Top PDF 02 基因體的結構與特性

02 基因體的結構與特性

02 基因體的結構與特性

protein方向流傳,表現出各種特定性狀。 在演化過程,粒腺基因和細胞核基因之 間,有許多基因交流現象,合成蛋白質使用 密碼子大致上細胞核基因相同 但有少數密 密碼子大致上細胞核基因相同,但有少數密 嗎子有變異情形。如:

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以計算方式研究基因體結構與變異

以計算方式研究基因體結構與變異

在序列比對方面,我們提出了一個新序列比對演算法來比對兩條含有反轉 或位移序列。透過比對包含反轉或位移事件斷點區域(breakpoint region)序列, 我們可以估計發生事件斷點位置,進而還原事件發生之前序列內容,再透過 傳統序列比對方法得到完整比對果。藉由所提出演算法,我們分析 UCSC 網站上人類黑猩猩基因資料,得到 130 處反轉事件斷點 846 處 位移事件斷點,以及該區域序列完整比對果。另外透過模擬方式,我們 試驗提出方法在比對不同親緣關係物種序列效果。實驗果顯示所提出方 法適用於比對親緣關係高於大鼠(rat)小鼠(mouse)物種序列。
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使用重疊基因建構原核生物的基因體樹

使用重疊基因建構原核生物的基因體樹

我們之前已發展出一個網路伺服器工具稱為OGtree,其可以讓使用者 根據兩兩原核生物基因重疊基因距離來建原核生物基因 樹。類似於基因內容基因次序研究,我們合重疊基因內容(即兩 個基因之間共有直向同源重疊基因平均數)次序(即兩個基 因之間平均重疊基因斷點距離)定義出兩個基因之間重疊基因 距離。但在利用斷點距離來定義重疊基因距離時有一個缺點,即無法將 其應用在多染色基因並計算出他們重疊基因距離。除此之外,
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生長休止基因基因體分析,載體構築及篩選剔除生長休止基因的老 鼠

生長休止基因基因體分析,載體構築及篩選剔除生長休止基因的老 鼠

Gas7-cb 產生蛋白包含 320 個月安 基酸,分子量約 38kDa,分別表現在大腦和 小腦。初步實驗已證實 Gas7 蛋白可 F-actin 直接作用,而且大量表現 Gas7 蛋白可以促進神經母細胞 neurite-like 生長情形。為了解 Gas7 蛋白在活 功能,我們發展出其基因剔除鼠模式。我亦藉由南方吸漬墨點法篩選到 Gas7

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生長休止基因基因體分析,載體構築及篩選剔除生長休止基因的老鼠

生長休止基因基因體分析,載體構築及篩選剔除生長休止基因的老鼠

生長休止基因基因分析,載築及篩選剔除生長休止基因老鼠 生長休止基因 7 和 8 , ( 簡稱 Gas7 and Gas8) ,是利用基因捕捉法從進入生長休止狀態 小鼠纖維母細胞中篩選出來。 Gas7 ,已有報告指出會表現在大腦皮層,海馬迴, 和小腦。在小鼠中發現兩種不同 mRNA 存在,分別是 Gas7 及 Gas7 isoform : Gas7- cb 。 Gas7 產生蛋白包含 421 個月安 基酸,分子量約 48kDa ; Gas7-cb 產生蛋白 包含 320 個月安 基酸,分子量約 38kDa ,分別表現在大腦和小腦。初步實驗已證實 Gas7 蛋白可 F-actin 直接作用,而且大量表現 Gas7 蛋白可以促進神經母細胞 neurit e-like 生長情形。為了解 Gas7 蛋白在活功能,我們發展出其基因剔除鼠模式。
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利用重疊基因建構原核生物的基因體樹之研究

利用重疊基因建構原核生物的基因體樹之研究

隨著DNA定序技術進步,越來越多物種完整基因序列變得更 容易取得。因此,藉由完整基因來建出物種之間演化樹,將有助 於了解物種演化親屬關係。除了以序列為主方法之外,還有利用整 個基因基因內容和基因次序,這些都能被用來建出更準確和穩定 演化樹。然而已有文獻指出,只利用基因內容或基因次序來建微生物 基因樹可能是不合適。為了克服這個問題,Luo所屬研究團隊 最近提出一個利用重疊基因內容來建出細菌演化樹新方法。所謂 重疊基因是指在染色位置相鄰兩個基因,它們序列會部份或全 部重疊。實際上,重疊基因在微生物基因上是非常普遍,而且他 們比非重疊基因在演化上是更具有保留性,這意味著重疊基因在微生 物中是比非重疊基因更適合當作建物種演化關係特徵。事實上,物 種基因在演化過程中是會很容易地發生基因重組,這導致了即使 在兩個親屬關係很近物種上,他們之間直向同源基因次序可能會 不同,這當然也會造成他們之間直向同源重疊基因次序也會不同。
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生長休止基因基因體分析,載體構築及篩選剔除生長休止基因的老鼠

生長休止基因基因體分析,載體構築及篩選剔除生長休止基因的老鼠

Gas7-cb 產生蛋白包含 320 個月安 基酸,分子量約 38kDa,分別表現在大腦 和小腦。初步實驗已證實 Gas7 蛋白可 F-actin 直接作用,而且大量表現 Gas7 蛋白可以促進神經母細胞 neurite-like 生長情形。為了解 Gas7 蛋白在活 功能,我們發展出其基因剔除鼠模式。我亦藉由南方吸漬墨點法篩選到 Gas7 基因剔除鼠。並整理出此老鼠譜系,及目前代數。接著將 Gas7 基因剔除 鼠和野生型 B6 老鼠做交配,以期得到純品系 Gas7 基因剔除鼠。希望能夠 更明顯看到老鼠表型。
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建構新穎的附基因體圖譜的整合平台

建構新穎的附基因體圖譜的整合平台

基因表現,進而調節植物生長發育[3]。 甲基化模式是現今研究重要議 題。基因低甲基化會導致染色不 穩定及增加突變機會,並且在細胞中 甲 基 化 狀 態 可 能 是 引 發 癌 症 因 素 [4]。CpG 位點甲基化可以對基因表現有 重要影響,甲基化組織蛋白可以在表 觀遺傳上壓抑或活躍化基因表現,並且甲 基化可能使基因沉默化,進而使其失去功 能。在正常組織內,基因甲基化主要是 分佈在缺少 CpG 位點編碼區。相反
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以EGFP為報導基因建構登革熱二型病毒PL046株之結構/非結構基因表現載體

以EGFP為報導基因建構登革熱二型病毒PL046株之結構/非結構基因表現載體

Using EGFP as reporter for the construction of expression vectors carrying structural/non-structural. genes from dengue virus type II strain PL046[r]

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利用基因重組方法探討大白鼠AlphaA-水晶體蛋白之功能與結構

利用基因重組方法探討大白鼠AlphaA-水晶體蛋白之功能與結構

For γ-crystallin, three γS-crystallin spots were observed and their spot intensity was decreased with the increase of galactosemic time; while no other γ-crystallins showed decreasing [r]

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實體與其關連的結構特性 陳茂鴻、包冬意

實體與其關連的結構特性 陳茂鴻、包冬意

關連圖是由實,實屬性之間關連所一種圖形語言,不但可以將企業經營業務資料模型化以及用 來輔助資料庫設計工作,同時也可以作為一種溝通工具。在資訊管理領域中,實關連圖是最常使用最重要一 項模型工具。實關連圖製作有其基本語法以及圖形所代表語意資訊,本研究主要探討實關連圖中實配 置關係以及實例子之間對應關係。 本研究以內容分析法中量化統計質化分析做為主要研究方法。在搜集實關連 圖樣本過程中,雖然發現有不少相關文獻,但是合適研究樣本卻不多,因為我們目的是要搜集和分析完整圖例
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奈米新型結構光觸媒粉體製備與特性分析

奈米新型結構光觸媒粉體製備與特性分析

摘要 本研究利用固相法及溶膠凝膠法 合成出具備單一晶相之複合鈣鈦礦相 光觸媒粉。本研究探討固相法跟溶 液法之間差異,比較何種製程可以 合成出具有較佳光觸媒活性複合鈣 鈦礦相粉。當退火溫度改變時,粉 晶性會有所改變,光觸媒性質 也隨之變化。經由亞甲基藍降解反 應測試,BaCo 1/2 Ta 1/2 O 3 是具有最佳光催 化活性。而從 UV-vis 光譜中,

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第二章 人體結構的表象與實體

第二章 人體結構的表象與實體

理則上,骨骼情感隱喻並無直接關係。骨骼形象僅能暗示死 亡、終,或是另一層次永恆,但是由於堅硬礦物質外附蛋白質 型態原模是混合綜合(Complex)一如心靈上複雜意 念外在行為聯繫特質。針對骨骼研究其最終目在於,獲得純 粹化思維,對人直觀。這包含了兩層意義:一為物質上 永恆,骨骼是人最能展現實恆常意義。堅強物質往往是無生 命型態,對於一個活生生人而言,這類似乎了無生命型態物質 竟是我們人類。中世紀聖像畫(Icon)在製作之時以碳酸 鈣白堊粉作八層基底佈塗,以紀念上帝花了七天造世界,第八層代
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在氧化鋅磊晶薄膜物理特性中晶體缺陷結構的角色

在氧化鋅磊晶薄膜物理特性中晶體缺陷結構的角色

本論文得以順利完成,首先我要感謝指導教授徐嘉鴻老師(大媽)及謝文峰老 師,從碩士班到博士班這七年半來,老師對我用心栽培諄諄教誨,讓我學 識和能力不斷提升;在為學及做人態度上,潛移默化亦使我受益良多。其次要感 謝口試委員們對論文指正以及建議,使本論文更臻完善,也讓我對於未來研究 方向以及需要補強地方了然於胸。 同時也要感謝清華大學洪銘輝及郭瑞年 教授所提供高品質成長於矽基板上氧化物緩衝層試片,使得實驗得以順利進行;
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微電子廠房結構體振動特性之分析與減振

微電子廠房結構體振動特性之分析與減振

本計劃應用有限元素法探討微電子廠 房之振動特性各種動態行為特 徵,再加入高鐵通車所產生振動源來分 析傳至光學平台振動分貝數。並利用 阻尼來分析振動值降低情況,發現振 動值降低幅度會隨著阻尼增加而減 少。此外,將高鐵基樁尺寸加大,確實能 降低廠房振動值,但效果並不顯著。材 料 E 值加大對於振動值降低也並不明 顯,且振動值降低幅度也會隨著阻尼值 增加而減少。從不同阻尼值分析數據可 以知道提高系統阻尼值會比提高材料 E 值有更大減振效果。
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應用雷射拖拉法之光罩與立體微結構的製造方法與立體微結構

應用雷射拖拉法之光罩與立體微結構的製造方法與立體微結構

9. 如申請專利範圍第 1 項所述之製造方法,更包含:一雷射光決定步驟,係決定一雷射光 之強度照射時間,並且於該分析步驟中,更依據該雷射光之強度照射時間,使用該 數值分析方法計算得到該光罩之特徵。 10. 一種應用雷射拖拉法之立製造方法,包含:一移動決定步驟,係決定一機台 使一基板相對至少一光罩移動之方向及次數;一微決定步驟,係決定一立 於該基板上之外貌特徵;一分析步驟,係依據該方向、次數以及該外貌特徵,使用一數 值分析方法計算得到該光罩之特徵;一生產步驟,係依據該光罩之特徵製造出該光罩;
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半導體奈米結構之成長與光電特性研究(I)

半導體奈米結構之成長與光電特性研究(I)

最近幾年奈米科技在各國科學界掀起 一股熱潮。奈米科技之所以吸引科學家 注目可以分為尖端元件上技術應用,及 奇妙基礎科學現象之探索。在尖端元件 應用上包括偵測單一光子量子點場效 電晶[1],低臨界電壓量子點雷射二極 [2],及未來可能很有應用潛力量子計 算[3]。至於在基礎科學研究方面包括奈 米長晶動力學及特殊光電效應 [4]。

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氫表面鈍化矽奈米晶體之電子結構與光學特性

氫表面鈍化矽奈米晶體之電子結構與光學特性

第五章、論 在我們工作中以氫原子鈍化球狀矽奈米晶表面並使用 sp d s 3 5 * 緊束縛模型 計算 直徑範圍由 0.5nm 至 7.6nm 矽奈米晶電子能隙,再由矽奈米晶波函數求得 矽奈米晶光吸收振子強度。在考慮大範圍直徑變化下,我們能獲得其他理論方法 相當接近能隙果。在 量子侷限效應作用下 矽奈米晶電子中 導電帶電子基態能量 電子激發態能量隨著奈米晶直徑變小而上升,價電帶電洞基態能量電洞激發態 能量隨著奈米晶直徑減少而下降。因為塊材矽導電帶底部在倒空間中六個 X 點上且電 子共有兩種自旋態,所以直徑較大矽奈米晶基態能量形成十二重簡併。而塊材矽價
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自組裝結構增強茶葉黑色素半導體特性

自組裝結構增強茶葉黑色素半導體特性

黑色素在生物中,扮演保護生物不受陽光、自由基、有機毒物、重 金屬等傷害作用,並且具有奇妙導電特性。從過去文獻紀錄中我們 可以發現,黑色素可以說是生物保護者兼清道夫,擁有各種有趣 能力;除此之外,我們更發現,黑色素經由簡單造通電測量,神奇地 呈現了半導電子元件電性。經由對黑色素導電特性研究,我們將能 更了解其分子電子機制,並改進目前使用有機導電高分子,更進一步將 目前需要多層不同型半導接合才能發揮功能元件改良,使現代繁雜 半導技術在不久將來成為歷史。
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利用核醣核酸的二級結構及基因規劃法找尋其共同結構元

利用核醣核酸的二級結構及基因規劃法找尋其共同結構元

4.3 實驗果 本系統是以 C 語言實作,測試環境作業系統是 Mandrake Linux 10.1,電 腦配備為 Pentium IV 3.2G Hz 中央處理器 2 Giga-bytes 記憶。 所有實驗基因規劃法參數:族群數量 10000、長度突變率 60%、突變 率 20%、重排率 10%、互交率 5%以及重製率 5%。此外,Mfold 所使用次最 佳解比例設為 35%、背景資料個數為輸入序列兩倍。限制部份,若沒 有特別說明,採取十分寬鬆限制:所允許莖幹長度介於三到二十之間,
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