由於黑鮪魚單價高，不若一般鮪魚(黃鰭、大目、長鰭鮪)，因此以單尾拍賣 交易方式為主。黑鮪魚汛期時為，為因應黑鮪魚文化觀光季，因此一般鮪的拍賣 時間提早為清晨四時半至五點開始，黑鮪魚拍賣時間則為早上七時準時拍賣。黑
鮪魚季前一至二個禮拜起，漁會會開始公告廣播，請欲參與競標黑鮪魚的盤商至 漁會增加保證金。第一尾黑鮪魚進港之後，則正式進入黑鮪魚汛期交易時程。早 上七時起，安裝在港埠旁的天車便開始由靠港的魚船船艙釣起黑鮪魚，釣起後卸 載於岸上的兩輪推車，再由工作人員將推車推入位於大魚市場左方的黑鮪魚拍賣 區卸下魚獲，排列整齊，卸魚的同時，各盤商亦開始檢視漁獲。今年東港區漁會 對於捕獲之黑鮪及劍旗魚(俗稱：旗魚舅)有新規定，必須標上註明捕獲時間、經 緯度及編號的橙色標示環，並且在捕獲第一時間必須以無線電告知漁會，並詳細 說明捕獲地點經緯度及時間。由於黑鮪魚價格高昂，因此當漁船捕獲後，為保持 魚獲鮮度，會直接在船上先進行初步處理，即拔除魚鰓、內臟，並在鰓蓋、魚腹 塞進冰塊以保持鮮度。有時捕獲黑鮪因體積過於龐大，無法完全置入船艙中時，
會有切除尾鰭的情況，或是僅在魚腹部位做低溫保鮮處理的情況。
黑鮪魚交易與一般鮪魚相仿，在交易完成前皆不得使用任何器具取得魚肉樣 本，因此盤商只得以手檢測已剖開魚腹的厚度，並藉由剖開魚腹觀測該尾魚的油 度，以及壓按魚體檢測魚肉緊實度，觀察魚尾接尾鰭部分(通稱為「臍尾」)顏色 判定魚的新鮮度，甚至是觸摸魚腹切開處檢查手部沾油的情況來評定該尾魚的好 壞。此一同時，漁會工作人員會視漁獲多寡拉出一至三台不等的秤備用，並有專 員檢查黑鮪魚身上是否掛有橙色標示環，再確認黑鮪魚身上是否貼有漁會之編號 條碼，之後貼上代表漁船及該船捕獲數量之流水編號，登記於簿上。含有識別環、
漁會流水標、船號流水標三者的漁獲，才可在黑鮪拍賣場上公開競標。這些作業 基本上是同一時間進行，而當盤商選定黑鮪後便可向代賣人進行交涉，如兩者成 交則進行過磅登記，與一般鮪交易相同，一旦遇到數家盤商接欲購買同一尾魚，
或代賣人欲以競標方式進行，或漁獲乏人問津時，便會以競標的方式進行，而通 常第一、二種情況會先於第三種情況進行。拍賣主持人為漁會派遣之拍賣員，以 第三公信者做為拍賣裁決人，除表示公平外，也避免交易糾紛的發生。一旦開始 以競標方式拍賣，漁會工作人員會依現場漁獲數量決定拍賣方式，如數量所剩不
拖、搬魚工
去除臟器、鱗 片、鰭、頭 人員
冰塊供應商
運 輸 業
盤 商
代賣人(中間人) 臟器、鱗片、鰭、
頭 處理人員 漁獲者
(船長)
多，則以隨機方式開始競標拍賣；如數量在五至八尾以上者，則會請工作人員將 漁獲分為數列不等，再由漁會人員利用標有數字小球，放入不透明袋中，依抽出 之球號代表列序，抽出順序代表拍賣順序進行拍賣。拍員參考前次及其他地方之 鮪魚公拍價格，以及漁獲本身情況，訂出底標，底標以每公斤魚獲／底價為基準，
開始進行公拍事宜。
競標前，拍賣員會以喊聲或哨聲表示競標即將開始，拍賣員以站在魚獲前或 以單腳踩於魚體上，代表拍賣該尾漁獲，黑鮪魚競標方式與一般鮪魚約略相同，
即盤商以訂出之底價為基準進行加價，每次加價之金額以新台幣五或十元為主。
拍賣員連續喊出目前競標價格，藉由競標者以手勢、暗號、喊聲等方式示意加價 之金額，確認後由拍賣員喊出增價競標者之競標金額。以此方式重複進行，直至 不再有競標者繼續加價，則由出價者最高者得標，魚體貼上得標盤商貼紙，進行 過磅打稅後即完成交易。比較特別的是，由於黑鮪魚單價較一般鮪魚高出許多，
因此在拍賣時的情況會顯得謹慎，並且競標拍賣時間較長，有時甚至有流標情況 發生，但絕不會有賣不出去的漁獲。
所以整體情況可用下圖示意：
A
A
A A B
B
B B
B
C
(紅線，代號「A」)
由漁獲人(船東)捕獲魚獲後，交由拖、搬魚工將魚搬至魚市交易場所中就定 位，之後由代賣人(中間人)與盤商進行交易，交易完成為紅線部分。
(藍線，代號「B」)
完成交易後由盤商工作人員將交易完成之魚獲拖至各盤商之區位，接著由去 除臟器、鱗片、鰭及魚頭之人員進行(有時亦由盤商之工作人員進行；內銷分解 成小塊的魚體則都為各家盤商之工作人員進行。)，接著由冰塊供應商(絞冰)在魚 體鋪上冰塊。在上述行為之同時，盤商會檢視魚體之品質程度，分為內、外銷魚 貨。餔上冰塊後，由運輸業會同大盤工作人員將魚貨分為內、外銷進行分裝上車。
內銷無論分解成小塊與否，都需裝入保利龍箱，鋪入冰塊以保持鮮度，由小型貨 車載運至台灣各地鋪貨；外銷則放置在大型貨運車上，層層堆疊，鋪上大量冰塊，
並蓋上毯被、覆上帆布，直奔桃園中正機場進行外銷事宜。
(橘線，代號「C」)
由魚身上處理下來之臟器(腮、肚(胃)、腸、精巢、卵、其他臟器)、魚鱗、
鰭、魚頭(含魚眼)則由在市場旁專職收取這些部份的人員處理，以魚肚(胃)、精 巢(膘)、卵、魚頭、魚眼可直接販售與餐飲業者，餘下或直接做為飼料(泰國蝦養 殖)或加工做為飼料、魚粉、魚油等…。