本研究結構係源自於反恐怖主義崛起，衍生全球各國對反恐機制與策略擬訂，為遏 制恐怖組織及勢力，各國國內外均提出相關合作協議及反恐政策，為防止恐怖主義對國 家的威脅，必須建立相關機制及應變單位。
本篇論文先以各國反恐機制及近年恐怖主義型態為題，探討哪一些國家的反恐機制 是值得學習，還有近年國際恐怖主義型態與發展後，以我國反恐機制及國防部所制定的 反恐機制，與歐美先進國家比較與參考，是否能對我國發展有所助益，在我國政府在反 恐行動架構中面臨實務操作上之因境，導致地方政府與中央機關在反恐成效上難保統一 行事。
在一、二章說明反恐機制及國際恐怖主義後，在國內行政與國安雙規制度下，如何 運有國防部資源及發揮處置能力，並將國軍反恐機制在實務上的問題作討論，再以國軍 憲兵特勤隊為例，在能力、組織、裝備、訓練及身份上深入研究，身為國防部最有戰力 的特勤隊，幾乎在每次演練都會出現，可見在反恐行動中是非常重要的部隊之一，仍而 反恐任務從體制面到執行面是有部份落差的，再加上單位特殊性，我們要如何驗證反恐 機制是本論的重點。
面對國際反恐情勢的變化，對中華民國的威脅雖然很小，但面對恐怖攻擊，必須擁 有有效的方法與確保行動的正當性，所以體制上如何制定，會事先預想各種可能發生的 狀況，再來尋求解決方式及單位，所以面對國際情勢變化，也要適時的修改，才能面對 各種恐怖攻擊及處置。最後在面論文結束時，提出研究發現與未來展望，在反恐機制及 定位突顯出制度改革之必要與後續研究。
二、章節安排
本研究的研究架構共有六章，茲將各章內容概述如下：
本論文第一章為緒論，依序闡明全文的研究動機與目的、反恐及恐怖主義相關文章 進行文獻探討、研究途徑與方法、研究範圍與限制及研究架構，在第一章的架構裡，將 本論文所蒐集的資料做初步的統整，並在後續章節完整說明。
第貳章為「國際恐怖主義的發展」，恐怖主義在全球不斷擴張下，已是不容忽視的議 題，要先瞭解現今恐怖主義的發展與定位，將近年發生的國際重大恐怖攻擊事件整理與 分析，並找出潛在威脅，以擬定反恐對策及機制。極端恐怖組織已嚴重衝擊了地區和國 際秩序，為遏制它們的進一步擴張，需要加強國際合作，而國際社會開始嚴肅正視「國 際恐怖主義」對國際安全環境帶來的衝擊與挑戰。
第參章以「我國反恐體制的建構與運作」為主題，介紹及說明我國反恐體制成立之 背景，其次說明反恐體制之建構，從國家層級行政院，到國軍反恐任務的角色與運作，
如何在恐怖攻擊後啟動反應機制，並以反暴力的恐怖為主軸，說明在行政院及國安會運 作體制下的反恐機制。美國911 事件後國際對恐怖主義感到威脅，雖然國際恐怖主義不 是台灣安全上之最大威脅，但在美國向國際昭告之政策，已隱含表明若不與美國共同對 付恐怖主義就是美國的敵人，在這樣的背景下，建立起我國的反恐體制。
第肆章接續前一章，深入本論文主題「憲兵特勤隊執行反恐任務角色與運作」，探討 處理反暴力的專責部隊之一「憲兵特勤隊」，在該隊成立的背景下，透過歷年所執行的任 務，分析其能力、組織、裝備、訓練及身分與在我國所扮演的角色，及未來該如何加強 反恐制變能力與建立快速機動打擊之條件。
在第伍章中，將「憲兵特勤隊執行反恐任務之評估」為內容，就憲兵特勤隊在體制 層面討論任務性質，能執行反恐任務、特種作戰任務及安全警衛外，並從執行層面，探 討運作機制，是否能順利執行任務，在法規上的限制能否解決，最後了解其執行成效與 評估。
第陸章結論總結整體反恐機制與憲兵特勤隊能力，在恐怖攻擊時能發揮其能力，而 危機發生第一時間內就能立即到達現場應處，提昇國防部與國家之間反恐處置上之權責，
從中找出最適用於我國反恐指揮機制，提昇整體運作效能，俾供未來政策修定參考運用。
第貳章 國際恐怖主義的發展
國際恐怖主義趁全球化資訊快速流通之便，將極端、宗教與分離恐怖主義的概念散 播至世界各地，且攻擊目標已不再侷限於美國，例如英國、法國、西班牙、印尼、菲律 賓等國家，均遭受不同的恐怖組織攻擊，顯示反恐工作已不能由個別國家單獨執行，必 須透過國際社會共同反制。
極端恐怖組織已嚴重衝擊了地區和國際秩序，為遏制它們的進一步擴張，需要加強 國際合作。而國際社會開始嚴肅正視「國際恐怖主義」對國際安全環境帶來的衝擊與挑 戰。本章節透過文獻分析以研究與探討現行國際上恐怖主義的定義、類型與行為模式等 重要內容，並透過分析與瞭解當代恐怖活動事件的發展概況與趨勢。1