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大白鼠外傷性出血性休克後炎性反應在性別差異上之研究:基於功能性基因體學並應用賀爾蒙調節來治療因創傷導致多重器官衰竭之嶄新療法的研究; The Gender Dimorphism of Inflammatory Response Following Traumatic Hemorrhagic Shock: A study based on its functional genomics and validation of a novel therapeutic approach for post-traum

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Academic year: 2021

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(1)中國醫藥大學 醫學研究所 碩士學位論文 大白鼠外傷性出血性休克後炎性反應在 性別差異上之研究: 基於功能性基因體學並應用賀爾蒙調節來治療因創傷 導致多重器官衰竭之嶄新療法的研究 The Gender Dimorphism of Inflammatory Response Following Traumatic Hemorrhagic Shock: A study based on its functional genomics and validation of a novel therapeutic approach for post-traumatic multiple organ failure by hormonal modulation. 指 導 教 授 :陳瑞杰. 副教授. 研 究 生:鍾侑庭. 中華民國九十五年九月.

(2) 中文摘要 關鍵詞: 性別差異,雌激素,細胞激素,外傷性出血性休克,多重器官衰 竭,功能性基因體,基因晶片、DNA 微陣列 背景:外傷早期死亡主要原因包括頭部外傷與出血性休克,晚期則為器官 衰竭。研究顯示,外傷好發於年輕男性。許多研究指出性別差異源自於性 賀爾蒙效用。肝臟是一個代謝功能複雜且重要的器官,各類休克常導致肝 臟衰竭,同時合併極高的死亡率。DNA 微陣列提供一個樞紐性工具,讓 生物學界能夠了解複雜疾病之基因體變化,而外傷導致生物體急速與巨大 衝擊正可提供一個獨特機會得以研究功能性基因體與蛋白質體的變化。 目的:藉由 DNA 微陣列技術,全面瞭解外傷性出血性休克導致基因體表 現之變化在性別上的差異,並觀察基因體變化與細胞層級變化及臨床指 標,如:細胞激素與雌激素,以期找出其間之關連性。 方法:本實驗之對象為大白鼠,共分三組,每組 12 隻,雌雄各半。第一 組:控制組,第二組:出血性休克組,第三組:急救組。出血性休克採用 固定血壓方式,並維持平均動脈壓為 45-55 毫米汞柱達一小時。實驗結束 後四小時給予安樂死,同時將大白鼠肝臟組織取下並且由心臟抽血。以肝 組織作為微陣列之分析。血中 TNF-α、IL-1β、IL-6、IL-10 及 17β-estradiol 也予以檢測。 結果:出血性休克組雄性 4 小時雄鼠死亡率為 66.7%,雌性則為 50%。在 死亡個案當中,雄鼠平均存活時間亦較短 (81.3 分鐘 vs.123 分鐘, III.

(3) p<0.05)。在雌激素方面,雌性明顯高於雄性 (p <0.001)。無論雌雄,出血 性休克組血清中四種細胞激素均有最高的表現。在 DNA 微陣列技術的實 驗方面,大白鼠基因晶片(GeneChip®)可檢測 31042 個基因,研究發現結果 發現出血性休克後 4.1 %的基因有明顯改變;而以輸液急救後則有 3.7%有 明顯改變。 討論:出血性休克組雄鼠死亡率較雌鼠高,在死亡個案當中,雄鼠平均存 活時間亦較短。這樣的結果顯示雌鼠對外傷性出血性休克有較高的忍受 性。除了 TNF-α 以外,三組肝組織基因的表現大致上與血清相對應細胞激 素濃度變化一致,其主因可能為 TNF-α 最早出現,且半衰其很短之故。外 傷性出血性休克在急性期改變的基因表現大都與細胞內能量製造與代謝 機轉有關,部分則與基因訊號傳遞或與細胞基質與結構蛋白質製造相關。 結論:雌性在外傷性出血性休克之後的系統性炎性反應的調節中扮演重要 角色,由本研究發現它可降低此類損傷早期的死亡率。. IV.

(4) 英文摘要 Key words: gender. dimorphism,. hemorrhagic. cytokines,. shock,. multiple. estrogen,. organ. failure. traumatic (MOF),. functional genomics, Gene chip, cDNA Microarray Background:The majority of trauma patients in the acute and early categories died as a result of neurologic dysfunction, and hemorrhage. As all are known, the mortality rate of male following trauma is higher compared to that of females. A number of studies indicated that this sex difference was primarily the effect of sex hormones. The liver is a complex metabolically active organ, particularly susceptible to shock, and liver failure carries a high mortality rate. DNA microarray technology provide a pivotal tool in understanding the functional genomics of complex diseases. Purpose:Under the application of DNA microarray technology, we can have a global understanding of the pattern and difference of immune restoration and gene expression following traumatic hemorrhagic shock in the male and female rats. We also want to correlate these observed gene expressions with cellular change and clinical parameters such as hormone levels and serum cytokine concentrations. Methods:In our study, mature Sprague-Dawley rats with half for each sex, were divided into three groups, each group having 12 rats: group I: control group (sham operation); group II: hemorrhagic group; group III: resuscitative V.

(5) group . Hemorrhagic shock was induced by withdrawing blood via left femoral artery within 10 minutes and maintain MABP between 45-55 mmHg for one hour . The animals were sacrificed by euthanasia at 4 hrs after the finish of experiment to obtain the liver and whole blood. The liver samples were harvested for microarray analysis. The cytokines including TNF-α, IL-1β, IL-6, IL-10, as well as 17β-estradiol will be measured through the blood samples. Results: In shock group, the 4-hour mortality rate was 66.7% male subgroup and 50% in female subgroup. Among the mortality rats, male rats had shorter mean survival time than females did (81.3 min. vs. 123 min.). In regard to 17-β estradiol, plasma levels in females were significantly higher than those in males (p<0.001). Regardless of sexes, hemorrhagic group had the highest and control group had the lowest plasma levels of TNF-α, IL-1β, IL-6 and IL-10. In the microarray study, the GeneChip® revealed 4.1% (1283/31042) of assessed genes were altered. As compared with hemorrhagic group, the GeneChip® revealed 4.1% (1149/31042) of assessed genes were altered. Discussion: In shock group, the mortality rate was significant higher in male subgroup. Among the mortality rats, male rats had shorter mean survival time than females did. The current data of mortality and plasma levels of cytokines in shock group suggesting that females have more protective from traumatic hemorrhagic shock than males do. Except for the TNF-α, the gene expression in the liver were approximately in accordance with the corresponding cytokine VI.

(6) levels in the blood. Most of the significant genes are energy producing and metabolically related genes, and some are signal transduction and matrix & structural proteins synthesis related. Conculsion: Female play an important role on modulation for systemic inflammatory. response. following. traumatic. hemorrhagic. shock. resuscitation, therefore, reduce the early mortality of the injuried rats.. .. VII. and.

(7) 致謝 今日能夠完成本研究及論文,最要感謝的是指導教授陳瑞杰副院長讓 我有機會參與其國科會研究計劃「大白鼠外傷性出血性休克後炎性反應在 性別差異上之研究:基於功能性基因體學並應用賀爾蒙調節來治療因創傷 導致多重器官衰竭之嶄新療法的研究」。當初剛考上研究所,心想自己對 外傷有相當的興趣,而陳副院長正是這個領域的權威,便請他擔任我的指 導教授,而副院長也很爽快答應。研究所尚未開學,自己還在思索未來的 研究主題時,副院長已拿了一份外傷與基因體的參考資料要我好好研讀並 在兩週後報告,當時直覺不妙,未來兩年必定不好過。果然,不久之後副 院長便交付這項研究計畫,並安排我至長庚醫學大學學習動物實驗操作技 術。 在那段時間非常感謝樓迎統教授的指導與其研究生陳熙文的技術協 助使我對動物實驗有了基本的概念。回來之後開始著手實驗規劃,發現仍 有一堆難題需要解決,在哪裡做實驗(因沒有專屬實驗室)、實驗器械、 儀器及助理均缺,檢測的試劑、微陣列晶片之訂購與分析技術亦是一大考 驗。所幸這些難題隨著實驗的規劃與進行逐步解決,這當中特別要感謝麻 醉部吳世銓部長提供實驗室及相關設備、急診部鄭宜昌醫師與其助理謝曉 嵐在動物實驗的實際操作上的協助以及張建國教授在微陣列實驗方面的 指導。要感謝的人實在很多:急診室彥芳護理長及秀惠副護理長,經常要 麻煩你們幫忙將血液標本離心;秀鳳姐,多虧妳熱心幫忙申請實驗相關物 料在此一併致謝;其他還有急診檢驗室、細菌室、分子生物實驗室的同仁 VIII.

(8) 及張建國主任的研究助理志玫,謝謝你們的協助使這個研究能夠完成。兩 年的研究讓我有機會跨進基礎研究的領域,接觸基礎醫學最新的進展。這 個過程是艱辛的,一方面醫院的臨床工作繁忙,上班的壓力極大,每到下 班幾已心力交瘁,只想好好休息;另一方面,基礎研究非一蹴可幾,尤其 是對毫無動物實驗經驗的我而言更是千頭萬緒。感謝急診部陳维恭主任在 排班上的協助,減少上班班數,讓我有較充裕的時間從事實驗。最後也感 謝外傷部助理秋秀及急診部助理俊忠,經常麻煩你們有關行政、文書方面 的瑣事,讓我節省不少這方面的作業時間。 兩年的努力總會有收穫的,如今論文業已經鍾景光教授、楊大羽副教 授、陳瑞杰副教授及林嘉興助理教授的指導完成審查並付梓,而我也順利 通過口試完成碩士學業。然而這絕非代表研究已經結束,接下來的工作還 有論文的發表,當然也期望未來能從這個實驗的結果,繼續從事進一步的 研究。. IX.

(9) 目錄 書名頁...................I 口試委員審定書...............II 中文摘要..................III 英文摘要..................V 致謝....................VIII 目錄....................X 圖表目錄..................XI 第一章. 前言................ 1. 第二章. 研究方法..............18. 第三章. 研究結果..............26. 第四章. 討論................63. 第五章. 結論與建議.............71. 圖表....................72 參考文獻..................78. X.

(10) 圖表目錄 圖 1: GeneChip®Rat Genome 230 2.0 Array A f f i m e t r i x ) 晶 片 . . . . . . 72 圖 2 : D N A 微 陣 列 操 作 及 分 析 流 程 . . 73 圖 3:平 均 中 心 靜 脈 壓 之 變 化 圖 4:平 均 動 脈 壓 之 變 化. . . . . 74. . . . . . 74. 圖 5 : TNF-α血中濃度及肝組織中相對基因之比 較 ...................75 圖 6 : IL-1β血中濃度及肝組織中相對基因之比 較 ...................75 圖 7 : IL-6 血中濃度及肝組織中相對基因之比 較 ...................76 圖 8 : IL-10 血中濃度及肝組織中相對基因之比 較 ...................76 圖 9 : 主要基因之分子功能(出血性休克組 vs 控制 組) ..................77 圖. 1 0 : 主要基因之分子功能(急救組 vs 出血性休克 組) ..................77 XI.

(11) 第一章 前言 第一節 研究背景 一、外傷流行病學 包含台灣在內,事故傷害一直是青壯年最主要的死因。根據中 華民國衛生署94年度的統計,事故傷害在所有年齡層中位居國內第 五大死亡原因1-4。Trunkey 5 於1983年發表著名的「trimodal distribution of trauma death」。在他們的研究中發現因外傷有三個死 亡高峰,分別為立即、早期及晚期。因根據研究顯示有高達50%死 亡發生逾受傷後1小時內,主要原因為嚴重出血與中樞神經系統創傷 6. ,另外大約30%的死亡則發生於受傷後1-2小時內,主要原因為嚴重. 內臟損傷7,其中仍以出血性休克為最多;而晚期死亡則為感染導致 多重器官衰竭,而其中一開始嚴重的出血仍佔有關鍵的地位。由以 上數據可知出血性休克是造成創傷死亡最主要的直接及間接原因。 因此致力於研究因外傷導致出血性休克,並試圖從其中找出有效的 治療方式對降低外傷死亡絕對有極大的助益8。. 二、外傷性出血性休克 所謂休克,在病生理的定義上意味組織灌流不足導致細胞缺氧 的狀態。由於缺氧導致新陳代謝改變,造成細胞功能失調並釋放炎 性介質(細胞激素),而這些介質依序引發一連串的反應,包括凝 血機能障礙、免疫抑制、最後造成器官衰竭而致死亡 9。出血是外傷 導致休克最常見的原因,也是外傷立即及早期死亡最主要的原因。 1.

(12) 過去幾十年有許多努力及研究試圖闡明因嚴重出血所引發的病生理 機轉與免疫學方面的變化。在這些研究中已觀察到單獨的出血性休 克或同時加上軟組織傷害 (例如剖腹) 對 cell-mediated 及 humoral 免疫的影響. 10-13. 。出血性休克會顯著地降低特異性(specific)及非. 特異性(non-specific)免疫反應 14-15。這種免疫的降低在引發出血性 休克後 30 分中後即發生,並一直維持 24 小時 14, 16-18。 嚴重出血也 曾 被 報 告 會 引 發 內 分 泌 的 改 變 , 包 括 增 加 adrenocorticotropic hormone、corticosterone 及 beta-endorphin 的分泌 19。 組織創傷是機械性的事件;而出血性休克則為生理症候群。外傷 性出血性休克所引發的賀爾蒙及炎性介質的反應與其他型態的休克 是有明顯不同的. 20. 。因出血及組織損傷而活化系統性炎性反應是外. 傷性出血性休克後病生理機轉之重要元素。系統性炎性反應之活化 因子包括缺血∕再灌注損傷及中性白血球的活化。而微血管因出血 性休克導致“無血流(no-flow)”合併長期缺血以及“再灌注”損傷 也會刺激中性白血球的活化。導致無代償性、無法回復之出血性休 克的機轉包括(1)“小動脈的敏感度降低”其臨床表現為持續小動脈 擴張及其對貝他型刺激劑(β-agonist)反應降低(2)細胞損傷及活化正 炎性(proinflammatory)和抗炎性(counterinflammatory)機轉。以上的種 種變化所代表的是微循環衰竭。而休克之後即使給予適當急救仍會 因心輸出量的再分配及持續腸缺血也可能會因而發生無可回復的出 血性休克。 先前相關的研究已經顯示在外傷性出血性休克時期血管內皮細 2.

(13) 胞的損傷已然發生,即使給予輸液急救其損傷仍然持續。而重點是 血管內皮細胞在維持組織灌注佔有關鍵性的角色 21-23。因此,在出 血性休克後觀察如何維持內皮細胞功能具有潛力的治療方式是非常 重要的。研究顯示快速給予輸液治療來補充流失的血液,以維持血 壓及組織灌注是處理外傷性出血性休克其中一個重要的里程碑。然 而即使給予看似成功的急救,仍有不少創傷患者在損傷初期存活下 來,卻在之後因敗血症及多重器官衰竭而死亡 24-26。 三、外傷性出血性休克之動物研究模型 過去數十年來,有許多研究機構及學者投入極大的努力致力於 嚴重出血的研究。在眾多的研究中,有以臨床實驗者,也有以動物 為研究對象。以人體研究出血性休克困難度及變數較高,因為在這 種危急的狀況下,需要立即給予適當急救處置,經常無法配合研究 的設計,同時由於病患在臨床表現的異質性使得臨床實驗多所限 制,然而其畢竟是臨床研究,較能反映實際狀況;而以動物模型研 究,則較能控制各項變因,使得研究單純化,然而因研究動物畢竟 不同於人體,且設計的狀況也不見得符合現況,因此不能以研究的 結果直接應用於臨床,但這種研究模型目前仍廣泛地被使用來研究 出血性休克之病理機轉,由此模型所得到的前臨床資料也可作為出 血性休克介入性治療的基礎。成功的外傷性出血性休克模型需要對 所有面向,包括機械的、生理學的、細胞生物學的及免疫學的均有 深刻的理解。同時外傷性出血性休克引發之炎性反應會隨時間而有 不同的變化, 所以早期或晚期炎性反應是相異的。 3.

(14) 目前研究外傷性出血性休克主要模型有二: 1. 非控制性出血模型(Uncontrolled hemorrhage model) 此種模型以誘導脾臟損傷或主動脈撕裂等方式造成出血性休 克,較適合用來研究輸液治療的時機、種類及輸液量28-37。影響實驗 變數包括創傷種類、休克時間及輸夜種類。優點是可以適切的反應 臨床狀況,同時也造成組織損傷;缺點是出血量無法控制。 2. 控制性出血模型(Controlled hemorrhage model) 此種模型可以使實驗者較精確地控制休克的程度,但現實狀況 並非如此,因此較難反應現實狀況。雖然如此,因為此種模型較易 操作因此廣為從事出血性休克研究者作為相關研究的模型。此種模 型又可分成兩種模型: A. 固定血容模型(fixed-volume model) 以固定出血量誘導休克,通常根據實驗動物體重來決定,並 藉由動脈導管監測血壓。此種模型被廣泛用來研究出血性休克後 新陳代謝及組織病理學方面的變化、存活率及治療效果。影響實 驗的變數包括誘發休克之速度、休克時間(1–2小時)、休克嚴重 程度、使用麻醉藥種類及輸液種類。此種模型的優點是可以評估 休克代償機轉,但缺點則是低血壓的程度無法維持一定且須另外 以傷口模擬創傷狀態。 B. 固定血壓模型(fixed-volume model) 藉由動脈導管及血壓監測器監測血壓,視需要從動脈導管抽 血以達到所設定的血壓。其研究範圍及變數影響與固定血容模 4.

(15) 型相同。優點是低血壓的程度、期間及出血量可被控制及監測, 雖然這種模型無法完全模擬臨床狀況,但因為實驗條件好控 制,因此最常用作出血性休克的模型。本實驗即採用此模型。 四、細胞激素(Cytokine)的介紹 在外傷性出血性休克引發系統性炎性反應在細胞層級變化的研 究中,細胞激素是最常被用來與各項生理指標、預後及其他更細微 的變化,如基因的表現來做比較,因為細胞激素是最為醫界及學界 所熟知,也是目前研究比較透徹的。細胞激素可分為三類,分別為 正炎性(Proinflammatory )細胞激素,如TNF-α、IL-1、IL-6及IL-8; 抗炎性(Antiinflammatory)細胞激素,如IL-4、 IL-10、 IL-13及 TGF-β;及溶解性細胞激素接受體(Soluble cytokine receptor)。現 將幾種代表性的細胞激素其功能及損傷急性期的血中表現敘述如 下: 1. TNF-α TNF-α是宿主在損傷反應後最早產生,也是最強的細胞激素。 它主要由T型淋巴球及巨嗜細胞所分泌,此外也由肝臟的Kupffer細 胞所分泌。在出血性休克早期Kupffer細胞TNF-α的濃度及其相對應 mRNA的表現均增加38。雖然TNF-α的半衰期小於20分鐘,但這麼短 暫的出現已足以引發顯著的新陳代謝及血行動力學變化並能刺激下 游介質的分泌。研究顯示受傷後,宿主血中TNF-α濃度開始升高並 在4小時內達到高峰,之後即快速下降39-40。根據Tracey及其同事41 的研究顯示以高劑量TNF-α靜脈注射於動物體內會導致低血壓、頻 5.

(16) 脈、呼吸過快、乳酸中毒、高血鉀、高血糖,繼之引發低血糖。此 外TNF-α亦能活化凝血機能,促進黏合分子、PGE2、血小板活化因 子(PAF)、Glucocorticoids、及Eicosanoids得表現及釋放42。 2. IL-1 雖然IL-1及TNF-α作用類似,但他們有各自的接受體及細胞內訊 息傳導路徑。IL-1有兩種型態:一為IL-1α,另一為IL-1β。他們主要 由被活化的巨嗜細胞及內皮細胞所分泌。IL-1α與細胞膜有關而IL-1β 則較能由循環中被測出。此外,對於外傷,IL-1可藉由對局部 prostaglandin的刺激而誘發典型炎性反應。IL-1的半衰期約6分鐘。 3. IL-6 IL-6 由多種細胞所分泌包括纖維母細胞、內皮細胞、Kupffer 細胞、中性白血球、巨嗜細胞、T型及B型淋巴球。它影響多種生物 功能包括免疫球蛋白的及白血球的製造及急性期的反應43-44。根據 Chaudry的研究38,出血性休克早期Kupffer細胞IL-6的濃度及其相對 應mRNA的表現與TNF-α一樣均增加。IL-6具有正炎性及抗炎性的作 用,在許多動物研究顯示IL-6的正炎性反應是藉由活化B型淋巴球及 誘導chemokines及黏合分子(adhesion molecule)在內皮細胞的表現 45. 。另一方面,根據Meng46等人的研究出血性休克模型,在急救時以. 合成的IL-6靜脈注入老鼠體內後,肝臟和肺臟的損傷明顯減少而且 白血球的浸潤亦降低。其他相關的研究也顯示以合成的IL-6注入實 驗動物亦會降低血中TNF-α及IL-1β的濃度,這些結果說明了IL-6 亦有抗炎性作用47。 6.

(17) 4. IL-10 IL-10 剛開始被認為是細胞激素合成抑制因子(CSIF)。IL-10 由 T 型淋巴球、B 型淋巴球、巨嗜細胞、單核白血球及角化細胞分 泌。在出血性休克或感染等壓力下 IL-10 可改變許多免疫細胞分泌 細胞激素的量,因此它對免疫反應是有調節的作用。.某些研究顯示 IL-10 對正炎性反應控制具有重要的角色。在巨嗜細胞,IL-10 受 TNFα的刺激而分泌,但會反過來抑制 TNF-α 及 IL-6 的產生 48。 五、外傷性出血性休克急性期的免疫反應 外傷性出血性休克急性期的免疫反應是極為複雜的,有許多回 饋機制。因此無法以單一反應路徑來解釋,而需要全面且同時檢視 所有參與急性反應之細胞激素及免疫細胞49。以系統而言,不管損傷 的原因是出血、缺血、再灌注、骨折或組織損傷,身體對這些損傷 的反應即是要藉由協調免疫系統、心血管系統、內分泌系統及神經 系統來維持身體的恆定。自從1980年代末期以來,細胞激素、細胞 激素的介質、以及其接受體已被認定可做為外傷病患死亡及殘疾的 預測指標。此外,這些炎性介質所引發的系統性反應對原是因應身 體的損傷所採取的保護措施,然而過度的反應卻對宿主產生傷害。. 血中介質(mediator)的濃度通常與炎性反應的高低有平行的關係, 因此血中有高濃度的細胞激素,緊接而來的可能是嚴重的器官失調 (organ dysfunction)50。當嚴重損傷(如外傷性出血性休克)發生 時多型性中性白血球(PMN)是最早出現在損傷部位的免疫細胞, 並分泌許多介質包括細胞激素引發系統性炎性反應(Systemic 7.

(18) inflammatory response syndrome,SIRS),同時也刺激巨嗜細胞 (Macrophage)及淋巴球(Lymphocyte)進一步分泌各種細胞激素, 引發更激烈的SIRS反應或CARS(Compensated anti-inflammatory response syndrome)反應,導致包括補體、凝血等系統的活化,造成 內皮細胞及實質器官的損傷,如果此種反應持續激化,終致器官衰 竭而死亡。 就細胞激素的變化而言,外傷性出血性休克導致正炎性與抗炎 性細胞激素在血中濃度的變化,在時序上是有所不同的。之前已提 到的TNF-α最早產生,並促使其他細胞激素的分泌,但因其半衰期 很短故很快在血中的濃度即降下來,研究顯示40 TNF-α血中濃度在 外傷性出血性休克後1-2小時內即達到最高值,並在4小時內降下 來。IL-6及IL-10則隨之升高,IL-6血中濃度在4小時內即達高峰,但 在4小時即降下來;IL-10最慢升高,在4小時血中濃度仍在高點,在 12-24小時仍可在血中維持相當顯著的濃度。TNF-α血中濃度之所以 很快降低一方面因其半衰期很短,另外據信是因為受到IL-10及IL-6 的抑制。而IL-10及IL-6則是因TNF-α刺激巨嗜細胞而使分泌增加。 巨嗜細胞也可因自主神經系統釋出catecholamine的刺激產生IL-10, 但catecholamine卻可抑制TNF-α及IL-6的分泌。因此IL-6在血中的濃 度於4小時內也降低,這與用LPS誘發敗血症,IL-6能維持高血中濃 度超過24小時是有明顯不同的。 六、外傷性出血性休克對肝臟的影響 肝臟是一個代謝活力旺盛且複雜的器官,然而它也特別容易受 8.

(19) 到休克的影響而造成損傷。導致肝細胞損傷的原因很多,而其致病 幾轉也是多重的,然而炎性反應的活化、ROS(reactive oxygen species)過度製造、微循環的障礙、Kupffer 細胞的活化、微循環的 障礙、白血球及竇狀(sinusoidal)內皮細胞的黏著分子(adhesion molecule)的正調控(upregulation)、加強血管收縮物質的釋放、 增加肝血管對血管收縮物質的敏感度及血管擴張物質的負調控 (downregulation)是導致肝損傷共同的機轉. 51. 。而在出血性休克. 中,因缺血導致肝臟氧氣供應減少、造成肝細胞缺氧而產生氧自由 基(oxygen free radicals)並誘使中性白血球引發一連串炎性反應在 肝損傷的病理機轉佔有重要角色. 52-53. 。而肝細胞缺氧也會使得其製. 造 ATP 的能力降低,細胞膜及細胞器官(organelle)會損傷進而導 致肝功能失調。當出血性休克後以輸液急救後肝細胞 ATP 增加,然 而細胞因伴隨而來的腫脹而使得能量製造機制失調。在出血性休克 引致肝損傷的研究. 54. 發現循環中的 endothelin 是受到正調控的,而. endothelin 會影響肝門系統,進一步惡化肝臟微循環導致肝功能失 調。因此抑制 endothelin 對肝門系統的作用會減少出血性休克後肝 臟損傷 55-56。 在 Jarrar 及 Chaudry 回溯性研究中 57,他們將主要的焦點放在創 傷、出血性休克及敗血症後會產生細胞和組織,特別是肝細胞,失 調的因子與介質及其訊息傳導路徑。其中 mitogen-activated protein kinases(MAPK)、 轉錄因子(transcription factors)、一氧化氮(nitric oxide)、熱休克蛋白(heat shock proteins)及細胞激素尤其重要。 9.

(20) 七、性別差異與外傷預後 研究顯示,外傷好發於年輕男性。而在預後方面,Oberholzer 及其同事. 58. 在對 1,276 位外傷嚴重度分數(Injury Severity Score,. ISS)≧9 分的病患的研究中發現 ISS≧25 分的族群中男性產生敗血 症及多重器官衰竭的比率明顯高於女性(敗血症:30.7% 比 17.0%; 多重器官衰竭:29.6%比 16.0%)。這個結果顯示對於嚴重外傷,女 性預後優於男性。 此外 Majetschak 及其同事 59 在對 84 位 ISS≧16 分鈍挫傷傷患的研究中嚴重損傷的男性傷患其引發嚴重的敗血症與 創傷早期血中細胞激素的增加有關。這樣的發現顯示炎性反應的過 度活化會增加男性傷患因發敗血症的機會。 八、性別差異與免疫反應 許多研究指出性別差異源自於性賀爾蒙效用,外傷後性賀 爾蒙導致免疫不同反應。同時性賀爾蒙已經被證明造成男女性間心 臟血管反應,免疫反應,血中細胞激素,及 T 細胞活性之明顯地不 同;並可藉由其合成的賀爾蒙製劑與拮抗劑來調節上述之反應。 最近的研究顯示雄性賀爾蒙在外傷性出血性休克後產生免疫抑 制扮演重要角色 60-62。相反的,求偶前期(proestrus)的雌鼠在遭受 外傷性出血性休克後其心臟血管功能及免疫功能仍能維持. 63-64. 。而. 在出血性休克前 14 天將雄性動物閹割可預防免疫反應之抑制 65。此 外在雄性動物注射睪固酮接受體拮抗劑 flutamide 外傷性出血性休 克後免疫反應、心臟及肝臟功能的抑制 10. 66-67. 。因此在外傷性出血性.

(21) 休克中,雄性賀爾蒙在引發細胞及組織失能方面顯然扮演惡化的角 色。相反的,在求偶前期雌性賀爾蒙(如 prolactin 及 estrogen)濃 度的增加則對外傷性出血性休克的免疫反應則與雄性有相反的作 用。 九、性賀爾蒙濃度 如同先前所提到的,動物實驗顯示雌鼠對外傷性出血性休克後 引發的免疫及生理反應具有保護作用,而這個保護作用是因為 17β-estradiol (E2)之故。然而在臨床研究中,外傷性出血性休克後女 性是否有比男性有較好的預後則仍有不同的報告. 68. 。在臨床研究中. 女性賀爾蒙在不同月經週期的血中濃度不同,因此很難控制其血中 濃度。另一方面在老鼠的動物實驗中,雌性賀爾蒙則較容易控制因 為老鼠求偶週期很短,因此使得老鼠成為觀察在求偶週期各種變化 的理想動物。 老鼠的動情周期約 4-5 天,共分四期,分別為:求偶 前期(proestrus)、求偶期(estrus)、求偶間期(metestrus)及停 慾期(diestrus)。而上述四期可以光學顯微鏡觀察老鼠陰道抹片的 細胞型態來區分:在光學顯微鏡下,求偶前期陰道抹片的細胞型態 主要由有核的上皮細胞所組成;求偶期主要為無核的角化細胞;而 求偶間期由同等比率的白血球、無核角化細胞及有核上皮細胞所組 成;至於停慾期則主要為白血球 69。 在老鼠動情週期期間,求偶前 期有最高的血中二氫基女性素(estradiol)及泌乳激素(prolactin); 然而上述兩種激素在求偶期卻最低。 Zellweger 及其同事. 70. 在其研. 究中指出,雌鼠在求偶前期遭受出血性休克後其免疫反應相對於雄 11.

(22) 鼠是增強的。總結上述的發現,要在外傷性出血性休克後雌性賀爾 蒙對免疫功能及生理反應的研究上獲致滿意的結果,以適當的方法 選擇具有血中高濃度雌激素之求偶前期的雌鼠在研究性別差異對出 血性休克的影響是非常重要的。 十、基因體學 所謂基因體學即是藉由系統性的探索來研究整個基因體的結構 與功能,因此她又可分為結構基因體學(Structural genomics)及功 能基因體學(Functional genomics)。結構基因體學主要研究基因體 的結構,如人類基因體之定序。在美國健康總署及能源部的合作下, 人類基因體計畫組織(the Human Genome Project Organization; HGPO)正式於 1988 年成立,並由遺傳學家 Victor Mckusick 出任首 任負責人,期待藉由此自組織從事人類基因的解序工作。這個計畫 後來在與美國民間「賽雷拉」公司的競爭下,於 2003 年提前完成人 類基因序列的定序,基因體學從此進入一個嶄新的紀元。然而即使 知道基因體的定序,也只不過是掌握一本大書裡面所有字母排列, 書本所表達的意涵,字母所串成的文字及語句所代表的意義還是無 從得知。而基因體研究的目標不僅在了解基因體的結構,更希望藉 由探索基因在特定細胞形式、特定時間內的表現樣式以了解其在生 物體上的作用,也就是所謂的功能基因體學。在正常情況下我們是 看不出基因正的功能,唯有當基因發生變化、表現過強或受到抑制 甚至喪失功能時才能藉由與正常時的表現而了解其真正的作用。運 用這樣的觀念來從事功能基因體學的研究並應用於醫學上,已在遺 12.

(23) 傳疾病及癌症的診斷與治療方面有突飛猛進的發展,例如杭丁頓氏 症(Huntington’s disease)及囊纖化症(Cystic fibrosis)致病基因的 發現即是經典例證。因此以功能基因體學為基礎以發展出 DNA 診 斷、基因治療、細胞治療及藥物發現 71 對於從事醫學研究者而言不 轡是一個值得努力的方向。 然而要如何以功能基因體學來從事醫學研究?這勢必要了解研 究功能基因體學的技術。以點印跡分析(dot blot analysis)來探索某 基因在特定組織中隨時間而變化的表現樣式是其中常用的技術。然 而這種方法一次只能探究一種基因,若要全面研究該組織所有基因 隨時間改變而表現的樣式,是必須製造一個超大型的點印跡(dot blot)並包含相對應於細胞中所有可能 mRNA 的單股 DNA,接著再 讓標記過的細胞 RNA 和這個巨大的點印跡相互雜合 72-73。不過這些 DNA 點的體積會造成很大的問題。近年來由於由於半導體工業及生 物技術的發展,體積問題已獲致突破性的解決,分子生物學家發明 的生物晶片體積很小,是用來分析整個基因體或蛋白質體表現主要 的利器。生物晶片依其分析的對象可再分為基因晶片(Gene chip) 或稱 DNA 微陣列(DNA microaray)及蛋白質晶(Protein chip)片, 而 DNA 微陣列又有寡核苷酸微陣列(Oligonucleotide microaray)及 互補核苷酸微陣列(cDNA microaray)兩種。 十一、DNA 微陣列 DNA 微陣列是使用矽晶片、玻璃或高分子為材料,將已知序列 的寡核苷酸(稱為探針,probe)排列放置在微陣列上,再將待測樣 13.

(24) 品(target)滴在微陣列上,利用互補鹼基雜合作用的原理,由樣品 與微陣列上的基因序列相互作用的情形獲取所需的資訊並加以分 析。DNA 微陣列製作方式主要有兩種,一為原位合成法(in situ oligo synthesis),另一為預合成法(pre-synthesized oligos)。原位合成法 是利用光蝕刻技術(photolithographic technique)在小型玻璃微晶片 表面以微小、緊密相距的點建造短的 DNAs,其所製成的晶片即為 寡核酸微陣列。以這種技術製作而成的晶片以 Affymetrix 公司製造 的 25 員體(25-mers)的微晶片為代表,然而這種晶片成本較高。 預合成法則是將核苷酸預先合成,其長度甚至可達數千鹼基,再以 一具有平行筆針的機器將含有預合成的核苷酸點在晶片上,此種方 法成本較低但製作較耗時。 以 DNA 微陣列應用於醫學上可做為基因表現分析、基因型表現 及疾病管理 74。因為微陣列上的寡核苷酸或 cDNA 可以和細胞中分 離出來的、經過標記的 RNA(或是相對應的 cDNA)雜核,以研究 細胞中哪一個基因會被表現出來,再藉由電腦強大的分析功能以了 解基因體在生物體的表現形式及調控機制,進而做為疾病診斷及新 治療方式的研發。由於 DNA 微陣列技術的發展,它不僅被用來研 究遺傳疾病及癌症診斷與治療. 75-76. ,近幾年在敗血症引系統性炎性. 反應的研究中也大量使用此種技術來分析 77-80。應用 DNA 微陣列技 術研究敗血症導致基因表現值與量的變化可以對其所調控網絡有更 全觀及嶄新的視野,這對於治療因感染及發引導致器官衰竭提供新 的方向。Qureshi81 在今年五月份 Shock 雜誌中即發表以 DNA 微陣 14.

(25) 列 分 析 在 以 lipopolysaccharide ( LPS ) 引 發 炎 性 訊 息 傳 導 路 徑 (inflammatory signaling pathway),進而導致敗血性休克的老鼠實 驗中,proteasome 是調控這些路徑的關鍵介質。 十二、為何外傷性出血性休克須以 DNA 微陣列技術研究 嚴重外傷病患經常死於出血性休克、敗血症及多重器官衰竭。 而宿主炎性反應網絡(inflammatory network)的活化導致細胞及組 織損傷在上述症候群的致病機轉中扮演主要的角色。對外傷性出血 性休克的致病機轉及性別差異對其在免疫功能及生理反應影響的研 究方面在近幾十年來有相當的進展,然而大部份均針對某一特定介 質或訊息傳導路徑做研究,對於外傷性出血性休克後導致基因表現 的差異進而影響蛋白質的製造引發細胞內連串的反應及生物體的變 化並無全觀性的了解。事實上因外傷對生物體產生巨大的衝擊,正 可提供一個獨特的機會來研究基因體的變化以及其調控的蛋白質體 的變化,進而對外傷性出血性休克引發的系統性炎性反應有全面性 的了解,並發展出有效的治療,因為這種對生物體急速與巨大衝擊, 反而是癌症等慢性疾病及遺傳疾病所無法呈現的。DNA 微陣列提供 一個樞紐性工具,讓生物學界能夠了解複雜疾病之基因體變化,但 是目前為止,卻甚少被應用於嚴重外傷病患。 雖然外傷、出血性休克及感染均會引發系統性炎性反應,然而 它們在基因表現的變化及引發的訊息傳導路徑卻不盡相同 82。Cobb 等人 83 使用盲腸結紮及穿刺(cecal ligation and puncture,CLP) 模型 研究老鼠的脾臟(對刺激導致細胞凋亡敏感)及肝臟(反抗刺激導 15.

(26) 致細胞凋亡)在敗血症後基因的表現。藉由微陣列技術,他們發現 因敗血症導致老鼠 588 個基因有改變,而這些有改變的基因是具器 官特異性的。在這個研究中敗血症 24 小時後肝組織表現有改變的基 因大部分與膜蛋白及接受體有關;而在脾臟的部分則主要與訊息傳 遞介質(signaling cascades)、細胞死亡路徑(cell death pathways) 及細胞激素的製造有關。Biberthaler 等人. 84. 在嚴重多重外傷預後的. 臨床研究中,使用 Affymetrix U133A 微陣列分析單核白血球基因表 現的變化,發現死亡患者那組與活化 c-JUN 有關的正炎性基因及細 胞內傳導路徑均有過度表現的現象,顯示 c-JUN 與嚴重多重外傷的 預後有關。根據 Chen 等人 85 以 Atlas Rat 1.2 cDNA expression arrays 分析出血性休克及以不同輸液急救後在不同時間 (0 小時及 24 小時) 及不同組織(肝臟、肺臟及脾臟)基因表現的變化,顯示在嚴重的 出血性休克模型中,由基因調控的細胞反應深深受到休克本身及不 同輸液的影響。以上這些研究均使用微陣列技術對調控基因作全面 性的分析,藉由這種技術所獲致的資料以及以電腦強大的功能分析 這些資料,使我們對外傷、休克及感染所引發的系統性炎性反應有 更全面性的了解,甚至可由資料全面的探勘找出以前所未發現的機 轉。 外傷多發生於原來健康的生物體,我們假設當嚴重外傷發生後 身體會因基因體表現的改變引發一連串炎性及免疫的變化,若生物 體存活下來則基因體的表現再次回復正常。基於以上的推論,基因 體的表現因嚴重外傷巨大的衝擊而改變,使我們有機會在短時間內 16.

(27) 觀察到此一變化。因此我們可藉由生物模式(大白鼠外傷性出血性 休克及急救模型),比較外傷性出血性休克及以輸液及輸血急救對 臨床指標、細胞激素的影響,再利用 DNA 微陣列技術分析基因表 現的變化,以期找出其間的關聯。經由觀察雄鼠與雌鼠對外傷性出 血性休克與急救不同的反應與結果,也可探究性別對外傷性出血性 休克與急救所引發的系統性炎性反應的影響。 第二節 研究目的 在本研究中計畫以老鼠嚴重的外傷性出血性休克模型,並根據 以上的假設來觀察因性別導致性荷爾蒙差異對免疫反應及功能性基 因體學的影響。經由功能性基因體學對大白鼠外傷性出血性休克的 研究,期待能在臨床上對嚴重外傷性出血性休克病人的急救上有更 全面性及新的觀念以改善這類病人的預後。. 17.

(28) 第二章 研究方法 第一節 研究材料 ㄧ、實驗動物準備 本研究以大白鼠(Sprague-Dawley rats)為實驗對象,其來源為 中華民國國家科學委員會國家實驗動物繁殖及研究中心,雌雄各 半。所有動物自購入後即飼養於中國醫藥大學動物中心,室內溫度 維持在 23℃,並保持固定光照週期(光-暗週期:各 12 小時),所 有大白鼠均飼養至年齡 9-11 週大,才開始進行實驗。所有大白鼠在 實驗前均不限制其日常飲食。實驗前三天所有實驗動物即被送至實 驗室以適應實驗室的環境。實驗前有 15 分鐘穩定實驗動物生理狀況 並以溫度控制器維持實驗動物體溫( 37°C ± 0.5°C)直至實驗完成。 二、麻醉 以腹膜內注射 Citosol (25-40 mg/kg),直到大白鼠被適當麻醉。 三、導管準備 以 Polyethylene tubes(PE-50)進行動靜脈插管,包括插入右頸 靜脈以作為輸液輸注之用,並以 Cardiomax -II model 85(Columbus Instruments International Co., Ohio, USA)監測中心靜脈壓。插入右 股動脈並以 Cardiomax -II model 85(Columbus Instruments International Co., Ohio, USA)連續監測平均動脈壓。插入左股動脈 以作為抽血造成出血性休克及輸血急救之用。所有實驗動物在實驗 中均給予林格氏液輸注(10 毫升/公斤/小時),以補充體液喪失。 18.

(29) 四、實驗分組 36 隻大白鼠被隨機分成三組,每組 12 隻,雌雄各半,每組再 分成雌雄兩次組: 第一組:控制組(只施行剖腹手術,Sham operation) 第二組:出血性休克組(剖腹手術+出血性休克) 第三組:急救組(剖腹手術+出血性休克+輸血及輸液急救) 第二節 研究設計 ㄧ、出血性休克及急救模型 本實驗所採用出血性休克模型是使用固定血壓之出血 (fixed-pressure hemorrhage)。在第二組及第三組中,出血性休克 的誘發是以從左股動脈抽血,在十分鐘內讓平均動脈壓下降至 50+5 豪米汞柱,並以抽血及輸血方式維持此血壓 60 分鐘。休克維持 60 分鐘之後,第二組不給予急救;而第三組則給予輸血及輸液急救(原 抽血量均被完全輸回,並以兩倍於輸血 量之林格氏液輸注),急救 應於十分鐘內完成。第一組除了接受剖腹、動靜脈插管及給予基本 輸液外,在實驗期間並不給予誘發出課及急救。 急救期後,實驗動 物之動靜脈插管即予拔除,並將血管結紮,令其甦醒。四小時後所 有實驗動物均給予安樂死以進行抽血及取肝。. 19.

(30) 二、實驗步驟 時間(分) 0. 15. 25. 85. Gr. I. A. B. Gr. II. A. B. C. D. Gr. III. A. B. C. D. A1. B1. C1. 95. E E1. F1. A1: 開始準備實驗 A : 準備期 (90 分鐘): 包括剖腹手術(從恥骨到劍突沿腹中線切 開老鼠腹部後, 立即將傷口縫合)、儀器準備及動靜脈插管, 完 成以上步驟後才開始計時。 B1: 實驗開始(開始計時) B : 穩定期 (15 分鐘) C1: 開始抽血 C : 誘發出血性休克 (10 分鐘): 在 10 分鐘內, 從老鼠體內抽血(2.5 毫升/公斤體重), 平均動脈壓維持在 50+5 毫米汞柱 D : 休克維持期(60 分鐘):藉抽血或將血回輸維持平均動脈壓 在 50+5 毫米汞柱 E1: 開始急救:輸血及輸液 E : 急救期(10 分鐘): 1. 將抽出之血(2.5 毫升/公斤體重)輸回實驗動物血管內 2. 靜脈輸液(Lactated Ringer solution :5 毫升/公斤體重) 20.

(31) 說明 1. 灰色區域代表上述各項(ABCD)執行期間 2. 空白區域代表此段期間不做任何動作 3. 在第 85 分鐘時三組實驗動物全部執行上述 E 之動作 335. 時間(分)95 Gr. I. F. Gr. II. F. Gr. III. F F1. G1. F1:移除管路、結紮血管及縫合傷口。 F :恢復期(4 小時) G1:實驗開始後 4 小時(第 335 分鐘)以安樂死方式犧牲各次組老 鼠(各次組 6 隻), 並立即從死亡老鼠以心臟穿刺方式取得血液及 肝臟組織。恢復期期間若老鼠死亡,立即以上述方式取得血液及 肝臟組織以供研究。 三、血清收集與儲存 在老鼠被犧牲後即採用心臟穿刺的方式收集全血。並以含 EDTA 之試管收集血液並立即離心(速度:3000 轉/分,共 10 分鐘),. 21.

(32) 將上清液收集於抗凍離心管(1.5cc),再貯存於-70°C 冰箱中直至 分析。分析雌激素及細胞激素所使用的試劑簡述如下: 1. 17β-estradiol 血清濃度之分析是使用市售酵素連結免疫吸收分析 法(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA),其操作方法如 製造廠商所附的使用說明書(Cayman Chemical Company, USA )。 2. IL-1β, IL-6, IL-10 及 TNF-α 的血中活性也是以 ELISA 方式檢測, 其操作方法如製造廠商所附的使用說明書(R&D Systems, Inc, USA)。 四、肝臟組織取得與儲存 1. 肝臟組織取得步驟如下: 從恥骨到劍突沿腹中線切開老鼠腹部切下肝臟中葉一體節(重量 > 1 公克) , 並在中葉近端以 3-0 絲線結紮血管止血 2. 將肝臟組織至入標本瓶並迅速置入液態氮鋼瓶中,再送至-70oC 的冷凍庫中冷藏直到做微陣列(Microarray)分析。 五、微陣列技術 1. 介紹 本實驗是以 GeneChip® Rat Genome 230 2.0 Array (Affymetrix, Inc.,圖一),運用微陣列技術來分析核糖核苷酸在肝組織的表現, 它可檢測超過三萬個基因。GeneChip® Rat Genome 230 2.0 Array 的 製造是結合 photolithography 及 combinatorial chemistry 的技術而產稱 的 。 每 一 陣 列 上 ( Array ) 有 高 達 130 × 106 不 同 寡 核 苷 酸 22.

(33) (Oligonucleotide)探針被合成。每個寡核苷酸均位陣列上稱做 「Probe cell」的特定區域。每個 probe cell 數十萬至百萬份特定寡 核苷酸拷貝。 在實驗操作過程中以 biotin 標記的 RNA 或 DNA 片段我們稱之 為「目標物」會被雜合至探針陣列上。被雜合的探針會以 streptavidin phycoerythrin conjugate 染 色 並 以 GeneChip® Scanner 3000 或 GeneArray® Scanner 掃描。 在 570 nm 波長光射出量正比於與每個 探針陣列結合的標的物的量 86-87。 本實驗共分三組,每組再分雌雄兩次組,因為經費限制每組雌 雄各選擇兩個肝臟組織標本(共 12 個標本)進行 DNA 微陣列實驗。 2. GeneChip® 之操作及分析流程(圖二) 甲. 核醣核苷酸之準備(RNA preparation) 總 RNA 由 大 白 鼠 肝 組 織 標 本 被 萃 取 出 來 並 在 1% agarose-formaldehyde 膠上跑電泳以決定 RNA 的完整性。所有 RNA 標本必須達到分析品質要求以確保能以最高品質的 RNA 來 做微陣列雜合實驗。總 RNA 及以 biotin 標定的 cRNA 均須測定 其在 260nm 及 280nm 波長光吸收值(分別以 A260 及 A280 表示), 只有 A260∕A280 比值在 1.8 至 2.1 之間才符合標準。比值小於 1.8 代表蛋白質可能遭受污染;比值超過 2.1 則表示 RNA 可能變 質、truncated cRNA 轉錄本、或過多單獨核苷酸。總 RNA 通過 品質要求後才進行雙股 cDNA 的合成,接下來便是以 cDNA 為模. 23.

(34) 版在試管中進行轉錄(in vitro transcrirtion, IVT)反應來合成 cRNA。在進行雜合反應前 cRNA 會先被裂解成含 100 至 250 鹼 基對的片段。在 cDNA 合成後、cRNA 合成後及 cRNA 成片段後 均須以電泳來確保 cDNA、cRNA 及 cRNA 片段的品質以利雜合 的進行並獲致良好的實驗結果。 乙. 基因微陣列雜合(Gene microarray hybridization) 包含 cRNA 片段(標的物) 、probe array controls、BSA 及 herring sperm DNA 的雜合溶液會與探針陣列進行 16 小時的雜合反應。 丙. Fluidics Station Setup 在 PC 支援的工作站,使用 Affymetrix® Microarray Suite or GeneChip Operating Software (GCOS)來定義特定實驗資訊。探針 陣列形式、標本名稱及說明會先被輸入並以獨特的檔名存檔。完 成以上步驟並以適當緩衝液注入 fluidics station 後即準備進行洗 滌及染色。 丁. 探針陣列洗滌及染色 在完成雜合反應後便會在 fluidics station 上進行自動洗滌(去 除未雜合的 cRNA 片段)及染色。 戊. 探針陣列掃描 一旦探針陣列完成雜合、洗滌及染色,即開始進行掃描。每個 可執行 Affymetrix Microarray Suite 或 GCOS 軟體的工作站均控 制一個掃描器。軟體會定義 probe cells 並計算每個 cell 的強度。 每個完整的探針陣列影像會另以實驗名稱存成資料影像檔(.dat) 24.

(35) 己. 資料分析 藉由資料影像檔(.dat image)來分析每個 cell 的強度(cell intensity data),其結果以.cel 存檔。由 cell 的強度資料可產生探 針強度資料,其結果以長條狀或圖形的格式來表示,並以.chp 存 檔。最後就可產生基因表現的初步資料。數據分析的資訊由 GeneChip® Expression Analysis: Data Analysis Fundamentals booklet (P/N 701190)提供。 3. 基因表現之比較 資料完成初步分析後,可利用 NetAffxTM Analysis Center (www.affymetrix.com)、DNA-Chip Analyser(www.dchip.org)或 商用軟體系統 Genedata ExpressionistTM Pro 進行資料進一步探勘,包 括三組間基因表現差異的比較、表現基因的分群(Hierarchical clustering) 、Principal component analysis(PCA)及路徑探勘(Pathway exploration)。 第三節 統計方法 各組之間的比較是使用 one-way analysis of variance (ANOVA) 統計方式分析。同一組不同時期血行動力學資料的比較則是以 paired Student’s t- test 來分析。所有的數據均以平均值+標準差(Means +SD) 表示。 P 值<0.05 及表示有統計學上的意義。以上統計均使用市售 軟體 SPSS 第 13 版在電腦上執行。. 25.

(36) 第三章 研究結果 第一節 描述性統計分析: ㄧ、年齡與體重(表一) 三組在年齡方面並無明顯差異。但在體重方面若以同一性別比 較,三組並無明顯差異性;但若以各組性別差異比較,雄性次組明 顯比雌性次組重(p<0.05)。 表一:. 控制組. 休克組. 急救組. 年齡. 平均體重(範圍). (週數). (公克). 雄(n=6). 9-11. 338.2+29.0 (314-384). 雌(n=6). 9-11. 274.7+24.4 (250-316). 雄(n=6). 9-11. 351.2+13.0 (328-366). 雌(n=6). 9-11. 286.7+34.5 (233-336). 雄(n=6). 9-11. 338.2+19.8 (306-360). 雌(n=6). 9-11. 285.2+22.3 (253-305). P值. <0.05. <0.05. <0.05. 二、血行動力學變化 在平均中心靜脈壓(MCVP)的比較方面,控制組之雌性次組在 休克期的 MCVP 明顯高於雄性次組 (p<0.05,圖三)。無論是控制 組、出血性休克組或急救組,雄性次組在穩定期、休克期及急救期 之平均中心靜脈壓均有顯著差異(p<0.001);然而以上三時期的平 26.

(37) 均中心靜脈壓在控制組及出血性休克組的雌性次組卻無統計學上的 差異。在急救組的雌性次組也只顯示急救期的平均中心靜脈壓明顯 高於休克期及穩定期(p<0.001)。無論雌雄,急救組在急救期的平 均中心靜脈壓均明顯高於控制組及出血性休克組(p<0.05, 圖三)。 在平均動脈壓的比較方面(MABP),除了在出血性休克組之急 救期外,三組雌雄兩次組在相對應時期的平均動脈壓的比較上並無 統計學上的差異;在出血性休克組雌性次組之平均動脈壓在急救期 明顯高於雄性次組(p=0.048)。在控制組,無論雌雄各期的平均動 脈壓並無明顯差異。在出血性休克組,雄性次組平均動脈壓在休克 期及急救期並無統計學上差異;然而雌性次組急救期的平均動脈壓 卻明顯高於雄性次組。在急救組,無論雌雄其急救期的平均動脈壓 均明顯高於休克期 (p<0.001,圖四)。 三、死亡率與存活時間 在本實驗中控制組及急救組所有實驗動物均能存活至實驗終止 才被犧牲。然而在出血性休克組中,雄性次組有 4 隻(66.7%)在實 驗終止前即死亡(分別在恢復期第 14 分鐘、第 52 分鐘、第 72 分鐘 及第 187 分鐘死亡);而雌性次組有 3 隻(50%)死亡(分別在恢 復期第 91 分鐘、第 93 分鐘及第 185 分鐘)。. 27.

(38) 四、血清 17β-estradiol 的濃度 三組之雄性次組血中的 17β-estradiol 濃度均明顯低於雌性次組 (p<0.05,表二)。若以同ㄧ性別比較,三組 17β-estradiol 血中的濃 度則無統計學上的差異。 表二: 17β-estradiol (pg/ml). p值. 雄. 雌. 控制組. 25.2+6.8. 77.7+52.4. 0.035. 休克組. 16.4+8.3. 76.2+39.1. 0.004. 急救組. 21.4+12.1. 55.9+25.0. 0.012. 五、血清細胞激素濃度(表三~六) 1. 性別差異 無論是控制組或急救組其血中 TNF-α、IL-1β、IL-6 及 IL-10 濃度在雌雄的比較上並無明顯差異(p>0.05)。而在出血性休克組, 雌性次組血中 TNF-α、IL-1β及 IL-6 濃度明顯低於雄性次組(p< 0.001);然而其血中 IL-10 濃度卻明顯高於雄性次組(p<0.001)。 2. 三組間的差異 不論性別,出血性休克組有最高的血中細胞激素濃度而控制組 則最低。與控制組比較,出血性休克雄鼠次組血中正炎性細胞激素 升高程度明顯高於雌鼠,其升高倍數分別為 TNF-α:5.7 倍、IL-1β: 18.1 倍、IL-6:15.9 倍;而雌鼠次組升高的倍數則分別為 TNF-α: 28.

(39) 2.3 倍、 IL-1β:2.8 倍、UL-6:2.6 倍。出血性休克組雄性次組 IL-10 升高的倍數為 4 倍;而雄性次組升高只有 1.9 倍。 與出血性休克組比較,急救組四小時的血中細胞激素濃度均顯 著下降(p<0.001),雖仍高於控制組,但與控制組並無顯著差異。 與出血性休克組比較,急救組雄鼠次組血中正炎性細胞激素下降程 度明顯大於雌鼠,其下降程度分別為 TNF-α:85.8%、IL-1β:92.5%、 IL-6:91.8%;而雌鼠次組下降程度則分別為 TNF-α:60.2%、 IL-1 β:61.8%、IL-6:57.8%。至於在抗炎性細胞激素方面,雌鼠次組 下降的程度則明顯大於雄性次組。急救組中雌性次組 IL-10 下降程 度為 72.2%;而雌性次組則為 46.8%。 表三: TNF-α (pg/ml). p值. 雄. 雌. 控制組. 40.0+3.0. 42.9+4.5. 0.695. 休克組. 228.4+26.4#. 98.9+13.1*#. *<0.001. 急救組. 37.1+3.2. 39.4+7.8. 0.758. P值. #. <0.001 vs 控制組及急救組. 29.

(40) 表四: IL-1β(pg/ml). p值. 雄. 雌. 控制組. 558.4+33.1. 450.8+35.2. 0.444. 休克組. 10082.9+575.0#. 1275.7+87.6*#. *<0.001. 急救組. 756.9+60.4. 487.1+42.4. 0.061. p值. #. <0.001 vs 控制組及急救組. 表五: IL-6(pg/ml). p值. 雄. 雌. 控制組. 606.8+38.3. 503.8+31.1. 0.442. 休克組. 9674.8+547.6#. 1290.5+84.3*#. *<0.001. 急救組. 791.0+66.1. 545.1+36.9. 0.073. P值. #. <0.001 vs 控制組及急救組. 表六: IL-10(pg/ml). p值. 雄. 雌. 控制組. 127.6+21.7. 146.7+16.4. 0.107. 休克組. 264.2+16.5#. 581.3+28.9*#. *<0.001. 急救組. 140.6+16.9. 161.5+16.9. 0.079. p值. #. <0.001 vs 控制組及急救組 30.

(41) 第二節 推論性統計分析 一、血中細胞激素與其相對應基因在肝組織表現之比較 對於 GeneChip® Array (Rat Expression Array 230 2.0),TNFα、IL-1β、 IL-6 及 IL-10 基因之 probe set ID 如表七。 Probe set ID. 基因 TNF-α. 1370928_at. IL-1β. 1398256_at. IL-6. 1387087_at. IL-10. 1387711_at. 控制組、出血性休克組及急救組 TNF-α、IL-1β、 IL-6 及 IL-10 血中濃度與其相對應基因在肝臟組織表現之比較分別圖示如 圖五~八。 二、微陣列分析 三組實驗動物分別各取一雄一雌之肝組織進行微陣列之分析 (每一組織做兩片晶片,共十二片)。所採用的晶片為 GeneChip®Probe Arrays (Affymetrix, Inc.),此晶片可檢測超過三萬個 基因。在 635nm 波長下基因的訊號顯示為 P call 者才列入分析。 Up-regulation 基因定義為以 2 為底的對數(log ratio)>1.5;而 Down-regulation 基因則定義為以 2 為底的對數(log ratio)<-1.5。 為分析出血性休克、急救及性別對基因表現的影響,本研究將基 因表現分成下列九種狀況:表八 31.

(42) F/M >1.5. 1.5~-1.5. <-1.5. M >1.5. A. B. C. 1.5~-1.5. D. E. F. <-1.5. G. H. I. F/M:Log ratio of signal of female over male M:Log ratio in male A:休克(或急救)及雌激素的影響皆為 up-regulation B:休克(或急救)的影響為 up-regulation,但雌性為 non-significance C:休克(或急救)的影響為 up-regulation,但雌性為 down-regulation D:休克(或急救)的影響為 non-significance,但雌性為 up-regulation E:休克(或急救)及雌性的影響皆為 non-significance F:休克 (或急救) 的影響為 non-significance,但雌性為 down-regulation G:休克(或急救)的影響為 down-regulation,但雌激素為 up-regulation H:休克(或急救)的影響為 down-regulation,但雌性為 non-significance I:休克(或急救)及雌性的影響皆為 down-regulation 1. 出血性休克組與控制組基因表現之比較 在與控制組的基因比較下,出血性休克組中有 12762 個基因 (41.11%)在兩性均有顯著訊號(P),表列如表九:. 32.

(43) 表九: 基因表現 休克對基因的影響. 基因個數 (N=12762). 性別對基因的影響 (雌性 vs 雄性). Up-regulation(U). 無明顯影響(N). Down-regulation(D). U. 7(0.05). N. 317(2.48). D. 236(1.85). U. 257(2.01). N. 11479(89.95). D. 197(1.54). U. 105(0.82). N. 162(1.27). D. 2(0.02). 甲、出血性休克對基因表現有影響,但性別無影響者 表十: Up-regulation 共 317 個基因(在 Biocarta 網站上可找到 Pathway 者有 30 個基因) Probe Set ID. 1367648_at. Gene Title. insulin-like growth factor. Gene. Log Ratio. Symbol. Male Female. Igfbp2. binding protein 2 1367707_at. fatty acid synthase. Fasn 33. 3.6. -1.4. 2. -0.9.

(44) 1367720_at. aminolevulinate, delta-,. Alad. dehydratase 1367892_at. pyruvate dehydrogenase enoyl-Coenzyme A,. 0.4. 2.6. 0.8. 2.2. 1.2. 5.1. 0. 1.6. 0.8. 2.8. -0.2. 1.9. 0.1. 2. 1.1. 1.7. 1.8. 3.1. 0. 1.6. 1.1. 1.9. 0.8. 1.9. 0.9. Pdk2. kinase, isoenzyme 2 1368283_at. 2.1. Ehhadh. hydratase/3-hydroxyacyl Coenzyme A dehydrogenase 1368458_at. cytochrome P450, family 7, Cyp7a1 subfamily a, polypeptide 1. 1368651_at. pyruvate kinase, liver and. Pklr. RBC 1368692_a_at Choline kinase alpha. Chka. 1368794_at. Haao. 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase. 1368915_at. kynurenine. Kmo. 3-monooxygenase (kynurenine 3-hydroxylase) 1369150_at. pyruvate dehydrogenase. Pdk4. kinase, isoenzyme 4 1370787_at. BCL2-like 11 (apoptosis. Bcl2l11. facilitator) 1370812_at. Bcl2-like 1. Bcl2l1. 同 1370787_at(表十) 1370870_at. malic enzyme 1. Me1. 1370968_at. nuclear factor of kappa light Nfkb1 34.

(45) chain gene enhancer in B-cells 1, p105 1371363_at. glycerol-3-phosphate. Gpd1. dehydrogenase 1 (soluble). 2.9. 0.3. 1371819_at. Histone deacetylase 5. Hdac5. 1.9. 0.6. 1371824_at. adenylate kinase 3-like 1. Ak3l1. 2.1. 0.6. 1374524_at. selenocysteine lyase. RGD:1359 1.6. 0.2. 2.2. -0.2. 2.6. -0.1. 514 1375673_at. Mitogen activated protein. Map3k1. kinase kinase kinase 1 1375852_at. 3-hydroxy-3-methylglutaryl Hmgcr -Coenzyme A reductase. 1376755_at. retinoic acid receptor, beta. Rarb. 2.5. 0.5. 1379526_at. Myelin basic protein. Mbp. 2.2. 0. 1382778_at. Dual specificity phosphatase Dusp6 2.1. 3.1. 1.6. 0.6. 2.5. 0.7. 1.6. 2. 6 1384842_s_at Tumor necrosis factor receptor superfamily,. RGD:6198 31. member 6 1386947_at. cadherin 1. Cdh1. 1387156_at. hydroxysteroid (17-beta). Hsd17b2. dehydrogenase 2 1387312_a_at Glucokinase. Gck. 1.8. 0.5. 1388240_a_at integrin alpha 7. Itga7. 1.9. -0.7. 35.

(46) 1398282_at. kynureninase (L-kynurenine Kynu hydrolase). 2. -1. 表十一: Down-regulation 共 162 個基因(在 Biocarta 網站上可 找到 Pathway 者有 11 個基因) Probe Set ID. 1367701_at. Gene Title. Gene. Log Ratio. Symbol. Male Female. receptor (calcitonin) activity Ramp2 modifying protein 2. 1367834_at. spermidine synthase. Srm. 1368835_at. signal transducer and. Stat1. activator of transcription 1 1368975_at. CD38 antigen. Cd38. 1370096_at. perforin 1 (pore forming. Prf1. protein) 1370256_at. frizzled homolog 1. -0.9. -1.8. -0.1. -1.9. -0.1. -2. -0.3. -1.7. 0.7. -1.8. -0.1. -1.7. -0.8. -1.7. 0.1. -2.1. -0.2. -1.7. -0.6. Fzd1. (Drosophila) 1373400_at. -1.7. Protein kinase,. Prkar2a. cAMP-dependent, regulatory, type 2, alpha 1390325_at. CD38 antigen. Cd38. 同 1368975_at(表十一) 1393347_at. integrin alpha L. Itgal. 1393987_s_at G protein-coupled receptor Gprk6 kinase 6 36.

(47) 1396446_at. calcium activated. Cant1. nucleotidase 1. -1.7. -0.1. 乙、性別對基因表現有影響,但出血性休克無影響: 表十二: Up regulation : 共 257 genes(在 Biocarta 網站上可找到 Pathway 者有 10 個基因) Probe Set ID. 1368247_at. Gene Title. Gene. Log Ratio. Symbol. Male Female. heat shock 70kD protein 1A Hspa1a heat shock 70kD protein 1B Hspa1b. 1368430_at. Legumain. Lgmn. 1368862_at. v-akt murine thymoma viral Akt1 oncogene homolog 1. 1369197_at. apoptotic peptidase. 3.2. -0.9. 0. -1.3. -0.3. -1.4. 0.4. 0.1. -0.3. 0. 0.6. -1.3. 1. Apaf1. activating factor 1 1369943_at. -1. transglutaminase 2, C. Tgm2. polypeptide 1370530_a_at phospholipase D1. Pld1. 1374232_at. Pik3ca. phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic, alpha polypeptide. 1383075_at. cyclin D1. Ccnd1. -0.5. 1.8. 1384580_at. complement component 6. C6. -0.9. 1. 1396411_at. phosphatidylinositol. Pik3ca. -1.4. -0.2. 37.

(48) 3-kinase, catalytic, alpha polypeptide 同 1374232_at(表十二) 表十三: Down-regulation 共 197 個基因(在 Biocarta 網站上可找 到 Pathway 者共 23 個基因) Probe Set ID. 1367652_at. Gene Title. insulin-like growth factor. Gene. Log Ratio. Symbol. Male Female. Igfbp3. binding protein 3 1367920_at. 1.5. -0.4. -0.1. -0.1. 0.6. -2.7. -0.6. 0.1. 1.3. 0.1. 0.7. -0.7. 0.3. 1.2. endothelial differentiation, Edg5 sphingolipid G-protein-coupled receptor, 5. 1367940_at. chemokine orphan receptor Cmkor1 1. 1367985_at. aminolevulinic acid. Alas2. synthase 2 1368144_at. regulator of G-protein. Rgs2. signaling 2 1368160_at. insulin-like growth factor. Igfbp1. binding protein 1 同 Igfbp2(表十) 1368659_at. alanine-glyoxylate. Agxt2. aminotransferase 2 38.

(49) 1369050_at. phosphatidylinositol. Pik3c2g. 3-kinase, C2 domain containing, gamma polypeptide. 1. 0.3. 1.1. 1.1. 1.4. 1.4. 1.2. 0.3. 0.8. 0.1. 0.6. -0.8. 0.3. -0.5. 1.4. -0.7. 1.3. -0.5. 0.7. 0.1. 1369467_a_at 6-phosphofructo-2-kinase/fr Pfkfb1 uctose-2,6-biphosphatase 1 1369485_at. cytosolic acetyl-CoA. Cach. hydrolase 1369986_at. hydroxyacyl glutathione. Hagh. hydrolase 1370725_a_at glucose-6-phosphatase,. G6pc. catalytic 1377064_at. dual specificity phosphatase Dusp6 6 同 1382778_at(表十). 1383094_at. Interleukin 2 receptor,. Il2ra. alpha chain 1384574_at. UDP-glucose. Ugdh. dehydrogenase 1386881_at. insulin-like growth factor. Igfbp3. binding protein 3 同 1374232_at(表十三) 1386944_a_at glucose-6-phosphatase,. G6pc. catalytic 同 1370725_at(表十三) 39.

(50) 1386953_at. hydroxysteroid 11-beta. Hsd11b1. dehydrogenase 1 1387024_at. -0.2. 0. 0.9. -0.1. 1.3. -0.3. 1.2. -0.1. -0.4. 0.3. 1.2. 0.7. dual specificity phosphatase Dusp6 6 同 1382778_at(表十) 同 1377064_at(表十三). 1387074_at. regulator of G-protein. Rgs2. signaling 2 同 1368144_at(表十三) 1387357_at. trimethyllysine. Tmlhe. hydroxylase, epsilon 1387505_at. guanine nucleotide binding Gnai1 protein, alpha inhibiting 1. 1387951_at. decay accelarating factor 1 Daf1. 丙、同時受出血性休克及性別(雌 vs 雄)的影響: 表十四: 均為 Up-regulation 共 7 個基因(在 Biocarta 網站上可找到 Pathway 者無) Probe Set ID. 1368569_at. Gene Title. Gene. Log Ratio. Symbol. Male Female. aldo-keto reductase family Akr1b7 1, member B7. 1369493_at. 3.4. 0.2. Prolactin receptor. Prlr. 3.2. 0.1. 1370384_a_at Prolactin receptor. Prlr. 3.8. -0.5. 40.

(51) 1370789_a_at Prolactin receptor. Prlr. 3.8. 0.2. 1376944_at. Prlr. 4.7. -0.8. 1.7. 0.7. 4.7. -0.2. Prolactin receptor. 1379238_at 1387006_at. rat senescence marker. Smp2a. protein 2A gene, exons 1 and 2. 表十五:出血性休克為 Up-regulation;性別為 Down-regulation, 共 236 個基因(在 Biocarta 網站上可找到 Pathway 者共 34 個基因) Probe Set ID. 1368073_at. Gene Title. Gene. Log Ratio. Symbol. Male Female. interferon regulatory factor Irf1 1. 1368124_at. 3.4. 0.8. 2.6. 0. 3.1. -0.1. 3.6. 0. 2.1. -0.7. dual specificity phosphatase Dusp5 5 同 Dusp1,6. 1368146_at. dual specificity phosphatase Dusp1 1 同 Dusp1,5. 1368147_at. dual specificity phosphatase Dusp1 1 同 1368146_at(表十五). 1368308_at. myelocytomatosis viral oncogene homolog (avian) 41. Myc.

(52) 1368519_at. serine (or cysteine). Serpine1. proteinase inhibitor, clade E, member 1 1368527_at. -1.7. 4.6. 0.7. 2.7. -0.7. 2.6. 0. 2.7. -0.3. 2.9. -1. prostaglandin-endoperoxide Ptgs2 synthase 2. 1368592_at. interleukin 1 alpha. Il1a. 1368869_at. A kinase (PRKA) anchor. Akap12. protein (gravin) 12 1368871_at. 5.3. mitogen activated protein. Map3k1. kinase kinase kinase 1 同 1375673_at(表十) 1368947_at. growth arrest and. Gadd45a. DNA-damage-inducible 45 alpha 1369044_a_at phosphodiesterase 4B. Pde4b. 3.8. 0.2. 1369191_at. interleukin 6. Il6. 1.9. 1.6. 1369268_at. activating transcription. Atf3 5.9. 0.6. 1.7. 0.2. 2.9. 0.9. 2.4. -0.3. factor 3 1369526_at. acyl-Coenzyme A. Acadsb. dehydrogenase, short/branched chain 1369560_at. glycerol-3-phosphate. Gpd1. dehydrogenase 1 (soluble) 同 1371363_at(表十) 1369788_s_at v-jun sarcoma virus 17 42. Jun.

(53) oncogene homolog (avian) 1369863_at. alcohol dehydrogenase 4. Adh4. (class II), pi polypeptide 1370113_at. inhibitor of apoptosis thyroid hormone receptor glutamate-cysteine ligase,. 2.1. -0.2. 1.7. -0.2. 2.7. -0.6. 2.9. 0.1. 2.9. -0.5. 3. -1.6. 3.5. -0.9. 2.3. -3. 3. -0.8. Il1a. 同 1369592_at(表十五) 1374404_at. -0.2. Gclc. catalytic subunit 1371170_a_at interleukin 1 alpha. 3.1 Thrb. beta 1370688_at. 1.2. Birc3. protein 1 1370474_at. 3.3. v-jun sarcoma virus 17. Jun. oncogene homolog (avian) 同 1369788_s_at(表十五) 1378960_at. Glycerol-3-phosphate. Gpd1. dehydrogenase 1 (soluble) 同 1371363_at(表十) 同 1369560_at(表十五) 1380230_at. GTP cyclohydrolase 1. Gch. 1382982_at. Guanine nucleotide binding Gnb1 protein, beta 1. 1387144_at. integrin alpha 1. Itga1. 同 Itga7(表十) 同 Itgal(表十一 ) 1387219_at. Adrenomedullin. Adm 43.

(54) 1387263_at. pyruvate kinase, liver and. Pklr. RBC 同 1368651_at(表十). 2.2. 0.3. 1.6. 0. 2.8. -0.5. 3.1. -0.4. 2.7. 0.2. 4.7. -1.5. 1387573_a_at nuclear receptor subfamily Nr5a2 5, group A, member 2 1387788_at. Jun-B oncogene. Junb. 1387848_at. 3-hydroxy-3-methylglutaryl Hmgcr -Coenzyme A reductase 同 1375852_at(表十). 1389528_s_at v-jun sarcoma virus 17. Jun. oncogene homolog (avian) 同 1369788_s_at(表十五) 同 1374404_at(表十五) 1392264_s_at serine (or cysteine). Serpine1. proteinase inhibitor, clade E, member 1 同 1368519_at(表十五). 表十六:出血性休克為 Down-regulation;性別為 Up-regulation, 共 105 個基因(在 Biocarta 網站上可找到 Pathway 者:3 個基因) Probe Set ID. 1367881_at. Gene Title. protein tyrosine. Gene. Log Ratio. Symbol. Male Female. Ptpns1. phosphatase, non-receptor 44. -1.6. -0.1.

(55) type substrate 1 1388135_at. replication protein A2. Rpa2. 1389195_at. DNA fragmentation factor, Dffa alpha subunit. -1.8. 0.2. -1.9. 0. 表十七:出血性休克及性別均為 Down-regulation,共 2 個基因(在 Biocarta 網站上可找到 Pathway 者:0 個基因) Probe Set ID. Gene Title. 1368447_x_at serine protease inhibitor,. Gene. Log Ratio. Symbol. Male Female. Spink1. Kazal type 1 1387193_a_at serine protease inhibitor,. -2.7. 1.8. -2.7. 3.9. Spink1. Kazal type 1 丁、基因分類 表十八: 摘要 Rat230_2 probe sets:. 31099. Rat230_2 probe sets annotated molecular function:. 14240. Uploaded probe sets:. 1283. Uploaded probe sets annotated molecular function:. No. (%). 分子功能 45. 700. p value.

(56) Enzyme regulator activity (858). 55 (6.4). 0.05594. Transporter activity (2095). 89 (4.2). 0.12595. Signal transducer activity (2731). 146 (5.3). 0.24729. Binding (10707). 511 (4.7). 0.16897. 86 (5.6). 0.17478. Catalytic activity (5780). 303 (5.2). 0.13635. Anti-oxidant activity (59). 12 (3.3). 0.58695. Translation regulator activity (174). 2 (1.1). 0.02931. Motor activity (196). 3 (1.5). 0.03980. 17 (2.0). 6.6×10-5. Transcription regulator activity (1529). Structural molecule activity (844) 表十九: 摘要 Rat230_2 probe sets:. 31099. Rat230_2 probe sets annotated cellular component:. 12740. Uploaded probe sets:. 1283. Uploaded probe sets annotated cellular component:. No. (%). 細胞組成. 596. p value. Extracellular matrix (285). 11 (3.8). 0.50809. Extracellular region (2354). 116 (4.9). 0.52533. 99 (3.5). 0.00213. 3 (60.0). 4.93×10-9. Protein complex (2774) Glycerol-3-phosphatase dehydrogenase 46.

(57) complex (5) 558 (4.6). 0.84475. 1 (10.0). 0.42530. 398 (4.6). 0/64319. 17 (33.3). 2.79×10-22. Cell fraction (1040). 63 (6.0). 0.12761. Basal part of cell (10). 1 (10.0). 0.42530. Apical part of cell (68). 3 (4.4). 0.91692. Cell surface (134). 9 (5.0). 0.47648. Membrane (5554). 280 (5.0). 0.08785. 17 (23.9). 1.31×10-14. Cell projection (287). 7 (2.4). 0.12091. Leading edge (83). 5 (6.0). 0.56019. 8 (2.7). 0.12761. Membrane-enclosed lumen (870). 35 (4.9). 0.34308. Envelope (410). 12 (2.9). 0.08782. Cell (11903) ATP-binding cassette transporter complex (10) Intracellular (8618) HMC protein complex (51). Immunological synapse (71). Synapse (286). 47.

(58) 2. 急救組與出血性休克組的比較: 在與休克組的基因比較下,急救組中有 14258 個基因(45.93%) 在兩性均有顯著訊號(P),表列如表二十: 基因個數. 基因表現 急救對基因的影響. 性別對基因的影響. (N=14258). (雌性 vs 雄性). Up-regulation(U). 無明顯影響(N). Down-regulation(D). U. 4(0.03). N. 467(3.28). D. 71(0.50). U. 138(0.97). N. 13109(91.94). D. 164(1.15). U. 40(0.28). N. 251(1.76). D. 14(0.10). 48.

(59) 甲、輸液治療對基因表現有影響;性別無影響 表二十一: Up-regulation 共 467 個基因(在 Biocarta 網站上可找到 Pathway 者:21 個基因) Probe Set ID. Gene Title. Gene. Log Ratio. Symbol Male Female 1368229_at. survival of motor neuron. Sip1. protein interacting protein 1 1368647_at. G protein-coupled receptor. 1.6. 0.3. 1.8. 0.6. 1.8. 0.3. 1.9. 0.3. 2.2. 1. 1.6. 0. 1.8. -0.1. 1.7. 0.7. Gprk6. kinase 6 同 1393987_s_at(表十一) 1368862_at. v-akt murine thymoma viral. Akt1. oncogene homolog 1 同 1368862_at(表十二) 1368896_at. MAD homolog 7 (Drosophila) Madh7 同 Sip1(表二十一). 1369248_a_at baculoviral IAP. Birc4. repeat-containing 4 1370450_at. tropomyosin 3, gamma. 1370531_a_at phospholipase D1. Tpm3 Pld1. 同 1370530_a_at(表十一) 1373400_at. Protein kinase,. Prkar2a. cAMP-dependent, regulatory, type 2, alpha 同 1373400_at(表十一) 49.

(60) 1374232_at. phosphatidylinositol 3-kinase, Pik3ca catalytic, alpha polypeptide 同 1368144_at(表十二). 1386897_at. heterogeneous nuclear. 2.4. -0.2. 2.9. -0.1. 2. 0.9. 1.9. 0.2. 5. 0.8. 1.6. -0.1. 2. -0.4. 3.1. 0.4. 2.2. 1.5. 2. -0.6. Hrmt1l2. ribonucleoproteins methyltransferase-like 2 1387120_at. proteasome (prosome,. Psmc3. macropain) 26S subunit, ATPase 3 1387391_at. cyclin-dependent kinase. Cdkn1a. inhibitor 1A 1387940_at. eukaryotic translation. Eif2b5. initiation factor 2B, subunit 5 epsilon 1388130_at. Zyxin. Zyx. 1389867_at. CUG triplet repeat, RNA. Cugbp2. binding protein 2 同 Hrmt1l2 (表二十一) 1390386_at. caspase 3. Casp3. 1397221_s_at Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 6 同 1384842_at(表十) 1398249_at. RGD:619 831. solute carrier family 25 (carnitine/acylcarnitine translocase), member 20 50. Slc25a20.

(61) 1398764_at. ribosomal protein L21. 1398831_at. proteasome (prosome,. Rpl21. 2. 0.2. 1.8. 1.2. 2.1. -0.7. macropain) subunit, beta type Psmb4 4 1398869_at. proteasome (prosome, macropain) 26S subunit,. Psmc4. ATPase, 4. 表二十二: Down regulation 共 251 個基因(在 Biocarta 網站上可 找到 Pathway 者有 44 個基因) Probe Set ID. Gene Title. Gene. Log Ratio. Symbol Male Female 1367707_at. fatty acid synthase. Fasn. 同 1367707_at(表十) 1367708_a_at fatty acid synthase. -2.8. -0.8. -2.2. -0.5. -4.4. -1.6. -2.3. -1.5. -2.4. -1.3. -3. -0.4. farnesyl diphosphate farnesyl Fdft1 transferase 1. 1367854_at. ATP citrate lyase. Acly. 1367856_at. glucose-6-phosphate. G6pd. dehydrogenase 1367892_at. -0.8. Fasn. 同 1367707_at(表十、二十二) 1367839_at. -3.6. pyruvate dehydrogenase. Pdk2. kinase, isoenzyme 2 同 1367892_at(表十) 1368073_at. interferon regulatory factor 1 Irf1 51.

(62) 同 1368073_at(表十五) 1368144_at. regulator of G-protein. Rgs2. signaling 2 同 1368144(表十三) 同 1387024(表十三). -1.7. 0.1. -1.9. 0.4. -2.4. 1.1. -2. -0.4. -1.9. 0.4. -2.6. -1. -2.1. -2. 同 1368527_at(同表十五). -3.1. -0.3. 1368574_at. adrenergic receptor, alpha 1b Adra1b. -2.2. -0.3. 1368592_at. interleukin 1 alpha. -3.1. 0.9. 1368146_at. dual specificity phosphatase 1 Dusp1 同 1368146_at(同表十五) 同 1368147_at(同表十五). 1368147_at. dual specificity phosphatase 1 Dusp1 同 1368146_at(同表十五) 同 1368147_at(同表十五). 1368275_at. sterol-C4-methyl oxidase-like Sc4mol. 1368308_at. myelocytomatosis viral. Myc. oncogene homolog (avian) 同 1368308_at(同表十五) 1368378_at. formyltetrahydrofolate. Fthfd. dehydrogenase 1368458_at. cytochrome P450, family 7,. Cyp7a1. subfamily a, polypeptide 1 同 1368458_at(同表十) 1368527_at. prostaglandin-endoperoxide. Ptgs2. synthase 2. Il1a 52.

(63) 同 1368592_at(同表十五) 同 1371170_at(同表十五) 1368651_at. pyruvate kinase, liver and. Pklr. RBC 同 1368651_at(同表十) 同 1387263_at(同表十五) 1368871_at. mitogen activated protein. -2.5. -0.8. -2.4. 0. -2.5. 0.4. -2.1. 0.1. -2.4. 0.2. -1.9. -0.2. -2.3. -1.3. Map3k1. kinase kinase kinase 1 同 1375673_at(同表十) 同 1368871_at(同表十五) 1369044_a_at phosphodiesterase 4B. Pde4b. 同 1369044_a_at(同表十五) 1369519_at. endothelin 1. Edn1. 1369560_at. glycerol-3-phosphate. Gpd1. dehydrogenase 1 (soluble) 同 1371363_at(同表十) 同 1369560_at(同表十五) 同 1378960_at(同表十五) 1369788_s_at v-jun sarcoma virus 17. Jun. oncogene homolog (avian) 同 1369788_s_at(同表十五) 同 1374404_at(同表十五) 同 1389528_s_at(同表十五) 1370067_at. Malic enzyme 1. Me1. 同 1370870_at(同表十). 53.

數據

圖 表 目 錄 圖 1 :   G e n e C h i p ® R a t   G e n o m e   2 3 0   2 . 0   A r r a y   A f f i m e t r i x ) 晶 片 . . . . . . 72  圖 2 : D N A 微 陣 列 操 作 及 分 析 流 程 . . 73  圖 3 : 平 均 中 心 靜 脈 壓 之 變 化   . . . . 74  圖 4 : 平 均 動 脈 壓 之 變 化       . . . . . 74  圖 5 :
圖 表

參考文獻

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