第五章 資料分析結果
第二節 訴訟主體及其行為分析
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第二節 訴訟主體及其行為分析
1. 原告分析
本研究於 100 件美國專利訴訟中，彙整原告資訊後共得 55 位原告，分布於樣本增幅與 前處理、儀器平台、臨床實驗室、不實施專利實體(Non-practicing entity；NPE)和其他類原 告。不實施專利實體為不製造產品或提供服務的公司，可為學研單位、研究機構或專利聚集 者(patent aggregator)101；其他類原告可為個人或在 DNA 定序產業以外製造產品或提供服務 的公司。統計原告所發起訴訟數量和類型，可得下表。
表 11 DNA 定序產業美國專利訴訟原告資訊
原告 產業鏈位置 發起訴訟數量
Genetic Technologies 臨床實驗室 24
Invitrogen 樣本增幅與前處理 11
Illumina, Inc. 樣本增幅與前處理、 儀器平台 9
Life Technologies Corporation 樣本增幅與前處理、 儀器平台 9
Applied Biosystems 儀器平台 5
Enzo Life Sciences 樣本增幅與前處理 5
Enzo Biochem 樣本增幅與前處理 4
Affymetrix 樣本增幅與前處理、 儀器平台 4
Perkin Elmer 儀器平台 3
Sequenom, Inc. 儀器平台、 臨床實驗室 3
Endorecherche, Inc. 臨床實驗室 3
Myriad Genetics, Inc. 臨床實驗室 3
HSC Research and Development Limited Partnership
不實施專利實體 3
University of California 不實施專利實體 3
University of Pennsylvania 不實施專利實體 3
101
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原告 產業鏈位置 發起訴訟數量
University of Utah 不實施專利實體 3
Chiron Corporation 樣本增幅與前處理 2
E8 Pharmaceuticals 儀器平台 2
Oxford Gene Technology Limited 儀器平台 2
Promega Corporation 樣本增幅與前處理 2
Esoterix Genetic laboratory 臨床實驗室 2
Verinata Health, Inc 臨床實驗室 2
Catalyst Assets LLC 不實施專利實體 2
Massachusetts Institute of Technology 不實施專利實體 2
Max-Planck-Gesellschaft zur Forderung der Wissenschaften E.V.
不實施專利實體 2
Stanford University 不實施專利實體 2
Digene Corporation 樣本增幅與前處理 1
Solexa, Inc. 儀器平台 1
Illumina Cambridge 儀器平台 1
Applera 儀器平台 1
Caliper Life Sciences, Inc. 儀器平台 1
454 Life Sciences 樣本增幅與前處理、 儀器平台 1
Beckman Coulter, Inc. 儀器平台 1
Cirrex Systems LLC 儀器平台 1
Competitive Technologies 儀器平台 1
Eppendorf AG 儀器平台 1
Gene Reader LLC 儀器平台 1
Helicos Biosciences Corporation 儀器平台 1
Intelligent Bio-Systems , Inc. 儀器平台 1
Orchid Cellmark, Inc. 臨床實驗室 1
Arizona Science and Technology
Enterprise, LLC 不實施專利實體 1
California Institute of Technology 不實施專利實體 1
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原告 產業鏈位置 發起訴訟數量
Carnegie Mellon University 不實施專利實體 1
Columbia University in The City of New York
不實施專利實體 1
Cornell University 不實施專利實體 1
Institute for Protein Research 不實施專利實體 1
Johns Hopkins University 不實施專利實體 1
Ladatech LLC 不實施專利實體 1
The Scripps Research Institute 不實施專利實體 1
UAB Research Foundation 不實施專利實體 1
Billups-Rothenberg, Inc. 其他 1
Helena Chetverina 其他 1
PQ Corporation 其他 1
William Hone 其他 1
Syntrix Biosystems 其他 1
來源：本研究彙整。
由上表可知，於本研究中 59 位原告發起共 100 件美國專利訴訟中，其中發起超過 4 件 以上(含 4 件)專利訴訟的廠商包括：Genetic Technologies、Invitrogen、Illumina、Life Technologies、Enzo Life Sciences、Enzo Biochem、Affymetrix、Applied Biosystems。發起最 多訴訟的原告為臨床實驗室 Genetic Technologies，其次為樣本增幅與前處理廠商
Invitrogen，再其次為儀器平台 Illumina 和 Life Technologies。如以發起訴訟的頻率進行分 析，可得知有 26 位原告發起超過一次的專利訴訟，其餘 29 位原告僅發起一次專利訴訟。
統計來自於產業鏈中各位置的廠商發起訴訟的數量，其中又以樣本增幅與前處理的原告 為多，共有 48 件訴訟由其發起；其次為來自儀器平台的原告，共有 44 件訴訟。如將原告所 屬之產業鏈位置和該類廠商發起之訴訟數量重合，可以得到平均每個廠商所發起的專利訴訟 數，如所下表所示：
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表 12 DNA 定序產業美國專利訴訟原告所屬產業與發起訴訟之數量
所屬產業鏈位置 總共發起訴訟
數量
該產業鏈位置 之原告廠商數
量
平均每個廠商 所發起之訴訟
數量
樣本增幅與前處理 48 10 4.80
儀器平台 44 20 2.2
臨床實驗室與生物資訊處理 38 7 5.43
不實施專利實體 30 18 1.67
其他 4 5 0.80
來源：本研究彙整。
如表 12 所示，可得知在本研究範疇中的 DNA 定序產業中，如以產業鏈中上、中、下游 廠商總共所發起的訴訟數量區分，則屬於上游樣本增幅與前處理的廠商發起最多訴訟，其次 為儀器平台廠商；而若以平均所發起的訴訟數量區分，則屬於下游臨床實驗室與生物資訊處 理的廠商最為好訟，平均每個廠商發起 5.43 件專利訴訟；其次則為屬於樣本增幅與前處理 的廠商，平均發起 4.8 件專利訴訟。本研究範疇中之不實施專利實體多和實施專利實體共同 發起專利訴訟，僅有 4 件專利訴訟為不實施專利實體所單獨發起。
1.1 不同產業鏈位置之原告所使用的系爭專利請求項分析
本研究的系爭專利之平均獨立項數為 3.95 項，其中獨立項數最多的專利為 U.S. Patent No.7,064,197，其共有 30 項獨立項。
如以物的請求項或方法項做區分，系爭專利獨立項中有 338 項為物的請求項，332 項為 方法項。如以不同產業鏈位置之原告所主張的專利之請求項種類做區分，可整理如下表：
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中，其系爭專利之請求項多屬於方法項，平均每一系爭專利中具有 1.84 項獨立項屬於方法 項，而其每一系爭專利中平均具有 1.43 項獨立項屬於物的請求項。屬於臨床實驗與生物資 訊處理的原告所發起的訴訟中，其系爭專利之請求項多屬於方法項，平均每一系爭專利中具 有 2.71 項獨立項屬於方法項，而其每一系爭專利中平均具有 1.32 項屬於物的請求項。而不 實施專利實體所發起的訴訟中平均每一系爭專利之獨立項則以物的方法項居多。分析前述 168 件系爭專利及其原告產業屬性，可得知分屬於不同產業鏈位置的被告，因其商業模式的 不同因此被主張之專利的獨立項類型也不同。
如將上述各產業鏈位置的原告所使用的系爭專利之請求項分別以產品技術矩陣分析之，
可得下圖：
來源：本研究彙整
圖 6 樣本增幅與前處理廠商所主張之專利於產品技術矩陣中的分佈
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如圖 6 所示，其中每一格中的數字為專利的數量。例如產品結構中的節點「Sequence mixture loading system」和技術結構的節點「Sequencing device」之交會的矩陣格中，其數字 為「5」，即代表保護標的為「Sequence mixture loading system 」，而其技術內容為
「Sequencing device 」的專利至少有 5 件，代表上述的獨立項所保護的標的為固定定序試劑 或樣本於其上的系統，其獨立項技術特徵則可為固定在定序系統之材質。又例如產品結構中 的節點「Polymerase」和技術結構的節點「Manufacturing」交會的矩陣格中，共有 2 件專 利，包括 U.S. Patent No. 5,405,776 和 U.S. Patent No. 6,063,608，代表上述專利所保護的標的 為 DNA 定序技術所需的核酸合成酶酵素，其技術特徵則為該酵素的製造過程。由上圖之產 品技術矩陣以及系爭專利在其中之分類結果，可以得知本研究中 91 件樣本增幅與前處理廠 商的系爭專利之保護標的和請求項之技術內容。
由上圖中的縱軸產品結構可得知處於樣本增幅與前處理的廠商於美國專利訴訟中所主張 之專利所保護的標的多為 DNA 定序的過程與方法「Sequencing Process」，共有 42 項獨立 項；其次為 DNA 定序的應用「Sequencing application」，共有 19 項獨立項。由上圖中的橫 軸技術結構可得知處於樣本增幅與前處理的廠商所主張之專利中的技術內容多為「Sequence mixture loading」，共有 17 項獨立項；其次為「Sequencing by synthesis」，共有 16 項獨立 項。
樣本增幅與前處理廠商所主張之專利的保護標的和其技術內容與其商業模式不相符合。
本研究定義樣本增幅與前處理的商業模式，為提供 DNA 定序中樣本之前處理和萃取核酸套 組的販售。然而，在本研究中，樣本增幅與前處理的廠商並未主張相關專利之權利，而是主 張儀器平台有關之專利。
將儀器平台原告所使用的系爭專利之請求項分別以產品技術矩陣分析之，可得下圖：
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標的多為 DNA 定序的過程與方法「Sequencing Process」，共有 60 項獨立項；其次為 DNA 定序的系統「Sequencing system」，共有 17 項獨立項。由上圖中的橫軸技術結構可得知儀器 平台廠商所主張之專利中的技術內容多為「Sequencing by synthesis」，共有 22 項獨立項；其次為「Sequence mixture loading」，共有 20 項獨立項。
儀器平台廠商所主張之專利和其商業模式相符合。本研究定義儀器平台廠商之商業模式 為販售 DNA 定序儀器與試劑，並提供售後服務。儀器平台廠商在專利訴訟中據以主張之專 利之保護標的多為核心的 DNA 定序過程與方法，以及 DNA 定序系統。
將臨床實驗室原告所使用的系爭專利之請求項分別以產品技術矩陣分析之，可得下圖：
Library/Probe Primer Polymerase Nucleotide analog Reporter molecule Sequencing by synthesis Nucleotide amplification
1 1 5 2 5
Nucleotide analog 2
Reporter molecule 1
1 3 4 4 3 1 2 1 6 6 19 8 1 1
Nucleotide amplification 1 2
1 5
Sequencing mixture preparation system Sequencing mixture loading system
Microarray system
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的標的多為 DNA 定序技術的應用「Sequencing application」，共有 38 項獨立項；其次為「Sequencing system」和 DNA 定序時核酸增幅反應所需的引子「Primer」，各有 7 項獨立 項。由上圖中的橫軸技術結構可得知臨床實驗室廠商所主張之專利中的技術內容多為
「Sequencing applications」，共有 33 項獨立項；其次為「Library/probe」，共有 7 項獨立 項。
Library/Probe Primer Polymerase Nucleotide analog Reporter molecule Sequencing by synthesis Nucleotide amplification
1 1
2 1 4
2
Library/Probe 2 2
Primer 5 1 1
Polymerase Nucleotide analog Reporter molecule
2 4
Nucleotide amplification 1
2 3 2 1 1 8 21
Sequencing mixture preparation system Sequencing mixture loading system
Microarray system
Manufacturing Mechanical design Sequencing mixture preparation Sequencing mixture loading Sequencing mixture removing
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來源：本研究彙整。
圖 9 不實施專利實體所主張之專利於產品技術矩陣中的分佈
由上圖中的縱軸產品結構可得不實施專利實體於美國專利訴訟中所主張之專利所保護的 標的多為「Sequencing application」，共有 37 項獨立項；其次為「Sequencing process」，共 有 21 項獨立項。由上圖中的橫軸技術結構可得知不實施專利實體所主張之專利中的技術內 容多為「Sequencing applications」，共有 36 項獨立項；其次為「Library/probe」，共有 14 項獨立項。因本研究中的不實施專利實體包括學校和研究機構，其不一定存在商業模式，因 此難以比較其商業模式和所主張專利之保護標的的關係。
由上述圖式可了解分別處於不同產業鏈位置的廠商，其在美國專利訴訟中主張的專利所 保護的標的(即在產品結構中的位置)，和其技術內容(即在技術結構中的位置)各有不同。其 中臨床實驗室和儀器平台廠商所主張之專利的保護標的符合其商業模式；然而，位於產業鏈
由上述圖式可了解分別處於不同產業鏈位置的廠商，其在美國專利訴訟中主張的專利所 保護的標的(即在產品結構中的位置)，和其技術內容(即在技術結構中的位置)各有不同。其 中臨床實驗室和儀器平台廠商所主張之專利的保護標的符合其商業模式；然而，位於產業鏈