UGT1A4基因多型性對於lamotrigine代謝之影響

行政院國家科學委員會專題研究計畫 成果報告

UGT1A4 基因多型性對於 lamotr igine 代謝之影響

計畫類別： 個別型計畫

計畫編號：

NSC91-2314-B-006-067-執行期間： 91 年 08 月 01 日至 92 年 07 月 31 日

執行單位： 國立成功大學醫學系神經科

計畫主持人： 賴明亮

計畫參與人員： 黃金鼎、劉晉宏

報告類型： 精簡報告

處理方式： 本計畫可公開查詢

中

華

民

國 92 年 10 月 6 日

行政院國家科學委員會補助專題研究計

畫

þ成果報告 □期中進度

報告

（計畫名稱）UGT1A4 基因多型性對於 lamotrigine 代

謝之影響

計畫類別：þ個別型計畫 □ 整合型計畫

計畫編號：NSC

91－2314 －B －006 －067 －

執行期間：91 年 08 月 01 日至 92 年 07 月 31 日

計畫主持人：賴明亮

共同主持人：

計畫參與人員： 黃金鼎、劉晉宏

成果報告類型(依經費核定清單規定繳交)：þ精簡報告 □完整

報告

本成果報告包括以下應繳交之附件：

□赴國外出差或研習心得報告一份

□赴大陸地區出差或研習心得報告一份

□出席國際學術會議心得報告及發表之論文各一份

□國際合作研究計畫國外研究報告書一份

處理方式：除產學合作研究計畫、提升產業技術及人才培育研究

計畫、

列管計畫及下列情形者外，得立即公開查詢

□涉及專利或其他智慧財產權，□一年□二年後可公開

查詢

執行單位：國立成功大學

中 華 民 國 92 年 10 月 03 日

本計劃已完成在國人個體中 UGT1A4 基因之 Exon 1 及 promoter

之定序工作。除了能瞭解先前文獻已發表之 UGT1A4 基因多樣性例子

之外，我們也想找出國人另外特有或未被發掘的基因多樣性，藉以瞭

解更多國人藥物代謝相關基因之多樣性。

UGT1A4 是 UGT1A 基因家族之一員，此 UGT1A 家族基因之基因結

構如圖一，所有的 UGT1A 基因家族成員之 Exon 2 至 Exon5 皆為

common Exon，差異處僅為 Promotor 及 Exon 1 序 列，是一種

Alternative Splicing 現象。

方法:

依 據 序 列 : AF297093 ； Homo sapiens, chromosome 2q37 ；

07-FEB-2002

a. PCR primer design: (表一)

Region

Sequence

Size (bp)

Promotor

Exon 1

UGT1_ Exon1-240F: 5’-GGGCACTTTGTCTTCCAATTACA-3’ UGT1_Exon1-1274R: 5’-TGCCTGGAACATTGATTGGAT-3’

1035

b. 定序儀器: ABI 3100

結果:

19 位個體包括男性 5 位與女性 14 位共 38 個 allele，執行的定序

工作包含 promoter 及 exon 1 序列;exon 2 至 exon 5 common exon 區序

列定序結果則以先前於 1996~1998 期間針對 120 位國人個體 UGT1A1

定序之結果為數據，期間於 120 位個體之 exon 2~5 以 SSCP 結合 RFLP

與 sequencing 只在 exon 4 發現 3 位 heterozygous C/T

1094

Pro365Leu

(表二 A19)，於 exon 2、exon 3 及 exon 5 並未發現任何多樣性點，所

以本次實驗僅是針對 UGT1A4 promoter 及 exon 1 做定序實驗工作。

於 NCBI SNP database 收載之 UGT1A4 exon 1 四例多樣性點 (如表

二 A3、A6、A10 及 A18)，19 位個體 A3 皆屬 wild type (wt)，A6 有

四位個體屬 heterozygotes (1/2) 佔 4/38 (10.5%)，A10 在 19 位國人個

體中皆呈現 homozygotes (2/2) 佔 38/38 (100%)，A18 有 18 位個體呈

heterozygotes，1 位個體 (N4) 屬 homozygotes 共佔 20/38 (53%)。此

外發現 Missense case 共 10 例 (A2、A5、A7~9、A11~12、A15、A17)

19 位個體皆以 heterozygotes 呈現皆為 50% allele frequent ﹔Silent

case 共 4 例 (A4、A13~14、A16) 亦是 19 位個體皆以 heterozygotes

呈現為 50% allele frequent。表二 Alleles list

Allele frequent

Allele

No.

Allele type

Mutation type

Site

Wt

Mut.

Note

A1

G/C

-16

--

promotor

19/38

19/38

New data

A2

G/C

8

Arg3Thr

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A3

C/T

31

Arg11Trp

Missense

exon 1

38/38

0/38

db_SNP rs3892221

A4

C/T

54

Leu18Leu

Silent

exon 1

19/38

19/38

New data

A5

C/T

107

Thr36Ile

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A6

T/G

141

Leu48Val

Missense

exon 1

34/38

4/38

db_SNP rs2011425

A7

G/A

234

Ala79Thr

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A8

G/T

260

Lys87Asn

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A9

G/C

273

Val92Leu

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A10 T/C

470

Cys157Cys

Silent

exon 1

0

38/38

db_SNP rs2011404

A11 C/A

621

Leu208Met

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A12 A/G

675

Thr226Ala

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A13 C/T

686

Ala229Ala

Silent

exon 1

19/38

19/38

New data

A14 T/C

698

Ser233Ser

Silent

exon 1

19/38

19/38

New data

A15 C/A

741

Leu248Ile

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A16 C/T

749

Ser250Ser

Silent

exon 1

19/38

19/38

New data

A17 T/C

750

Tyr251His

Missense

exon 1

19/38

19/38

New data

A18 G/A

803

Pro268Pro

Silent

exon 1

18/38

20/38

db_SNP rs3732217

表三 綜合結果

ID

Allele No.

Sex

A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8 A9 A10 A11 A12 A13 A14 A15 A16 A17 A18 A19

N1 M 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N2 M 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N3 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N4 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 2/2 --N5 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N6 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N7 M 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N8 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N9 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N10 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N11 M 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N12 M 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N14 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N15 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N16 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N17 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N18 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N19 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 --N21 F 1/2 1/2 Wt 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 2/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2 1/2

--討論:

19 位個體共 38 個 allele，針對 promoter 及 exon 1 區並結合先前

UGT1A1 exon 2~5 結果進行 UGT1A4 國人基因多樣性評估。結果發

現國人 UGT1A4 序列與 NCBI 資料庫有相當高的差異性，以不少的

heterozygotes mutation type 呈現於

UGT1A4 中，並且有 Missense

mutation 12 例與 Silent mutation 6 例。

UGT1A 基因家族之 exon 1 為

最容易產生基因變異之處，國人的 UGT1A4 基因應該會與高迦索人