 氫鍵最早的研究在 1920 年發表 9,Latimer 與 Rodebush 在文獻 中提到關於分子在液態中產生自結合的現象,當時自結合現象被認為 可能是由於兩個偶極距(dipole)互相吸引使液體有較高的介電常數所 致,但在比較HCl 與 H2O 時發現,雖然 HCl 的偶極距大於 H2O,但 其在液態中的介電常數卻遠小於H2O,且 H2O 可產生自結合,而 HCl 卻無自結合的現象。此種 H2O 的自結合現象也不能以雙鍵或叁鍵作 解釋,於是解釋為: 以氫原子為核心同時被兩個遵守八隅體的原子吸 引而構成一種弱的鍵結。為當時作者對氫鍵作的解釋。 氫鍵形成的條件為: 當一個質子提供者(proton donor,A-H)去接為高電負度的原子(如: N、 O、S、 F、 Cl、 Br、 I) ,而 B 為含
有孤立電子對的高電負度原子或含有
π
電子雲的未飽和系統(如:芳香族化合物)。氫鍵的能量較共價鍵小但較凡得瓦爾力大,依其作用力 強弱區分為弱 (<3 kcal / mol)、中(3-10 kcal / mol)及強(>10 kcal / mol)的氫鍵三種。氫鍵的作用力可以發生在分子內或分子間。相同的 分子間之氫鍵作用稱為自結合,不同的的分子間之氫鍵作用稱為異結 合,同一分子內之氫鍵作用為分子內氫鍵。分子內氫鍵只會影響分子 之電子結構,但不會改變其物理性質。但具有分子間氫鍵的分子對其 物理性質與不含氫鍵的系統有很大的不同。一般來說,沸點與熔點隨 分子量的增加而增加。分子間氫鍵的鍵結造成表象(apparent)分子量上 升而使沸點與熔點升高。分子間氫鍵使分子的蒸氣壓下降,而為了達 到未含氫鍵時的蒸氣壓,此時溫度必須提高以提供更多的平均動能來 克服氫鍵的吸引力而造成沸點與熔點的升高10。若水不具氫鍵,則在 一大氣壓下其熔點與沸點分別為-90 ℃與 10 ℃,而不是 0 ℃與 100
℃5。分子間氫鍵也提高物質的汽化熱與Trouton’s 常數(Δ Hvap / Tboiling
~ 22 cal / mol K),如水及乙醇分別為 26 與 26.9 cal / mol K 10,因為含
氫鍵的物質需要更高的汽化熱來打斷氫鍵,雖然氫鍵使物質的沸點上
升,但其汽化熱增加得更多而使其偏離 Trouton’s 常數。在氫鍵系統
子間氫鍵的生成也使分子的介電常數及偶極距變大;而形成分子內氫 鍵的分子則介電常數很低。介電常數與偶極距成正比,若分子 A-H 的偶極距為μ,當分子自結合為雙體時 A-H…A-H 的偶極距則為 2 μ,此時介電常數的增加量正比於2μ2至(2μ)2之間。 1.2 影響氫鍵平衡的三種主要因素6,11 (a) 濃度效應: 當濃度上升時,單體與自結合形成的雙體或多體之吸 收度也會上升,而吸收位移的頻率會下降。利用濃度對吸收度的 關係,可求出該分子在特定溶劑中的吸收係數與自結合平衡常數。 (b) 溫度效應: 由於升高溫度會破壞氫鍵的鍵結,使平衡往單體的方 向移動,造成單體的吸收度增加而雙體或多體的吸收度減少;同 時吸收位移的頻率會上升。可藉由改變不同溫度,求出不同溫度 的自結合平衡常數,可求出該分子在特定溶劑中的的相關熱力學 常數。 (c) 溶劑效應: 溶劑的極性大小對分子間氫鍵影響很大。當溶劑的極 性增加時,其介電常數也增加,則溶劑對該分子的吸引力增強, 自結合的強度減弱,平衡往單體的方向移動,使自結合平衡常數 變小;同時吸收位移的頻率會下降,而自結合的標準反應焓與反 應熵的絕對值也會下降。根據文獻,自結合氫鍵的能量與介電常
數的倒數成正比關係 12。 1.3 量測氫鍵的方法 Errera 及 Mollet 於 1936 利用 IR 探討醇類分子在四氯化碳系統中 的氫鍵性質。接著便有許多不同的方法開始研究在非極性溶劑中,醇 類及酚類分子藉由氫鍵作用形成的自結合。一般常用的儀器有核磁共 振 13-20、紅外線光譜 21-26、近紅外線光譜27、紫外光/可見光28、超音 波 29、中子繞射 30、X 射線繞射 31、介電常數 32,33、蒸氣壓 34及熱容 量35,36等的方法。其中又以紅外線光譜與核磁共振法最常被使用。 不同的方法偵測到氫鍵不同的面向,利用 IR、拉曼與微波光譜 偵測氫鍵所觀測的是分子振動運動的變化;NMR 觀測到的是質子的 電子環境改變所造成的化學位移;繞射儀偵測到的是氫鍵鍵長與鍵角 的變化;熱分析儀所觀察到的是氫鍵的鍵能。下表為利用各種物理方 法所測得的一些分子間氫鍵的熱力學參數值。 表 1 一些分子間氫鍵的熱力學參數值參考10
Type of H bond System Phase or
Solvent -△Go (kcal/mol) -△Ho (kcal/mol) -△So (e.u.) Method
O-H···O=C- formic acid vapor - 7.4±0.5 18.1±2.0 IR
acetic acid vapor - 7.3±0.5 18.1±2.0 IR
propionic acid vapor - 7.5±0.6 18.5±2.5 IR
water-dioxane CCl4 - 3.3-3.7 - NMR phenol-acetone CCl4 1.5 4.7±0.3 10.8±1.0 IR O-H···O- phenol-dioxane CCl4 0.93 5±0.2 13.9±0.7 IR phenol-dioxane isooctane - 5.5±0.1 - UV phenol-n-butyl ether CCl4 1.09 5.7±0.1 15.5 IR -N-H…N Indole-pyridine CCl4 -0.81 3.6±1.2 9.6±4.0 IR pyrrole-pyridine CCl4 0.54 3.2 8.9 IR aniline C6H12 -0.54 1.69±0.22 7.7 IR aniline-pyridine C6H12 0.3 3.43 10.5 IR -N-H···O=C- 3,5-dimethypyrazole CCl4 - 4.6±0.4 - IR γ-butyrolactam CCl4 1.66 3.5±0.4 6.2 IR 2-pyridone CCl4 2.63 4.4±0.4 6.0 IR 1.4 氫鍵結合常見的模式 本實驗室之前處理的氫鍵結合模式為單體-環狀雙體自結合系 統,利用具有較大立體障礙的醇類如: 2,2-二甲基-3-乙基-3-戊醇 ( 2,2-dimethyl-3-ethyl-3-pentanol 簡稱 DMEP ) 及 3-乙基-2-甲基-3-戊 醇( 3- ethyl-2-methyl-3-pentanol 簡稱 EMP )作自結合,以確保該分子 不會形成線性雙體或多體。其他文獻的處理模式則有線性連續自結合 模 式 14,26: 其 假 設 醇 類 的 OH 基以線性方式自結合,在平衡時 K1=K2=K3=…Kn。另有單體雙體多體模式 37: 也認為醇類為線性自結 合,但是雙體的平衡常數K1則不同於多體平衡常數 K2=K3=…Kn,若
加,証明自結合不會只停留在雙體;但當遇到較大立體障礙的分子則 雙體的平衡常數不再隨濃度增加而改變。最後還有一種模式為單體三 體多體模式: 其假設雙體的量很少而忽略且環狀三體為一種穩定的 六圓環結構,因此推斷最小的自結合單位為三體38。 我們選擇2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)分子利用 N-H···O=C 為氫鍵作自結合,在處理單雙體自結合系統時,發現該分子即使在鈍 性溶劑或非極性溶劑中中仍存在兩種構型異構物。因此我們導証新的 公式,以考慮單雙體自結合與構型轉換兩種平衡的存在,並將該分子 溶解在正辛烷、四氯化碳、四氯乙烯及三氯乙烯四種不同的系統中, 觀察溶劑效應對相關熱力學參數的影響。在後兩組系統,我們加入苯 (benzene)或甲苯(toluene)作為
π
-質子接受者(π
-acceptor)於之前的四 氯乙烯系統中形成錯體(complex),此為異結合系統。第二章 理論
2.1 摘要
在探討 2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)利用 N-H 及 C=O 的分 子間氫鍵,形成環狀雙體而產生單雙體自結合平衡時,同時存在另一
種平衡,即單體本身 pyrrole ring 與 C=O 中間的 C-C 鍵旋轉而形成順
反兩式平衡。我們嘗試在第一部分推導新的公式,並利用 IR 光譜於 固定溫度中在不同濃度下的順式單體、反式單體及雙體 N-H 吸收度 的變化,求出順式單體吸收係數εc、反式單體吸收係數εt、雙體吸收 係數單εd、單雙體自結合平衡常數Kd及構型轉換平衡常數Ki。另外, 在此兩種平衡共存的同時,加入芳香族化合物(aromatic compound)作 為
π
-質子接受者(π
-acceptor),可與單體結合成另一種氫鍵,稱為異 結合,此為第三個平衡,利用第一部分求得的順式單體吸收係數εc及 反式單體吸收係數εt代入在第二部份推導的公式,並利用 IR 光譜於 固定溫度中在不同濃度下的順式單體、反式單體及錯體 N-H 吸收度 變化以求得錯體吸收係數εx及異結合平衡常數 Kx。2.2 推導 2.2.1 第一部分 分子間氫鍵的自結合與分子內的構型轉換 考慮溶質 B 如 2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)在溶劑中,因 順式單體(pyrrole 與 C=O 在同一邊)利用分子間氫鍵形成環狀雙體的 單雙體自結合平衡,及因 C-C 鍵旋轉造成分子由順式單體到反式單 體(pyrrole 與 C=O 在相反邊)的順反兩式平衡,因此有兩種平衡同時 存在。 c B →← Bt (1) 2Bc →← B2 (2) Bc、Bt及 B2分別表示順式單體、反式單體及環狀雙體;而[Bc]、[Bt] 及[B2]分別為其濃度。 構型轉換平衡常數Ki表示為 t i c B K B ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ = ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ (3) 單雙體平衡常數Kd表示為
[ ]
2 2 d c B K B = ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ (4) 初始濃度[B]o與反應後的順式單體、反式單體及雙體平衡濃度分別為 [Bc] 、 [Bt]及[B2]須滿足質量守恆關係[ ]
B o =⎣ ⎦ ⎣ ⎦⎡ ⎤ ⎡ ⎤Bc + Bt +2[ ]
B2 (5) 將(3)及(4)式改為[ ]
2 1 i d c c t K B K B B B ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ = = ⎡ ⎤ ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ ⎣ ⎦ (6) 由合比定理、(6)及(5)式得[ ]
2[ ]
1 2 1 2 1 2 i d c i d c c c t o K K B K K B B B B B B + + ⎡ ⎤⎣ ⎦ + + ⎡ ⎤⎣ ⎦ = = + + ⎡ ⎤ ⎡ ⎤ ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ ⎣ ⎦ ⎣ ⎦ (7) 將(7)式移項得[ ]
1 2 o i d c c B K K B B = + + ⎡ ⎤⎣ ⎦ ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ (8) 將(3)式代入(8)式得[ ]
o 1 i 2 d c t i B K K B B K + + ⎡ ⎤⎣ ⎦ = ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ (9) 將(4)式代入(8)式得[ ]
[ ]
2 1 i 2 d c o d c B K K B B K B + + ⎡ ⎤⎣ ⎦ = ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ (10)由比爾定律(Beer-Lambert's law)知,若 Ac、At及 Ad為該分子的
順式單體總吸收度、反式單體總吸收度及環狀雙體總吸收度,則 ( ) ( ) c c c c c c band band A =
∫
Aν ν
d =∫
ε ν
b B d⎡ ⎤⎣ ⎦ν ε
= b B⎡ ⎤⎣ ⎦ (11) ( ) ( ) t t t t t t band band A =∫
Aν ν
d =∫
ε ν
b B d⎡ ⎤⎣ ⎦ν ε
= b B⎡ ⎤⎣ ⎦ (12)[ ]
[ ]
2 2 ( ) ( ) d d d d band band A =∫
Aν ν
d =∫
ε ν
b B dν ε
= b B (13) 其中εc、εt及εd為該分子之順式單體吸收係數、反式單體吸收係數及 環狀雙體吸收係數,ν
表波數,單位為 cm-1,而ε ν
( ) 及 A( )ν
表物質 在該波數ν
下之吸收係數及吸收度,b 為光徑長度,可由干涉圖譜 (interference pattern)測得,請參考附錄一。 將(11)式中的[Bc],代入(8)式得[ ]
2 2 1 2 ( ) ( ) o i d c c c c B K K A Aε
bε
b + = + (14) 將(12)式及(11)式中的[Bt]及[Bc],代入(9)式得[ ]
2 1 2 ( ) ( ) o i d c t i t i t c B K K A A Kε
b Kε ε
b + = + (15) 將(13)及(11)式中的[B2]及[Bc],代入(10)式得[ ]
2 (1 ) 1 ( ) [ ] o i c d d d d c B K A b K Aε
ε
ε
+ = + (16) 此分子雙體的總吸收度遠大於單體總吸收度,為減小作線性迴歸 時的誤差,將(14)、(15)及(16)式中的 Ac轉變為 Ad。分別將(4)及(13) 式改為[ ]
1/ 2 1/ 2 2 c d B B K = ⎡ ⎤ ⎣ ⎦ (17)[ ]
2 d d A B bε
= (18) 將(17)式代入(11)式中的[Bc]後,再以(18)式的[B2]代入替換得1/ 2 1/ 2 1/ 2 1/ 2 ( c ) c d d d b A A K
ε
ε
= (19) 將(19)式分別代入(14)、(15)及(16)式中的 Ac得[ ]
1 / 2 1 / 2 1 / 2 3 / 2 1 2 ( ) ( ) o i d d c c c d B K K A Aε
bε ε
b + = + (20)[ ]
1 / 2 1 / 2 1 / 2 3 / 2 1 2 ( ) ( ) o i d d t i t i t d B K K A A Kε
b Kε ε
b + = + (21)[ ]
1/ 2 1/ 2 1/ 2 1/ 2 1 2 1 ( ) ( ) o i d d d d d B K Aε
b Kε
b A + = + (22) 利用(20)式,以Y =[ B ] / Ao c對X = Ad1 2/ 作線性迴歸,可得截距 Qc及斜率 Pc 1 i c c K Q bε
+ = (23) 1 / 2 1 / 2 3 / 2 2 d c c d K P bε ε
= (24) 利用(21)式,以Y =[ B ] / Ao t 對X = Ad1 2/ 作線性迴歸,可得截距 Qt及斜率 Pt1 i t i t K Q K
ε
b + = (25) 1 / 2 1 / 2 3 / 2 2 d t i t d K P Kε ε
b = (26) 利用(22)式,以Y =[ B ] / Ao d 對X Ad 1 2/ − = 作線性迴歸,可得截距 Qd及斜率 Pd 2 d d Q bε
= (27) 1 / 2 1 / 2 1 / 2 1 i d d d K P Kε
b + = (28) 將(27)式移項可求得εd 2 d d Q bε
= (29) 在(23)-(28)式中,因參數的相依性,若欲求得其他參數εc、εt 、 Kd及 Ki,則須再推導除(20)、(21)及(22)式外第四條公式,以求取第 四組斜率及截距。因此分別將(11)、(12)及(13)式中的[Bc]、[Bt]及[B2] 代入(5)式,並移項得[ ]
2 d c t o d c t A A A B b b bε
ε
ε
− = + (30) 將(23)、(25)及(27)式中的εcb、εtb 及εdb 代入(30)式,除以 Ac後並移 項得[ ]
[( ) ] 1 1 o t t i c d d c c i i c B A Q K Q A Q A = A +K + +K + A (31) 利用(31)式,以Y =[ B ] / Ao c 對X =A / Ad c作線性迴歸,可得截距Q4 及斜率P4 4 ( )( ) 1 1 t t i c c i i A Q K Q Q A K K = + + + (32) 4 d P =Q (33) 由(31)式求得的的 P4應與(22)式的 Qd相同,即Q / Pd 4 = 。因此可由1 實驗求得Q / P 之值是否接近於 1,以此檢驗d 4 εd的準確度。 推導公式(20)-(22)及(31)式時的主要假設為:(a) 溶質吸收度遵守比爾定律(Beer-Lambert's law),以吸收度不超過 1.5 為主,因此須注意溶液的濃度範圍。
(b) 該分子的雙體形式只有一種,為環狀雙體,由順式單體藉由分子 間氫鍵鍵結而成。
(c) 溶質與溶劑間無氫鍵作用,因此須注意溶劑的選擇。 (d) 溶液為理想溶液,在固定溫度下的平衡常數 K 及吸收係數ε為定 值。因此由(11)及(12)式,代入(3)式可知,溶質在同一溶劑及溫 度下,At/Ac為定值。 由適解(fitting)得知,在相同溶劑及溫度時,該分子的 At/Ac比值 為固定比例。若分子在不同的溶劑及溫度時,由實驗及適解(fitting) 求得的值會有不同。將(32)式中的 Ki 移項後,再代入由適解(fitting) 得知的At/Ac比值,可求得 Ki 4 4 ( ) c i t t c Q Q K A Q Q A − = − (34) 分別將(23)及(25)式中的εc及εt移項後,再代入由(34)式求得的 Ki,可 求得εc及εt 1 i c c K Q b
ε
= + (35) 1 i t i t K K Q bε
= + (36) 將(28)式中的 Kd1/2 移項並乘以平方後,再代入由(29)及(34)式求2 2 (1 i) d d d K K P
ε
b + = (37) 由(29)及(34)- (37)式,可分別求得εd 、Ki、εc、εt及Kd五個參數。 另外,可由下面三個公式(42)、(43)及(44)式,檢驗實驗的準確 度。將(23)-(25)及(28)式改為: 1+ Ki =Qc cε
b (38) 1 / 2 1 1 / 2 3 / 2 2 d c c d K = Pε ε
b (39) 1 i t t i K Q K bε
= + (40) 1/ 2 1 / 2 1 / 2 1 i d d d K K Pε
b + = (41) 將(38)及(39)式代入(28)式,經移項消去後,再以(29)式的εd代入替換 得 1 c d c d P P Q Q = (42) 將(40)及(41)式代入(26)式,經移項消去後,再以(29)式的εd代入替換得 1 t d t d P P Q Q = (43) 將(39)及(40)式代入(26)式,經移項消去後,再以(38)式的 1+Ki 代入 替換得 1 c t c t P Q Q P = (44) 由實驗求得之值分別代入(42)、(43)及(44)式,其值越接近 1,表示實 驗的準確度越高。
最後,利用不同溫度下求得的 Kd或Ki值,分別作 van’t Hoff plot,
o o ln K =( S / R ) ( H / RT )
Δ
−Δ
,以Y =ln K 對X =T−1作線性迴歸,可 得斜率 o H / R Δ − 及截距 o S / RΔ
,可求出單雙體自結合或構型轉換的 ΔHo及ΔSo。在量測的溫度範圍內,ΔHo及ΔSo不隨溫度變化。 雙體的氫鍵鍵結形式為環狀雙體或線性雙體,一直是引起討論 話題。為了證明雙體型式,我們推導以下公式驗證。假設若是環狀 雙體型式,所有環狀雙體的 N-H 皆形成氫鍵,因此並無雙體的終端 基訊號,即環狀雙體無單獨的 N-H 振動吸收,而未形成氫鍵的 N-H 吸收全部來自單體;反之,若是線性雙體的型式,則含有未形成氫鍵的 N-H 吸收,為雙體的終端基訊號。若此部份的總吸收度與單體的 N-H 的總吸收度重疊時,可用以下公式驗證。 首先假設若雙體是線性雙體,則單體及內含雙體終端基的總吸收度為
[ ]
2 m c c t t mA
=
ε
b B
⎡ ⎤
⎣ ⎦
+
ε
b B
⎡ ⎤
⎣ ⎦
+
ε
b B
(45) 其中εm為未形成氫鍵的雙體終端基吸收係數。 將(45)式除以[B]o,再分別以(8)-(10)、(4)及(13)式代入替換得[ ]
1 2 d d c t i m d m d d o i d K A b bK b b A B K A K bε
ε
ε
ε
ε
+ + = + + (46) 經整理後得[ ]
m (1 i 2 d d ) ( c t i) m d d d d o A K A K A K K B b + +ε
b =ε
+ε
+ε
ε
b (47) 利 用 (47) 式 , 以 m 1 i 2 d d d[ ]
o Y =[ A ( +K + K A /ε
b )] / B b 對ε
= =ε
+ε
m P =
ε
。如果雙體為線性型式,則P 和 Q 都存在,畫出的直線為一 條有斜率且斜率大於零的線;若雙體為環狀型式,則只有Q 存在,P 不存在,畫出的直線為一條水平線。 Prokopenko39等人在研究內醯胺類 (lactam)系統時,探討環狀雙 體平衡常數及熱力學參數與環大小變化的關係時,在3000-3300 cm-1 附近 C=O 的倍頻(1st overtone)吸收與形成氫鍵的 N-H 吸收產生干 擾,無法準確地計算雙體的總吸收度,因而只使用單體的總吸收度來 決定單雙體平衡常數。其利用的公式如下:[ ]
1 1 8 4 d o d K B A Kε
⎡⎢− + + ⎤⎥ = ⎢ ⎥ ⎣ ⎦ (48) 其中Kd為單雙體平衡常數,而A 及ε為單體的總吸收度及吸收係數。 其公式的計算結果,可視為單體的總吸收度對初始濃度的理論線,只 適用於單雙體平衡時。在我們研究的分子同時存在單雙體平衡與構型 轉換時,因此新的理論線的導証如下: 將(14)式的兩邊乘以 Ac、移項及因式分解後,可得順式單體的總吸收 度對初始濃度的理論線[ ]
2 (1 ) 8 (1 ) 4 c c i d o i d b A K K B K Kε
⎡ ⎤ = ⎢ + + − + ⎥ ⎣ ⎦ (49) 利用(3)、(11)及(12)式代入(49)式,以替換公式中的εcb,經移項及消去後, 可得反式單體的總吸收度對初始濃度的理論線[ ]
2 (1 ) 8 (1 ) 4 i t t i d o i d K b A K K B K Kε
⎡ ⎤ = ⎢ + + − + ⎥ ⎣ ⎦ (50) 將(22)式的兩邊乘以 Ad、移項及因式分解後,可得雙體的總吸收度對 初始濃度的理論線[ ]
2 2 (1 ) 8 (1 ) 16 d d i d o i d b A K K B K Kε
⎡ ⎤ = ⎢ + + − + ⎥ ⎣ ⎦ (51) 因此利用上述(49)、(50)及(51)式,分別由順式單體、反式單體及雙體 的總吸收度對初始濃度的變化作圖,可得三條理論線以檢驗實驗所求 得之值。 本實驗室之前 40,41利用 IR 探討在鈍性溶劑、非極性溶劑或低極 性溶劑中,因分子間的氫鍵而產生的單雙體平衡,如 2,2-二甲基-3-乙基-3-戊醇( 2,2-dimethyl-3-ethyl-3-pentanol 簡稱 DMEP)、3-乙基-2-甲基-3-戊醇( 3- ethyl-2-methyl-3-pentanol 簡稱 EMP )及 2-乙醯基吡 咯(2-acetylpyrrole)。之前推導的公式如下: 單 體 公 式 2 2 o m m m m [B] / A =( 1/
ε
b)+(2KA /ε
b ) 及 雙 體 公 式 o d d d d [B] / A =( 2/ε
b)+(1/ K bA )ε
,利用此兩公式,從適解(fitting)單體 的總吸收度對初始濃度的變化,以Y=[B] / A 對o m X=A 作線性迴歸,m 由截距及斜率得εm 及 K;從適解(fitting)雙體的總吸收度對初始濃度 的變化,以Y=[B] / A 對o d X=1 / A 作線性迴歸,由截距及斜率得d εd 及 K。而從此兩公式所分別求出的 K 值即為單雙體平衡常數,可由 此兩個 K 值的差異檢驗實驗品質的好壞。此方法與前人 39只用單體 來決定平衡常數不同的地方,在於首先用單雙體總吸收度的兩個部分 來處理自結合系統,但前提是溶液系統只由單一形式的單體和環狀雙 體存在。但是要尋找適用於此公式的化合物是有困難的,即須找到在 IR 光譜 N-H 或 O-H 振動吸收範圍裡,單雙體吸收峰要分開得越明顯 越不會互相干擾、在雙體部分需有較強的吸收、雙體須為環狀而不是 線性、沒有環狀或線性多體產生。之前本實驗室找到DMEP 及 EMP 兩種具有立體障礙的醇類在一定的溫度範圍內,是以平面的環狀雙體 自結合 33,即可符合公式的假設。因線性氫鍵大多不會停留在雙體, 而會形成三體以上 42,43。本實驗室之前也研究過 2-乙醯基吡咯 (2-acetylpyrrole)在四氯化碳、四氯乙烯、正辛烷及三氯甲烷溶劑中,利用N-H 和 C = O 形成氫鍵的自結合行為時,其所使用公式的假設 也與之前相同,但在處理三氯甲烷的系統時,發現單體吸收須有兩個 不同頻率的吸收峰才能適解(fitting)好且此兩根吸收峰的總吸收度有 一定的比值,即兩者之間存在著平衡關係,應為不同的構型異構物所 致。因此2-乙醯基吡咯(2-acetylpyrrole)溶解在較具極性的溶劑中如三 氯甲烷,存在著兩種單體(順式單體和反式單體)和一種雙體(環狀雙 體)。之前在處裡這類系統時,只以雙體的的總吸收度帶入上述的雙 體公式以求出相關的參數,但未處理兩種單體的的總吸收度。 因此我們極欲想處理在較極性溶劑中,上述此類分子因 C-C 鍵 旋轉所表現出的兩種單體(構型異構物)問題。而在探討 2-吡咯甲醛 (2-pyrrolecarbaldehyde)溶解在四種不同的溶劑時(四氯化碳、四氯乙 烯、正辛烷及三氯乙烯),發現即使在鈍性或非極性的溶劑中,單體 吸收仍有兩個吸收峰的現象,且隨著溶劑介電常數變大,較低吸收頻 率之單體的總吸收度相對於較高吸收頻率之單體的總吸收度比例也 變大。在相同溶劑及定溫下此兩種單體的總吸收度比值固定,因此可 判斷此兩種單體存在著平衡關係,應為順反兩式異構物。
因 pyrrole ring 連接 C=O 的 SP2平面結構,且pyrrole ring 的 π 電
子具有較強的芳香性,會與 C=O 產生共振而使整個分子為平面結
(partial double bond),因此 C-C 鍵仍有機會旋轉而形成構型異構物,
即順式單體及反式單體。根據許多研究資料顯示 8,44-46,在順式單體
時(pyrrole 與 C=O 在同一邊)較在反式單體(pyrrole 與 C=O 在相反邊)
時穩定,因此2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)的單體以順式單體為
主;但在增加溶劑的極性時,則反式單體的相對比例會提高。因順式
單體的N-H 與 C=O 的偶極距(dipole moment)的方向相反;而反式單
體的N-H 與 C=O 的偶極距(dipole moment)的方向相同,使得反式單
體的極性較順式單體大。極性較大的溶劑會與較極性的反式單體互相 吸引,使反式單體產生較穩定的狀態稱為reaction-field stabilization, 以降低轉動異構物間的自由能差異44,46。當極性溶劑的極性越大,越 能穩定較極性較大的反式單體,因此反式單體的相對比例越大。而由 統計熱力學的觀點來觀察時,根據Boltzmann distribution 的理論,越 穩定的分子其所分佈的比例會越大。也符合因順式單體較反式單體穩 定,而以順式單體為主要的分佈;但當溶劑極性增加時,溶劑的偶極 距(dipole moment)會與反式單體的偶極距(dipole moment)互相吸引而
使反式單體更穩定,即為 solute-solvent interaction46,因此反式單體的
比例會增加。
由上述可知,2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)的兩種單體中, 較低吸收頻率的單體應為反式單體,較高吸收頻率的單體應為順式單
體。由文獻得知8,44-46,2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)結合成雙體 時為環狀雙體,與我們之前公式的假設相同。若溶劑的介電常數增大 時,即溶劑的極性增大,會與較極性的反式單體互相吸引而使反式單 體穩定。 以上所推導出的方法,是分別利用溶劑中化合物的順式單體、反 式單體及環狀雙體的總吸收度,在固定溫度但不同濃度下的改變,分 別求出順式單體吸收係數εc、反式單體吸收係數εt、雙體吸收係數單 εd、單雙體自結合平衡常數 Kd及順反兩式平衡常數 Ki。對於順反兩 式單體或單雙體的總吸收度重疊的部份,我們利用Galactic 公司所出 品的軟體 GRAM32AI 中的高斯—勞倫茲(Gauss-Lorentz)混合適解分 佈曲線公式,可將總吸收度重疊的部份分離出來,代入我們之前推導 的公式,以求出不同的參數。另外,我們也欲得知此化合物在不同溶 劑下的溶劑效應,及不同溫度下對氫鍵及構型轉換的影響。
由於 FTIR 時計(time scale)夠快,可從光譜看到不同的振動吸收 峰,該分子的單雙體吸收在光譜圖上為很明顯的兩個吸收峰,約在
3460cm-1 附近為單體吸收峰,而約在 3277cm-1 附近為雙體吸收峰。
氫鍵形成時,其 N-H 伸張頻率會往低頻率移動,改變的頻率越大(Δν)
則氫鍵越強 44,而半高寬也會變大。當此分子的 N-H 與另一分子的
小,因
ν
=(1/ 2 )π
k u/ ,而使N-H 的振動頻率變小。 Asprion47等人利用FTIR 研究醇類的自結合時,假設溶液存在單 體-雙體-多體,並利用高斯—勞倫茲(Gauss-Lorentz)函數將之分離出 來,以求出自結合平衡常數。Schwager26等人研究乙醇的自結合時, 假設溶液存在單體-線性雙體-線性多體,利用單體的總吸收度求出兩 個平衡常數。Prokopenko39等人研究內醯胺類 (lactam)分子的自結合 時,假設溶液存在單體-環狀雙體,也利用單體的總吸收度求出平衡 常數。大部分理論都只利用單體的總吸收度求平衡常數,因為雙體的 的總吸收度會有其他干擾。在選擇單雙體系統時,須注意單雙體的吸 收 峰 越 分 開 越 好 , 雙 體 的 總 吸 收 度 沒 有 多 體 的 吸 收 及 倍 頻(1st overtone)的干擾,雙體吸收越強越好適解(fitting)。因此選擇 2-吡咯 甲醛為研究的化合物時,可以符合上面的條件,也符合我們想要探討 構型異構物的假設。 2.2.2 第二部份 分子間氫鍵的異結合 此部份我們加入苯(benzene)或甲苯(toluene),以利用π
電子雲作 為質子接受者(簡稱π
-acceptor) ,探討自結合外的另一種氫鍵結合, 為異結合。在第一部分中,我們是探討質子提供者(A-H,簡稱 donor) 與質子接受者(B,簡稱 acceptor)透過分子間氫鍵而形成自結合(如:該分子以N-H 當作 donor,而 C=O 當作 acceptor) 。從靜電學上的觀點
來看,此種氫鍵為 donor 與 acceptor 之間形成一種 dipole-dipole
interaction 或 dipole-charge interaction 而結合。但從化學上的觀點來
看,此種 A-H···B 或 A-H···B-的氫鍵,可視為三原子中心與四個電子
間的交互影響,且在立體障礙可允許的情況下,acceptor(B)提供其已
填滿電子之軌域裡中的電子對,與donor (A-H) 在鍵結的軌域裡產生
互相作用。而此部份欲探討非慣例上常見的氫鍵,文獻中 48 提及
phenyl ring 或 multiple bond 可作為
π
-acceptor,提供π
電子軌域裡的電子與donor 產生作用。從靜電吸引力的觀點,認為是 donor 與
π
電 子雲的負電荷作用,可視為 dipole 與 quadrupole 的互相影響。我們 在探討 2-吡咯甲醛與芳香族化合物(aromatic compound)的異結合 時,2-吡咯甲醛也同時存在自結合,即自異結合共存且競爭的狀態。 但由於芳香族化合物的濃度夠稀薄且定量,我們發現並不會改變原來 單雙吸收峰的位置,但會造成單雙體吸收降低,因此可利用上述的狀 態及由自結合求出的順反兩式單體的吸收係數當作已知,以求出異結 合的關係。圖2 為 2-吡咯甲醛和定量的苯溶於 C2Cl4系統在15o C 時, 濃度為0.0293mol L-1的IR 光譜 NH 基適解譜線。由左而右的吸收峰 分別為順式單體吸收峰、反式單體吸收峰、錯體吸收峰及雙體吸收 峰。不同的π
-acceptor 所產生的錯體吸收峰位置也會不同。越強的π
-acceptor,代表與 donor 的氫鍵越強,錯體吸收峰位置應越往低頻 率移動。 考慮π
-acceptor(X)與溶質(B)形成錯體(BX),而此時的 BX 包含π
-acceptor 與順式單體或反式單體形成的錯體,即 BcX 與 BtX。因 donor 為 N-H 基,而π
-acceptor 為芳香族化合物,因此假設異結合與 構型異構物無關。 B+ X →← BX (52) 異結合平衡常數Kx表示為[ ]
[ ][ ]
[ ] [ ] [ ]
([ ]
) x o BX BX K B X B X BX = = − (53) B、X 及 BX 分別表示單體、π
-acceptor 及錯體;而[B]、[X]及[BX] 分別為其濃度,[X]o為π
-acceptor 的初始濃度。 (53)式經整理得[ ]
[ ]
[ ] [ ]
1 x o K B BX X BX = − (54)利用合比定律得
[ ]
[ ]
[ ]
[ ]
1 x x o K B BX K B = X + (55) (55)式取倒數整理之後得[ ]
[ ]
o x1[ ]
1 X BX = K B + (56) 由比爾定律(Beer-Lambert's law)得知 Ax =ε
xb BX[ ]
,其中Ax及εx分 別為錯體的總吸收度及吸收係數。因此(56)式可改為[ ]
[ ]
1 1 1 ( ) o x x x x X A =ε
b +ε
bK B (57) 而單體濃度為[ ] [ ] [ ]
B = Bc + Bt =( A /cε
cb ) ( A / b )+ tε
t 代入(57)式得[ ]
1 1 ( ) o c t x x x x t c c t X b b A b bK bA bAε ε
ε
ε
ε
ε
= + + (58) 利用第一部分只有單雙體及構型轉換兩種平衡時,所求得的順式單體 及 反 式 單 體 吸 收 係 數 當 作 已 知 代 入(58) 式 。 以Y =[ X ] / Ao x 對c t t c c t X =( b b ) /( bA
ε ε
ε
+ε
bA )作線性迴歸,可得截距Q=1/ε
xb及斜率 1 x x P= /ε
bK 。即可求得錯體吸收係數εx及異結合平衡常數 Kx。 圖2 2-吡咯甲醛於四氯乙烯系統在15o C,濃度為0.0293mol L-1 時的 IR光譜NH 基適解譜線。其中π
-acceptor 為苯,濃 度固定為 0.5 mol L-1。 -.02 .02 .06 .1 .14 .18 .22 .26 .3 .34 .38 3540 3500 3460 3420 3380 3340 3300 3260 3220 3180 Absorbanc e Wavenumber / cm-1第三章 探討 2-吡咯甲醛在不同溶液中的氫鍵自結合、
異結合及構型轉換現象
3.1 摘要 2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)為一含 N-H 官能基的五環雜 環平面分子(pyrrole),另在旁邊外接一個 C=O 官能基。2-吡咯甲醛 (2-pyrrolecarbaldehyde)的分子結構式(順式結構)如下: N C H O H其中N-H 可作為質子提供者(proton donor,簡稱donor),而 C=O為
質子接受者(proton acceptor,簡稱acceptor),符合構成氫鍵的條件,
因此分子的N-H 會與另一分子的C=O形成分子間氫鍵。根據文獻顯
示48,氫鍵是有方向性且donor (A-H)與 acceptor (B)呈直線的關係,
但是∠A-H-B 仍可有些許角度的變化。若 2-吡咯甲醛有分子內氫鍵
的產生,則此∠A-H-B的角度為接近 90度,因此2-吡咯甲醛應無分
子內氫鍵。Dubis44 等人在研究此分子及其他類似分子如 methyl
pyrrole-2-carboxylate (MPC) 、methyl N-methylpyrrole-2-carboxylate
(MPC-NMe)及 N-methylpyrrole -2-carbaldehyde (PC-NMe)時,根據
外根據 Density-Functional Theory 的計算,此分子在單體的狀態下,
順式單體較反式單體穩定,因此以順式單體為主。因 pyrrole ring 為
芳香族的化合物,環內的 π 電子會與 C=O 的 SP2結構形成共振,使
2-吡咯甲醛整個分子為平面結構。但pyrrole ring與 C=O中間連接的
C-C鍵是因共振而產生的雙鍵(partial double bond),因此 C-C鍵仍有
機會旋轉而形成構型異構物,即順式單體及反式單體。其他文獻
45,46,49-53 中利用 1H NMR、13C NMR、dipole moment、molar Kerr
constant、ab initio 及 IR 等不同的方法研究此類分子的構型異構物 時,也證明仍以順式單體為主。2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)的 反式結構如下: N C O H H 我們假設此種順式單體平面結構,使分子透過分子間氫鍵的自結合產 生環狀雙體。2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)的氫鍵自結合如下: N C O H N C H O H
研究資料 8,44,45,顯示此種分子自結合模式為環狀雙體,符合我們的假 設。 本實驗室之前利用NMR方法研究2,4-dimethyl-3-pentanol(DMP) 、3-methyl-3-pentanol (MP)及2,3,4-trimethyl-3-pentanol (TMP)三種立 體障礙醇類於不同溶劑中的單雙體自結合系統,利用 Gutowsky 及 Saika54所提的公式及利用圖解法 20,55,56得到單體位移、自結合常數及 雙體位移,以求出自結合常數、標準結合焓及標準結合熵。上述方法 是假設系統為單純的單雙體自結合,因在NMR的氫譜中只能看到平 均位移,無法看出單雙體的各別位移。若是系統中有錯體的生成、雙 體以上的結合或異構物的可能,則無法由上面方法辨別及求出相關的 參數。這也是IR優於 NMR的原因,在IR光譜中若有其他種的可能 性,較易從光譜不同位置的吸收或從光譜適解(fitting)出不同的吸收以 辨別出來,再加上我們根據不同情形之假設所推導出的公式來驗證可 能的推測,如此便可以利用IR處裡較複雜的系統。 本實驗室之前利用 IR 處理在非極性溶劑中,有立體障礙結構的 醇類如 2,2-二甲基-3-乙基-3-戊醇( 2,2-dimethyl-3-ethyl-3-pentanol 簡 稱 DMEP ) 及 3-乙基-2-甲基-3-戊醇( 3- ethyl-2-methyl-3-pentanol 簡
稱 EMP )以 O-H 基互相結合,或 2-乙醯基吡咯(2-acetylpyrrole)利用
面的環狀雙體自結合,而表現在 IR 光譜圖則是單純的單雙體吸收。 若是醇類沒有立體障礙結構,大多以線性雙體及線性多體結合,則單 體部分可能增加不同的終端基干擾及無法準確適解(fitting)出雙體及 多體的總吸收度,增加分析光譜的複雜度。而 2-acetylpyrrole在極性 的溶劑中如三氯甲烷,在單體位置適解(fitting)出有兩種吸收,判斷 為構型異構物(順式單體和反式單體)。在處理單雙體自結合時,需注 意化合物及溶劑的選擇。 我們選擇2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde)在鈍性、非極性及極 性的溶劑中,欲處理單雙體自結合時,發現單體位置適解(fitting)出有 兩種吸收,在前章的第一部份有推導單雙體自結合與構型轉換的公式 來驗證我們的假設。而我們選擇不同介電常數的溶劑(正辛烷、四氯 化碳、四氯乙烯及三氯乙烯),探討溶劑效應對單雙體自結合及構型 轉換的影響及求出相關的參數。但需注意溶劑的選擇,以非極性或低 極性不會與溶質有強作用力如氫鍵的產生,且溶劑在此化合物的 N-H 基或 O-H 基吸收範圍內不能有很強的吸收,則樣品掃描的結果在背 景無法扣除乾淨時會對光譜造成干擾。而此化合物在非極性系統(四 氯乙烯)中再加入
π
-質子接受者(π
-acceptor),發現在單體與雙體吸收 位置的中間約3410 cm-1附近有吸收,為化合物的N-H作為 donor與π
π
分求得的不同單體吸收係數作為已知,也可求得相關的參數。我們選
擇加入不同的
π
-acceptor 如苯(benzene)及甲苯(toluene),比較其對異結合的影響。 使用 IR 處理氫鍵結合作為定性及定量上的工具時,有下列幾種 可能出現的情形及可以討論的方向: (a) 雙體形式有線性及環狀兩種。若雙體的鍵結形式為線性,則會在 單體的吸收位置附近有未受氫鍵鍵結的終端基吸收,若此終端基 與單體的 N-H總吸收度重疊時,可由公式(47)作線性迴歸得到的 直線判斷,若為有斜率且斜率大於零的線則為線性型式,若為水 平線則為環狀型式。若此終端基的總吸收度未與單體的總吸收度 重疊時,可將溶液作稀釋,看此部分的吸收是否有減少或消失, 因在極稀釋的溶液中只有單體形式,以判斷是否為終端基的吸收。 (b) 若在雙體的吸收位置適解(fitting)出不同的吸收,可能是含有多體 的吸收,此時需注意化合物的結構是否易形成多體,或注意濃度 的控制範圍是否因濃度過大以致形成多體。也可能是因雙體含有 線性及環狀兩種形式。 (c) 可能受 C=O吸收的第一倍頻干擾如內醯胺類 (lactam)系統,若干 擾到雙體吸收,則無法準確地計算雙體的總吸收度。此倍頻也可 能出現在單雙體的吸收位置中間,此時在計算單雙體的總吸收度
時需扣除此部份的總吸收度。 (d) 有些分子可能有轉動異構物的吸收出現在單體或雙體附近。若在 單體的吸收位置適解(fitting)出兩種吸收峰,且此兩種單體的總吸 收度在定溫下成固定比例關係,可判斷此兩種單體存在著平衡關 係,應為構型異構物所致。可由改變不同介電常數的溶劑,看此 比例關係是否隨著溶劑極性的變化而改變。 (e) 若有分子內氫鍵的形成,則此部分的吸收會與由分子間氫鍵形成 的雙體吸收產生重疊或干擾,需注意化合物的分子結構中 donor (A-H) 與 acceptor (B)的排列是否易形成分子內氫鍵。在極稀濃度 時,分子間氫鍵形成的雙體吸收會消失,只剩下未受氫鍵鍵結的 單體吸收,而分子內氫鍵的吸收則不受濃度的影響 57。 (f) 若在非極性的溶劑中加入芳香族化合物作為
π
-acceptor,則在單 體吸收位置附近會有錯合物的吸收。 3.2 實驗 3.2.1 儀器設備1. 使用紅外線光譜儀型號為 Digilab Excalibur HE Series FTS3100,
槽以控制樣品槽溫度,溫度誤差為±1 o C。
2. Omega Model HH22 (Type J-K thermocouple) 電子溫度計。
3. Buck Scientific CaF2樣品槽(cell,光徑分別為0.65mm 及0.6mm)。
實際光徑長度須再加上黏膠的厚度,會比原來樣品槽中間墊圈的
0.5mm厚度大。測量的方法可利用干涉圖譜(interference pattern)測
得58,請參考附錄一。此CaF2樣品槽的優點為不受潮解。
4. Mettler Toledo AB104及Ohaus Explorer E10640 電子天平,精密度
可至小數點第四位。
5. Hamilton 微量注射針筒(1mL, 0.5mL及0.25mL)。
6. Mitsuba 1mL 針筒及 Maru-Kyu 注射針頭。
7. Nichiden-Rika Glass 10ml及50ml 玻璃瓶。
8. Kimble Glass 4ml Vial (小玻璃瓶) 含中空塑膠瓶蓋。
9. Chem Glass white septum stopper (血清栓) 。
3.2.2 實驗藥品
1. 2-吡咯甲醛(2-pyrrolecarbaldehyde ):Acros 藥廠,純度99 %。
2. 正辛烷( n-octane ):Aldrich 及 Acros藥廠,純度99+%。
3. 四氯化碳( carbon tetrachloride ):Merck藥廠,純度 99.8%。