科目名稱:生物化學(一)
(
)
授課單元:DNA的突變與修補
授課單元:DNA的突變與修補
Department of Nutrition and Health Science Department of Nutrition and Health Science
Ching-Sheng Yeh Ph.D. E-mail:[email protected] Teachers’ Office: C533
課程大綱
DNA突變與損傷
1點突變的修補機制
2點突變的修補機制
2結構損傷的修補機制
3一、DNA突變與損傷
DNA突變與損傷
DNA分子是主導 切生物性狀(或表現型)的分子
DNA分子是主導一切生物性狀(或表現型)的分子,
且必須代代相傳,故DNA分子是極穩定的分子。
且必須代代相傳,故DNA分子是極穩定的分子
當DNA分子股線發生斷裂、缺損,或分子中之核
當DNA分子股線發生斷裂 缺損 或分子中之核
苷酸序列產生改變時,會對生物的正常生理狀態
造成影響。
故生物演化過程中,即產生多種修補及矯正DNA
的機制,減少複製時造成的錯誤,以期將損害降
到最低。
突 變
突變的種類 突變的形成與 突變的種類 突變的形成與 引起的因子 基因突變 染色體數目 改變的突變 染色體結構改變的突變 自 發 誘導突變 發 性 突 突變劑 取 代 插入 整 倍 非整 缺 重 倒 易 缺 失 點 突 變 物 化 生 倍 體 X Y 整 倍 體 位 失 複 位 突 變 極少發生 物 理 化學 物 重 複 X,Y 體 X,Y,YDNA的損害類型
DNA的損害類型
內生性的DNA損害類型以影響DNA的初級結構(primary 內生性的DNA損害類型以影響DNA的初級結構(primary structure,例如:核苷酸層次的結構、配對等)為主,只有) 比較嚴重的外生性的DNA損害才有機會造成DNA二級結構 (secondary structure,例如:DNA層次的立體結構改變) 的破壞。 的破壞 DNA初級結構的損害形式主要可以分為五種: 1. 核苷酸鹼基氧化(oxidation):例如:[8-oxo-7,8-dihydroguanine (8含氧的7 8 2氫脫氧鳥苷 8 G)] [Th i l l]等 這 (8含氧的7, 8-2氫脫氧鳥苷, 8-oxoG)],[Thymine glycol]等,這 些主要是細胞內的活性含氧物種(ROS)對DNA的攻擊所造成。另 外,環境中的游離輻射也常會對造成鹼基的氧化作用。 2. 核 苷 酸 鹼 基 烷 化 (alkylation) : 或 常 稱 作 甲 基 化 ( th l ti ) 例如[O6甲基鳥嘌呤 O6 th l i ] (methylation);例如[O6甲基鳥嘌呤, O6-methylguanine], [N7甲基鳥嘌呤, N7-methylguanine],[N3甲基鳥嘌呤, N3-[ y g ] [ methyladenine]等。 3. 核苷酸鹼基去氨化(deamination):例如:[尿嘧啶],就是 由於甲基化的胞嘧啶經過去氨化所形成的。 核苷酸鹼基水解 例如去 呤或去嘧啶作 4. 核苷酸鹼基水解(hydrolysis):例如去嘌呤或去嘧啶作用。 核苷酸鹼基錯誤配對 這常常是導因於 複 5. 核苷酸鹼基錯誤配對(mismatch):這常常是導因於DNA複 製過程中,新合成的DNA單股置入錯誤的核苷酸所導致。 製過程中 新合成的DNA單股置入錯誤的核苷酸所導致引起突變的因子-1
引起突變的因子-1
誘導突變:外在因子(誘變劑)引起的突變:
誘導突變:外在因子(誘變劑)引起的突變:
1) 誘變劑包括: 1) 誘變劑包括: • 輻射線。 • 化學藥品、病毒。 2) 紫外線-引發皮膚癌: • 波長100~380 nm。 • 波長100~380 nm。 • DNA主要吸收波長為200 nm。 • 紫外線易造成DNA斷裂或鹼基成分改變,相鄰的2個嘧啶 鹼基發生共價鍵結合 形成嘧啶二聚體 鹼基發生共價鍵結合,形成嘧啶二聚體(T-T dimer) 。引起突變的因子-2
引起突變的因子-2
3)
化學藥物 亞硝酸(Nit it )易使鹼基改變(C 被取
3)
化學藥物:亞硝酸(Nitrite)易使鹼基改變(C被取
代為U)。
代為U)
4)
病毒:病毒給了致癌基因或阻止了腫瘤壓抑基因
4)
病毒:病毒給了致癌基因或阻止了腫瘤壓抑基因
的功能,例子:
B型肝炎病毒-肝癌(Hepatocellular carcinoma)。 乳頭狀瘤病毒(HPV)-生殖器官癌症。 疱疹病毒-鼻咽癌(NPC)和子宮頸癌(cervical cancer)。 人類T 淋巴球病毒 白血病(血癌) 人類T-淋巴球病毒-白血病(血癌)。1
突變種類
1. 突變種類
DNA的突變依據其產生的效應 主要可分為下列幾種: 1) 誤意突變(missense mutation):因突變導致蛋白質轉 DNA的突變依據其產生的效應,主要可分為下列幾種: 1) 誤意突變(missense mutation):因突變導致蛋白質轉 譯至此位置時,以另一種氨基酸取代原先的氨基酸;例 如,鐮刀型貧血症(sickle cell anemia)的基因突變。 人類血紅素β次單元(β-球蛋白)基 因中產生點突變(point mutation)。 CCTGAG突變為CCTGTG,導致 蛋白質轉譯至第6個氨基酸時 從 蛋白質轉譯至第6個氨基酸時,從 原本的麩胺酸(glutamic acid)改變 成纈胺酸(valine)。 missense mutation-影片(28秒) 2) 無意義突變(nonsense mutation):編碼某 胺基酸的密碼子由於點突變而轉變成無意 一胺基酸的密碼子由於點突變而轉變成無意 義密碼子(nonsense codon),或稱終止碼 (stop codon),這種突變往往造成蛋白質轉 譯至此位置,發生提前中止,合成一條不完 譯至此位置 發生提前中止 合成 條不完 整的多肽鏈。例如: 某些地中海型貧血患者的血色素β-球蛋白基因第37號密碼子由TGG 突變為TAG,當轉錄為mRNA時,TAG的位置產生UAG終止密碼, 突變為TAG,當轉錄為mRNA時,TAG的位置產生UAG終止密碼, 故此意義突變導致核醣體合成一段不完整、無功能的多肽鏈。病患 缺少正常的β-球蛋白,使患者缺乏正常的血色素而造成貧血現象。 3) 讀框轉移突變(frameshift mutation):這種突變導因於核苷酸缺失, 即編碼的三個核苷酸因故缺少一或兩個,或插入一或兩個核苷酸, 造成讀框的改變,在轉錄時,突變點之後的氨基酸序列隨之改變; 在這種情況下,常在到達正常終止碼之前即遭遇異常的無意義密碼 在這種情況下,常在到達正常終止碼之前即遭遇異常的無意義密碼 子,使轉譯中斷。例如: 亞洲人的地中海型貧血患者中,就有許多在第41/42號密碼子中失去4個 核苷酸(5’-TTCTTT-3’ → 5’-TT-3’): 由於上述4個核苷酸的缺失,導致從41號密碼子開始,後續的密碼皆發 生改變,使紅血球無法合成正常的血紅素。 4) 無功能突變(null mutation):指突變導致基因功能完全 消失 或無法產生此基因的 RNA 這種突變經常由於 消失,或無法產生此基因的mRNA,這種突變經常由於 整個DNA片段缺失所造成。例如: 肺癌細胞株H1299的p53腫瘤抑制基因,就是因為具有重要功能 的 片段發生缺失 完全不表現 導致肺細胞轉型為癌細 的DNA片段發生缺失,完全不表現p53,導致肺細胞轉型為癌細 胞。
5) 靜突變(silent mutation):某些構造 基因突變並不影響個體的表現型與性 狀 這種突變稱為靜突變 靜突變的 狀,這種突變稱為靜突變。靜突變的 原因有很多,包括: 可能突變點並未改變編碼。 可能改變的氨基酸不影響蛋白質的功 能。 可能基因體發生反突變(revertant),回 到原先的密碼子 到原先的密碼子。 可能在tRNA的反密碼子發生突變,產 生 抑 制 突 變 的 tRNA , 稱 為 抑 制 性
tRNA (suppressor tRNA),類似負負 tRNA (suppressor tRNA),類似負負
得正的現象。
抑制性tRNA-反向突變例子
mRNA上的編碼由UUG mRNA上的編碼由UUG 突 變 為 UAG ; UAG 為 無意義編碼;不過相對 的 tyrosyl-tRNAtyr反 密 碼 子 也 由 GUA 突 變 為 CUA,使原先無tRNA CUA,使原先無tRNA 與 互 補 的 意 義 編 碼 與 tyrosyl-tRNAtyr反 密 碼 互補,在此位置接上酪 胺 酸 (Tyrosine) , 使 中 斷的轉譯工作得以恢復。 斷的轉譯工作得以恢復。 (白氨酸)2.
突變機制
突變機制
以DNA突變的機制而言,突變可以是單一核苷酸的改變,稱為 點突變(point mutation);也可能是DNA分子或染色體結構上的 1) 點突變: 改變,。 1) 點突變: 單一核苷酸的改變最主要目的來自核苷酸的取代,依 據取代核苷酸類別,可分為轉換(transition)與倒換 (transversion)。 由一種嘌呤取代一種嘌呤、 一種嘧啶取代一種嘧啶 是嘌呤與嘧啶間相互取代導致點突變的突變劑
導致點突變的突變劑
a) 亞硝酸(nitrous acid, HNO2):
HNO2能與核苷酸鹼基反應,使其產生 脫氨作用(deamination)。 胞嘧啶經過HNO22的作用之後,其4’C位 置上的-NH2根被=O所取代,脫去氨基 的胞嘧啶(C)變為尿嘧啶(U),故隨後複 製DNA時,此位置互補的核苷酸由原來 的鳥嘌呤(G) 「轉換」為腺嘌呤(A)。 當第二輪DNA複製時,新DNA股線在 此位置接上與A互補的T,於是原先的 CAG突變產生TAG,轉錄之後,mRNA 在此位置形成一個AUG終止碼,造成一 個無意義突變。
b) 5’- 溴 去 氧 尿 苷 (5’-bromodeoxyuridine, bromodeoxyuridine, BrdU): 在 複製時 會被 BrdU在DNA複製時,會被 誤認為尿苷,而取代原先 的T,與A互補。 由於BrdU在DNA結構上發 生Keto-enol(酮-烯醇)互換, 當DNA複製時,enol結構 當DNA複製時 enol結構 的BrdU轉而與鳥嘌呤(G) 互補,導致下一輪DNA複 互補,導致下 輪DNA複 製時,原先的A.T位置轉 換為G C 換為G.C。 c) Aflatoxin B1: c) Aflatoxin B1: Aflatoxin B1能嵌入DNA結構中,與DNA形成共價鍵結的DNA附加 物(DNA adduct),誘使鳥嘌呤(G)化學結構無法維持,導致DNA突 變,進而使肝細胞轉型為癌細胞。 變 進而使肝細胞轉型為癌細胞 類似形成DNA附加物的致癌物質(carcinogens)。如許多芳香族胺 (aromatic amines)、異環胺(heterocyclic amines)。
d)
)
其他:
其他
紫外線(ultraviolet, UV light):能誘導胸腺嘧啶
(
,
g )
(Thymine, T)雙倍化(thymine dimerization)。
γ-射線(γ-ray):直接打斷DNA股線。
2)
)
DNA股線損傷與染色體結構的改變:
股線損傷與染色體結構的改變
物理與化學因子引起的效應,可能不限於單一或
數個核苷酸的突變,而是DNA片段的損傷或染色
體結構的改變,故影響的範圍不只是單一個基因。
DNA結構改變的形式包括:
1)
缺失(deletion)。
2)
重複(duplication)與崁入(insertion)。
3)
倒位(inversion)。
4)
移位(translocation)。
1).
)
缺失(deletion)
(
)
染 色 體 (chromosome) 的 缺 失是造成多種遺傳疾病與癌 症的主因,產生缺失的原因 可能是高能輻射線造成的斷 裂,造成多種基因的喪失, (同源染色體) 裂,造成多種基因的喪失, 有 些 則 發 生 於 減 數 分 裂 (meiosis)。 當兩條姊妹染色體聯會時, (交叉體) 當兩條姊妹染色體聯會時 有一定的比例的染色體會產 生 互 換 ( ) 造 成 生 互 換 (crossover) , 造 成 基因的重組,在顯微鏡下可 (重組型染色單體) 看到交叉體(chiasmata)。
染色體在減數分裂前期,同源染色體會產生
染色體在減數分裂前期 同源染色體會產生
聯會(synapsis),此時同源染色體有機會產
聯會(synapsis) 此時同源染色體有機會產
生互換。
生互換
如果聯會時產生配對錯誤時 即造成非平均互換
如果聯會時產生配對錯誤時,即造成非平均互換
(
unequal crossing-over)現象,使聯會互換後的產
(
unequal crossing-over)現象,使聯會互換後的產
物有基因缺失現象。
核苷酸的插入與缺失造成移碼突變
核苷酸的插入與缺失造成移碼突變
2).
)
重複(duplication)與崁入(insertion)
複( p
)與崁入(
)
a) 重複(duplication):某些染色體的片段有重複的現象,重複的片段可以 緊臨排列,或者出現在不同位置。為決定某胺基酸的三個連續核苷酸異 常地被重複一次或多次,這樣的結果會影響蛋白質的胺基酸序列。 常地被重複 次或多次,這樣的結果會影響蛋白質的胺基酸序列。 重複現象的產生可能來自於減數分裂前期的非平均互換現象。b)
崁入(insertion):而多數基因體中的重複序列則
由於轉位子(Transposon)的現象。轉位子複製基
因片段過程中 往往涉及崁入作用 即在既有的
因片段過程中,往往涉及崁入作用,即在既有的
基因中,插入一段新的DNA序列,經由演化過程
基因中,插入 段新的DNA序列,經由演化過程
形成蛋白質家族。
類免疫球蛋白功能區家族(immunoglobulin-like domainfamily, Ig-like family)。
表 皮 生 長 因 子 受 體 家 族 (epidermal growth factor
receptor family EGFR family)。 receptor family, EGFR family)
3). 倒位(inversion)
)
倒位(
)
指染色體產生兩處斷裂點,斷裂的片段隨後呈180°度倒轉接 回斷面上使斷裂片段上的基因呈顛倒排列。 人類族群基因庫中,具有倒位的染色體約有2%左右,由於 倒位突變並不造成基因流失 故通常不會影響個體生存。 倒位突變並不造成基因流失,故通常不會影響個體生存。性聯遺傳A型血友病(Hemophilia A)
(
p
)
在X染色體上的第8號凝血因子 基因倒位突變所致,一般認為 造成染色體倒位的原因主要是 非 等 位 基 因 間 的 同 質 型 重 組 (nonallelic homologous recombination)或同一條染色體 上的同質型重組。 上的同質型重組 這種異常基因的攜帶者為女性。 女性帶原者所生育的子代中 女性帶原者所生育的子代中, 有50%的男孩會罹患這個疾病, 有 的女孩會為帶 者 而有50%的女孩會為帶原者。 在男性血友病患者所生育的子 代中,所有的女兒皆為帶原者。4). 移位(translocation)
)
移位(
)
移位(translocation)是經由未知機轉,使原先屬於
兩條不同染色體的片段交換位置。
案例1-慢性骨髓性白血病
(chromic myelogenous leukemia, CML)
是 第9對以及第22對染色體轉位,t(9:22)
,又稱為費城染色體 (Philadelphia (斷裂與重組的結果)
Chromosome)。這種染色體 移 位會造成 原來位在第9對染色體的Abelson (ABL) proto-oncogene接到第22對染色體的 breakpoint cluster region (BCR)p g ( )基因上 ,形成BCR-ABL chimeric基因。正常的 ABL基因在轉錄轉譯後產生的tyrosine ABL基因在轉錄轉譯後產生的tyrosine kinase會受到嚴密的調控;但發生費城
染色體所形成的BCR ABL fusion基因 BCR ABL f sion gene
染色體所形成的BCR-ABL fusion基因 則失去正常的調控機轉,造成tyrosine ki 過度表現的情形
BCR-ABL fusion gene
kinase過度表現的情形。
案例2-勃奇氏淋巴瘤(Burkitt’s lymphoma)
(
y p
)
是由於染色體移位所致的B-淋巴球腫瘤。 是由於染色體移位所致的B 淋巴球腫瘤 在癌細胞的第8對染色體與第14對染色體長臂末端產生互換 現象,第8對染色體上的c-myc致癌基因轉移到免疫球蛋白 重鏈基因附近 緊鄰重鏈基因的促進子( h ) 導致 重鏈基因附近,緊鄰重鏈基因的促進子(enhancer),導致c-mycy 不正常的高度表現,促使B-淋巴球轉型為腫瘤細胞。不 常 度表現 促使 球 為二、點突變的修補機制
二、點突變的修補機制
細胞內正常的代謝活動與環境因素所引起的DNA
損 傷 的 發 生 速 率 約 為 每 個 細 胞 每 天 1 000 至
損 傷 的 發 生 速 率 約 為 每 個 細 胞 每 天 1,000 至
1 000 000處分子損害。
1,000,000處分子損害。
當DNA發生突變或損傷時,不論是原核細胞或真
當DNA發生突變或損傷時,不論是原核細胞或真
核細胞,皆具有某些機制負責修補工作,可使基
因組免受損傷和突變,因此對細胞的生存是很重
要的。常見的幾種已知的修補機制如下:
(1). DNA複製過程校正機制
( )
大 腸 桿 菌 的 DNA 聚 合 酶 I 或 III 皆 具 有 自 我 校 正
大 腸 桿 菌 的 DNA 聚 合 酶 I 或 III 皆 具 有 自 我 校 正
(proofreading)的機制,以移除複製DNA過程中偶爾
(p
g)
造成的錯誤配對。
DNA聚合酶I:本身具有3’→5’核酸外切酶活性。 DNA聚合酶III:3’→5’核酸外切酶活性則在ε(epsilon)次單元 上。 上。
修正的方式為利用3’→5’核酸外切酶活性,逆向切除
修正的方式為利用3 →5 核酸外切酶活性 逆向切除
一段已經合成DNA股線,再重新恢復DNA合成反應。
(2).錯誤配對的修補(Mismatch repair, MMR) 如果複製時產生錯誤配對(Mismatch repair, MMR),又未 如果複製時產生錯誤配對(Mismatch repair, MMR) 又未 被DNA聚合酶校正時,可經由Mismatch repair的酵素偵測 出來,將其中一股切出,並加以修補。 大腸桿菌細胞會利用此種機制來修補錯誤的配對 此機制 大腸桿菌細胞會利用此種機制來修補錯誤的配對,此機制 的關鍵包括特殊核苷酸模組GATC,以及三種蛋白質因子: MutH:含有endonuclease【內切酶】,切下未甲基化 新 序列的 位 新股GATC序列的G位。 MutS:辨識並接在錯誤的核苷酸。MutS:辨識並接在錯誤的核苷酸 MutL:連接MutS、MutH形成複合體。Mismatch repair gene-影片(1分22秒)
錯誤配對的修補機制
錯誤配對的修補機制
步驟一: 步驟 : 1) DNA複 製 合 成 的 新 股 線 上 , GATC並未甲基化,GATC中腺 嘌呤C6位置上的-NH2基,在新 嘌呤C6位置上的 NH2基 在新 DNA股線合成不久,才在Dam 甲 基 轉 移 酶 (D 甲 基 轉 移 酶 (Dam methyltransferase)的 催 化 下 甲 基化。 2) 但在尚未被甲基化之前的短暫半 2) 但在尚未被甲基化之前的短暫半 甲基化狀態其間(如右圖),細胞 進行一系列的錯誤配對修補工作。
步驟二
步驟二:
1) MutS雙倍體的功能主要在辨 1) MutS雙倍體的功能主要在辨 識錯誤的配對。當MutS皆在 錯 誤 配 對 的 位 置 後 , 促 使 進入需要修補的部位 MutL進入需要修補的部位, 同時,MutH辨識無甲基化的 同時 MutH辨識無甲基化的 的GATC模組,並接合在上面。 2) MutL能利用分解ATP獲得的 能量 使M tSL複合體移位到 能量,使MutSL複合體移位到 MutH旁邊,活化潛伏期MutH。ut 旁邊 活化潛伏期 ut
步驟三:
1)
)
活化的MutH從GATC
位置將DNA股線切斷,
並由解旋酶UvrD打開
雙股螺旋,以利後續
的 核 酸 外 切 酶 工 作
(如右圖) 。
步驟四: 1) 參與的核酸外切酶可能是5’→3’核 酸外切酶(核酸外切酶VII),或是 3’→5’核酸外切酶(核酸外切酶I)。 3 →5核酸外切酶(核酸外切酶I)。 2)) 核酸外切酶從GATC位置一路將 剛合成好的DNA分解,DNA接合 酶接合切口。 3) 新合成股線上的GATC模組隨後 3) 新合成股線上的GATC模組隨後 依然會被Dam甲基轉移酶甲基化, 使MutH不再附著在DNA股線上 (如右圖)。(3).
單一核苷酸異常的修補
( )
單 核苷酸異常的修補
去嘌呤化和去嘧啶化是原核細胞及 去嘌呤化和去嘧啶化是原核細胞及 真核細胞皆會遭遇的問題,嘌呤或 嘧啶等鹼基與C1的糖苷鍵有時會 自然或酵素作用而斷裂。 自然或酵素作用而斷裂 去嘧啶化經常與胞嘧啶(C)脫氨變 成尿嘧啶(U)有關,此時會形成不 當的G.U配對,細胞為了移除不 當配對的U,具有相當數量的尿嘧 啶-N-糖苷酶(uracil-N-glycoside) 啶-N-糖苷酶(uracil-N-glycoside) 專門清除G.U配對U,清除後產 生一個無鹼基的位置。 無鹼基的位置的修補由AP 內 切 酶 (apurinic d l 或 endonuclease 或 apyrimidine endonuclease,py 統稱AP endonuclease)負 責切除,在去嘌呤化或去 嘧啶化位置形成缺口之後, 嘧啶化位置形成缺口之後, 由核酸外切酶擴大缺口, 再以DNA聚合酶修補之, 完成修補工作 完成修補工作。三、結構損傷的修補機制
三、結構損傷的修補機制
1.
核苷酸切除型修補(Nucleotide excision repair)
DNA結構上的異常或損傷,需要較大範圍的修補。
點突變及錯誤配對修補為極短補丁修補( h t i VSP) 點突變及錯誤配對修補為極短補丁修補(very short repair, VSP)。 約10-12個核苷酸的修補為短補丁修補(short patch repair)。 平均約有1,500個核苷酸長度的修補則稱為長補丁修補(short
patch repair) patch repair)。
若只有單股DNA異常或損傷,則一般以核苷酸切除型修補
(nucleotide excision repair)的機制修補。
原核細胞的切除型修補
大腸桿菌細胞中,在適當波長下,紫外線會誘導相鄰的胸 腺 嘧 啶 (thymine) 形 成 雙 倍 體 , 稱 為 胸 腺 嘧 啶 雙 倍 體 (thymine dimer)。 這種結構使胸腺嘧啶無法正常的腺嘌呤(A)配對,造成 這種結構使胸腺嘧啶無法正常的腺嘌呤(A)配對 造成 DNA結構的損傷。 與紫外線引起大腸桿菌基因突變有關: A uvrA。 uvrB。 uvrC。 uvrD。切除型修補機制
Nucleotide Excision Repair-影片(2分14秒)1) UvrA:使雙倍體脫離DNA。 2) UvrB:消耗能量使整個DNA 彎摺。 3) U C 單股核酸內切酶 在 3) UvrC:單股核酸內切酶,在 損傷區域兩端造成單股切口。 4) UvrD:一種解旋酶,使兩個 切口之間的片段脫離。 合酶 接合酶 5) DNA聚合酶 I及DNA接合酶: 在切除後的缺口,負責重新 在切除後的缺口 負責重新 補齊。
人類細胞的切除型修補
色素性乾皮症(Xeroderma pigmentosum XP) 切除型修補酵素的遺傳缺陷所引起。 色素性乾皮症(Xeroderma pigmentosum, XP) 這種病患對陽光相當敏感,皮膚細胞無法修 補紫外線的照射所引發之突變,易形成皮膚 補紫外線的照射所引發之突變 易形成皮膚 癌。 XP患者有多種基因突變 這些基因產物與 XP患者有多種基因突變,這些基因產物與 NER(Nucleotide excision repair)有密切關係。 而在早期數種哺乳動物細胞中發現NER因子, 命 名 為 ERCC(excision repair cross complementation group),而某些ERCC因 子與XP屬於同一種蛋白,某些ERCC因子則 與XP結合為複合體,協同進行DNA修補。
2.轉錄協同修補(Transcription-coupled repair, TCR)
真核細胞除了全面性得切除型修補(global excision repair)之
外,最常利用的機制是轉錄協同修補(TCR)機轉。 為針對RNA轉錄過程所伴隨啟動的切除型修補機制(NER), 所以又稱轉錄合併核苷酸切除修復(Transcription coupled 所以又稱轉錄合併核苷酸切除修復(Transcription-coupled NER, TC-NER)。TC-NER是由RNA聚合酶在轉錄過程遇到 核苷酸損害無法辨識而停滯時所活化的修復機制,藉由RNA 合酶停滯的動作可以立 招來 相 的修復 白前來 聚合酶停滯的動作可以立即招來NER相關的修復蛋白前來, 這樣就能加速DNA損害的復原,而無須漫長地等待GG-NER 這樣就能加速DNA損害的復原 而無須漫長地等待GG NER 的反應。但也如此,TC-NER所負責修復的範圍只局限於能 夠轉錄RNA的DNA序列。
3.非同質性末端接合(non-homologous end-joint, NHEJ)
在原核或真核細胞皆有修補 在原核或真核細胞皆有修補 DNA雙股斷裂的機制,其可 分 為 同 質 性 重 組 分 為 同 質 性 重 組 (homologous recombination) 辨識 機 制 及 非 同 質 性 末 端 接 合 (non-homologous end-joint, (non homologous end joint,
NHEJ)等兩大類。 『傷口』修 剪整齊 高等真核細胞中修補DNA雙 股斷裂的機制以NHEJ居多。 類似機制的修補過程大致分 為辨識→解旋→修剪→接合 接合酶 為辨識→解旋→修剪→接合 等步驟。
4. SOS修補系統(SOS repair system)
(
p
y
)
SOS修復是指DNA受到嚴重損傷、 SOS修復是指DNA受到嚴重損傷 細胞處於危急狀態時所誘導的一種 DNA修復方式 修復結果只是能維 DNA修復方式,修復結果只是能維 持基因組的完整性,提高細胞的生 成率 但留下的錯誤較多 故又稱 成率,但留下的錯誤較多,故又稱 為錯誤傾向修復(error-prone repair), 使細胞有較高的突變率。 大腸桿菌的SOS修復系統包括數十 種與重組有關的基因,統稱損傷誘 導性基因 (damage-inducible genes, 導性基因 (damage inducible genes,
din gene),而細胞DNA在無損傷狀 態時din基因活化受到LexA蛋白抑制 態時din基因活化受到LexA蛋白抑制 子(LexA supressor)的抑制。 當DNA發生結構損傷時,DNA 斷裂產生的單股DNA片段會活化 斷裂產生的單股DNA片段會活化 RecA蛋白因子→誘使LexA自我 切割 分解 使L A蛋白失去 切割、分解,使LexA蛋白失去 活性→導致超過40種din基因從 LexA的抑制中解脫而活化。 被活化的din基因包括uvrA、uvrB 、被活化的 因 括 uvrC、recA、recN、DNA pol II、 RuvABC操縱組、UmuDC操縱組等。 a) recA:可更促進SOS反應。 b) LexA:因其本身即是din基因 b) LexA:因其本身即是din基因 當細胞發生危及時,可快速修 補,恢復正常狀態。 補 恢復正常狀態